39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_1973 on replicon NC_009428
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009428  Rsph17025_1973  O-antigen polymerase  100 
 
 		 433 aa  864    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.15228 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2549  putative polysaccharide polymerase  82.62 
 
 		 429 aa  689    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1208  O-antigen polymerase  81.9 
 
 		 429 aa  691    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0923682 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0651  O-antigen polymerase  40.51 
 
 		 428 aa  289  8e-77  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4801  O-antigen polymerase  31.27 
 
 		 440 aa  134  3.9999999999999996e-30  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.141517 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4944  O-antigen polymerase  34.95 
 
 		 434 aa  130  6e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.367217  normal  0.330229 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4530  O-antigen polymerase  32.5 
 
 		 444 aa  124  2e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5938  exopolysaccharide production protein  36.16 
 
 		 425 aa  115  1.0000000000000001e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3343  O-antigen polymerase  35.77 
 
 		 401 aa  105  2e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6232  O-antigen polymerase  27.82 
 
 		 441 aa  96.7  8e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.394036  normal  0.503415 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6427  O-antigen polymerase  26.11 
 
 		 439 aa  92.4  1e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.445902  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4842  O-antigen polymerase  23.81 
 
 		 433 aa  92  2e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000342709  normal  0.0564871 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1531  O-antigen polymerase  25.68 
 
 		 419 aa  76.3  0.000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.543111  normal  0.517094 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3696  O-antigen polymerase  29.09 
 
 		 417 aa  74.7  0.000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0487808  normal  0.621123 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3184  O-antigen polymerase  27.12 
 
 		 442 aa  72.8  0.00000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1130  O-antigen polymerase  33.6 
 
 		 438 aa  72  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1688  O-antigen polymerase  25.94 
 
 		 421 aa  71.2  0.00000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0910283  normal  0.076767 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1176  O-antigen polymerase  24.83 
 
 		 433 aa  64.3  0.000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2587  O-antigen polymerase  26.98 
 
 		 409 aa  62.8  0.00000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4237  O-antigen polymerase  29.85 
 
 		 429 aa  60.8  0.00000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.201172  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1595  O-antigen polymerase  32.76 
 
 		 467 aa  60.1  0.00000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1077  O-antigen polymerase  23.37 
 
 		 440 aa  57.8  0.0000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.7973  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0665  O-antigen polymerase  28.65 
 
 		 436 aa  53.9  0.000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.658587 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0108  exopolysaccharide production protein, putative  26.77 
 
 		 441 aa  52.4  0.00002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0892  O-antigen polymerase  21.74 
 
 		 428 aa  52  0.00002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0864328  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0388  O-antigen polymerase  28.89 
 
 		 358 aa  50.1  0.00009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4354  O-antigen polymerase  31.86 
 
 		 443 aa  48.5  0.0002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.201605  normal  0.814699 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1378  O-antigen polymerase  21.71 
 
 		 416 aa  48.1  0.0003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.486003  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4579  O-antigen polymerase  25.32 
 
 		 448 aa  48.1  0.0003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.17078 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2821  O-antigen polymerase  26.37 
 
 		 437 aa  48.1  0.0003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2875  O-antigen polymerase  29.89 
 
 		 440 aa  47.4  0.0005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.184555  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0963  O-antigen polymerase  25.93 
 
 		 460 aa  47.4  0.0006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.18005  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0257  O-antigen polymerase  30.14 
 
 		 453 aa  46.2  0.001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0304  O-antigen polymerase  28.75 
 
 		 451 aa  46.2  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1380  O-antigen polymerase  29.9 
 
 		 313 aa  45.8  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.563149  normal  0.0271558 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1691  O-antigen polymerase  27.03 
 
 		 512 aa  45.4  0.002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.121195  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0810  O-antigen polymerase  27.23 
 
 		 441 aa  45.1  0.003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.319403 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2338  O-antigen polymerase  25.79 
 
 		 425 aa  44.3  0.004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0759  O-antigen polymerase  24.51 
 
 		 430 aa  44.3  0.005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.402812  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>