55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_3288 on replicon NC_010681
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_006348  BMA0279  O-antigen polymerase family protein  63.48 
 
 		 595 aa  754    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.297863  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3288  O-antigen polymerase  100 
 
 		 594 aa  1194    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.709506  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0448  O-antigen polymerase  78.23 
 
 		 596 aa  905    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.134695  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2566  O-antigen polymerase  64.42 
 
 		 592 aa  671    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.968292  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2674  O-antigen polymerase  63.93 
 
 		 592 aa  728    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0657  O-antigen polymerase  63.56 
 
 		 593 aa  687    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0010  O-antigen polymerase family protein  63.48 
 
 		 595 aa  754    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0821  O-antigen polymerase family protein  63.48 
 
 		 595 aa  756    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0817  O-antigen polymerase family protein  63.48 
 
 		 595 aa  754    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2397  O-antigen polymerase family protein  63.48 
 
 		 595 aa  754    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.233574  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2679  O-antigen polymerase family protein  63.48 
 
 		 595 aa  754    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2645  O-antigen polymerase  63.76 
 
 		 592 aa  728    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2692  O-antigen polymerase  64.42 
 
 		 592 aa  675    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.341855  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2034  O-antigen polymerase  63.76 
 
 		 592 aa  728    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0678  hypothetical protein  92.42 
 
 		 594 aa  1092    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.206131 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0980  O-antigen polymerase family protein  63.31 
 
 		 661 aa  749    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5972  O-antigen polymerase  64.14 
 
 		 592 aa  704    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0743128 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0650  O-antigen polymerase family protein  63.65 
 
 		 595 aa  742    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0466  O-antigen polymerase  32.82 
 
 		 589 aa  254  3e-66  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.285163  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0559  hypothetical protein  33.64 
 
 		 569 aa  234  5e-60  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.261302  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0534  O-antigen polymerase  30.84 
 
 		 607 aa  220  5e-56  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.462274  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0464  O-antigen polymerase  31.4 
 
 		 590 aa  215  1.9999999999999998e-54  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.325512  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0479  O-antigen polymerase  32.49 
 
 		 578 aa  205  2e-51  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.575245  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0474  O-antigen polymerase  30.8 
 
 		 595 aa  190  7e-47  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0063  O-antigen polymerase  28.32 
 
 		 531 aa  95.1  3e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0639643 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4673  O-antigen polymerase  25.32 
 
 		 560 aa  80.9  0.00000000000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4780  O-antigen polymerase  27.12 
 
 		 594 aa  79.7  0.0000000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.793749  normal  0.179192 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5178  O-antigen polymerase  24.67 
 
 		 565 aa  79  0.0000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4678  O-antigen polymerase  25.41 
 
 		 556 aa  71.6  0.00000000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4672  O-antigen polymerase  24.81 
 
 		 503 aa  59.3  0.0000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0242  hypothetical protein  20.09 
 
 		 586 aa  58.2  0.0000005  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0427625  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4567  O-antigen polymerase  30.06 
 
 		 717 aa  55.8  0.000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.79744  normal  0.181696 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1497  O-antigen polymerase  26.57 
 
 		 672 aa  53.5  0.00001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0844  O-antigen polymerase  29.79 
 
 		 556 aa  52.8  0.00002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.153781 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3942  O-antigen polymerase  25.6 
 
 		 506 aa  52.8  0.00002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00471657 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1264  O-antigen polymerase  25.35 
 
 		 555 aa  52  0.00003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.339425  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3113  O-antigen polymerase  21.25 
 
 		 467 aa  51.2  0.00005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.000000000265772  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5249  O-antigen polymerase  26 
 
 		 671 aa  50.8  0.00008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.566036  normal  0.80633 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0069  O-antigen polymerase  26.57 
 
 		 443 aa  50.1  0.0001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2338  O-antigen polymerase  28.7 
 
 		 425 aa  48.9  0.0002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0657  O-antigen polymerase  23.58 
 
 		 588 aa  48.9  0.0003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0056678  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0489  O-antigen polymerase  27.37 
 
 		 605 aa  48.9  0.0003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.091013 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0083  membrane protein  26.09 
 
 		 443 aa  48.5  0.0004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.735968  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0152  hypothetical protein  34.41 
 
 		 389 aa  48.1  0.0004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2813  O-antigen polymerase  21.2 
 
 		 773 aa  47.4  0.0008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.192356  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2960  O-antigen polymerase  28.37 
 
 		 517 aa  46.6  0.001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  decreased coverage  0.00194737  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3726  O-antigen polymerase  26.28 
 
 		 438 aa  45.1  0.003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.114038 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4036  O-antigen polymerase  27.98 
 
 		 516 aa  45.4  0.003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1540  hypothetical protein  30.81 
 
 		 451 aa  44.7  0.004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1691  O-antigen polymerase  26.19 
 
 		 512 aa  45.1  0.004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.121195  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3018  O-antigen polymerase  32.98 
 
 		 446 aa  44.7  0.005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4268  O-antigen polymerase  29.46 
 
 		 503 aa  44.7  0.005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.209068 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0508  O-antigen polymerase  28.4 
 
 		 440 aa  44.3  0.006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1087  O-antigen polymerase  23.32 
 
 		 612 aa  43.5  0.01  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3580  O-antigen polymerase  27.86 
 
 		 504 aa  43.5  0.01  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>