46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PXO_02624 on replicon NC_010717
Organism: Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010717  PXO_02624  membrane protein  100 
 
 		 431 aa  840    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0069  O-antigen polymerase  66.67 
 
 		 443 aa  548  1e-155  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0083  membrane protein  67.06 
 
 		 443 aa  549  1e-155  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.735968  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3347  O-antigen polymerase  62.35 
 
 		 443 aa  495  1e-139  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1888  hypothetical protein  32.97 
 
 		 415 aa  135  9.999999999999999e-31  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2813  O-antigen polymerase  24.04 
 
 		 773 aa  66.6  0.0000000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.192356  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2638  O-antigen polymerase  32.41 
 
 		 428 aa  56.6  0.0000009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4227  O-antigen polymerase  28.46 
 
 		 457 aa  56.6  0.0000009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4286  inorganic carbon transporter  28.46 
 
 		 457 aa  56.2  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.816665  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3696  O-antigen polymerase  30.65 
 
 		 461 aa  54.7  0.000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.312837 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18850  O-antigen polymerase  25.62 
 
 		 393 aa  53.1  0.000009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1654  O-antigen polymerase  24.05 
 
 		 754 aa  51.6  0.00003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2608  O-antigen polymerase  31.71 
 
 		 432 aa  50.1  0.00008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.212106  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2821  O-antigen polymerase  34.09 
 
 		 434 aa  49.3  0.0001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3103  O-antigen polymerase  28.37 
 
 		 498 aa  49.7  0.0001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.313581  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4957  O-antigen polymerase  27.41 
 
 		 470 aa  48.9  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3951  O-antigen polymerase  27.93 
 
 		 402 aa  48.1  0.0003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2080  O-antigen polymerase  30.07 
 
 		 411 aa  47.4  0.0005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.473077  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3774  O-antigen polymerase  27.14 
 
 		 439 aa  47.4  0.0006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4864  inorganic carbon transporter  27.66 
 
 		 467 aa  47.4  0.0006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.867776  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24401  bicarbonate transporter, ICT family protein  34.45 
 
 		 436 aa  47  0.0006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3180  O-antigen polymerase  29.17 
 
 		 498 aa  47  0.0007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2375  O-antigen polymerase  26.09 
 
 		 500 aa  46.6  0.0008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3695  hypothetical protein  32.39 
 
 		 404 aa  46.6  0.001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1650  hypothetical protein  32.39 
 
 		 404 aa  46.6  0.001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.192586  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3018  O-antigen polymerase  25.08 
 
 		 446 aa  45.8  0.001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3375  O-antigen polymerase  26.98 
 
 		 432 aa  46.6  0.001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.221665  normal  0.11504 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04059  O-Antigen Polymerase family  31.55 
 
 		 425 aa  45.8  0.001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2125  O-antigen polymerase  29.83 
 
 		 425 aa  46.2  0.001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1682  hypothetical protein  32.39 
 
 		 404 aa  45.4  0.002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0822  inorganic carbon transporter  27.49 
 
 		 471 aa  45.4  0.002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.999427  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1468  secreted polysaccharide polymerase  27.78 
 
 		 404 aa  45.8  0.002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00102355  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0388  O-antigen polymerase  35.9 
 
 		 358 aa  45.1  0.002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1614  hypothetical protein  27.78 
 
 		 404 aa  45.8  0.002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.363158  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1496  hypothetical protein  27.78 
 
 		 404 aa  45.8  0.002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.285071  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0474  O-antigen polymerase  29.57 
 
 		 595 aa  45.1  0.003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0480  hypothetical protein  27.76 
 
 		 452 aa  45.1  0.003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003538  putative membrane protein of ExoQ family involved in exopolysaccharide production  35.29 
 
 		 454 aa  44.7  0.003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1208  O-antigen polymerase  30.91 
 
 		 429 aa  44.3  0.004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0923682 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2549  putative polysaccharide polymerase  30.91 
 
 		 429 aa  44.3  0.004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0287  O-antigen polymerase  22.22 
 
 		 415 aa  43.9  0.005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.509541  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0884  hypothetical protein  28.29 
 
 		 416 aa  44.3  0.005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01295  secreted polysaccharide polymerase  28.85 
 
 		 385 aa  43.9  0.006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2212  O-antigen polymerase  29.27 
 
 		 415 aa  43.9  0.006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0880149  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3351  O-antigen polymerase  28.57 
 
 		 444 aa  43.5  0.007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1088  O-antigen polymerase  24.51 
 
 		 737 aa  43.1  0.009  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>