62 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_2338 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009483  Gura_2338  O-antigen polymerase  100 
 
 		 425 aa  860    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0152  hypothetical protein  29.97 
 
 		 389 aa  129  9.000000000000001e-29  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2455  O-antigen polymerase  26.8 
 
 		 435 aa  90.1  7e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0818595  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2459  O-antigen polymerase  28.24 
 
 		 437 aa  83.2  0.000000000000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2363  hypothetical protein  24.88 
 
 		 431 aa  78.6  0.0000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1788  O-antigen polymerase  27.49 
 
 		 446 aa  73.6  0.000000000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0301  O-antigen polymerase  23.8 
 
 		 464 aa  68.9  0.0000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02223  hypothetical protein  24.62 
 
 		 461 aa  67.8  0.0000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2412  hypothetical protein  27.09 
 
 		 444 aa  65.9  0.000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0297  hypothetical protein  23.53 
 
 		 428 aa  66.2  0.000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.515931  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1955  O-antigen polymerase  25.78 
 
 		 468 aa  64.7  0.000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.324728  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0300  O-antigen polymerase  25.45 
 
 		 446 aa  63.2  0.000000009  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2530  wzy family polymerase, exosortase system type 1 associated  21.68 
 
 		 463 aa  62.8  0.00000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.42287  normal  0.0601314 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2212  O-antigen polymerase  26.63 
 
 		 415 aa  62.8  0.00000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0880149  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2960  O-antigen polymerase  25.19 
 
 		 436 aa  62  0.00000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.12688  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5004  O-antigen polymerase family protein  25.31 
 
 		 436 aa  60.8  0.00000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0677  O-antigen polymerase  26.46 
 
 		 436 aa  60.1  0.00000008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.857845  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0119  O-antigen polymerase  23.56 
 
 		 466 aa  59.3  0.0000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2018  O-antigen polymerase  25.56 
 
 		 456 aa  59.7  0.0000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1650  hypothetical protein  25.64 
 
 		 404 aa  58.2  0.0000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.192586  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1184  O-antigen polymerase  27.68 
 
 		 412 aa  57.8  0.0000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0845  hypothetical protein  27.13 
 
 		 537 aa  57.4  0.0000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.149779  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3695  hypothetical protein  25.64 
 
 		 404 aa  56.6  0.0000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1496  hypothetical protein  25 
 
 		 404 aa  55.5  0.000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.285071  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1468  secreted polysaccharide polymerase  25 
 
 		 404 aa  55.5  0.000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00102355  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1682  hypothetical protein  25 
 
 		 404 aa  55.5  0.000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1614  hypothetical protein  25 
 
 		 404 aa  55.5  0.000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.363158  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003538  putative membrane protein of ExoQ family involved in exopolysaccharide production  24.54 
 
 		 454 aa  54.7  0.000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3103  O-antigen polymerase  28.57 
 
 		 498 aa  53.9  0.000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.313581  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3579  O-antigen polymerase  23.38 
 
 		 501 aa  53.5  0.000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1639  hypothetical protein  20.53 
 
 		 447 aa  53.1  0.000009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1954  hypothetical protein  23.65 
 
 		 443 aa  53.1  0.000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2384  O-antigen polymerase  22.73 
 
 		 436 aa  51.2  0.00004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.486663  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0582  O-antigen polymerase  26.13 
 
 		 454 aa  50.4  0.00006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.814347  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0678  hypothetical protein  24.83 
 
 		 594 aa  49.7  0.00009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.206131 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01295  secreted polysaccharide polymerase  25.31 
 
 		 385 aa  49.3  0.0001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3268  wzy family polymerase, exosortase system type 1 associated  22.35 
 
 		 452 aa  49.7  0.0001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.869746  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4864  inorganic carbon transporter  27.2 
 
 		 467 aa  48.9  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.867776  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3288  O-antigen polymerase  24.33 
 
 		 594 aa  48.9  0.0002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.709506  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4567  O-antigen polymerase  30.82 
 
 		 717 aa  48.1  0.0003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.79744  normal  0.181696 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0364  O-antigen polymerase  27.15 
 
 		 428 aa  48.1  0.0003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3113  O-antigen polymerase  35.53 
 
 		 467 aa  48.1  0.0003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.000000000265772  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1973  O-antigen polymerase  26.01 
 
 		 433 aa  47.8  0.0004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.15228 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3885  O-antigen polymerase  28.07 
 
 		 443 aa  47.4  0.0005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.722344  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0508  O-antigen polymerase  29.49 
 
 		 440 aa  46.6  0.0008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4434  O-antigen polymerase  23.76 
 
 		 474 aa  46.6  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3401  polysaccharide deacetylase  25.29 
 
 		 464 aa  45.1  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.264275  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5972  O-antigen polymerase  30.77 
 
 		 592 aa  45.4  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0743128 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1511  O-antigen polymerase  25.95 
 
 		 436 aa  45.4  0.002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.995807  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2808  O-antigen polymerase  25.22 
 
 		 494 aa  44.7  0.003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0227  hypothetical protein  22.9 
 
 		 460 aa  45.1  0.003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.604472  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05350  O-antigen polymerase, Wzy protein  26.22 
 
 		 467 aa  44.3  0.004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00185086  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1474  O-antigen polymerase  25.73 
 
 		 408 aa  44.3  0.004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3094  O-antigen polymerase  23.08 
 
 		 444 aa  43.9  0.006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0980  O-antigen polymerase family protein  23.76 
 
 		 661 aa  43.9  0.006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0634  O-antigen polymerase  24.18 
 
 		 415 aa  43.1  0.008  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.60095 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1952  O-antigen polymerase  29.49 
 
 		 653 aa  43.1  0.01  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.953343  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2679  O-antigen polymerase family protein  23.76 
 
 		 595 aa  43.1  0.01  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2397  O-antigen polymerase family protein  23.76 
 
 		 595 aa  43.1  0.01  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.233574  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0817  O-antigen polymerase family protein  23.76 
 
 		 595 aa  43.1  0.01  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0010  O-antigen polymerase family protein  23.76 
 
 		 595 aa  43.1  0.01  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0279  O-antigen polymerase family protein  23.76 
 
 		 595 aa  43.1  0.01  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.297863  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>