70 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpe_A0063 on replicon NC_008825
Organism: Methylibium petroleiphilum PM1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008825  Mpe_A0063  O-antigen polymerase  100 
 
 
531 aa  1053    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0639643 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0489  O-antigen polymerase  45.83 
 
 
605 aa  307  3e-82  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.091013 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4672  O-antigen polymerase  33.94 
 
 
503 aa  163  6e-39  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5178  O-antigen polymerase  30.67 
 
 
565 aa  145  2e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3942  O-antigen polymerase  31.1 
 
 
506 aa  143  9e-33  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00471657 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0844  O-antigen polymerase  30.52 
 
 
556 aa  125  1e-27  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.153781 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2194  O-antigen polymerase  31.83 
 
 
582 aa  120  4.9999999999999996e-26  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.782503 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3650  O-antigen polymerase  33.25 
 
 
517 aa  107  4e-22  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.320613  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2960  O-antigen polymerase  32.1 
 
 
517 aa  107  5e-22  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  decreased coverage  0.00194737  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0534  O-antigen polymerase  30.31 
 
 
607 aa  102  1e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.462274  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0650  O-antigen polymerase family protein  28.69 
 
 
595 aa  102  2e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0817  O-antigen polymerase family protein  28.75 
 
 
595 aa  101  3e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0980  O-antigen polymerase family protein  28.54 
 
 
661 aa  101  3e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2674  O-antigen polymerase  27.92 
 
 
592 aa  100  8e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2645  O-antigen polymerase  27.92 
 
 
592 aa  100  8e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2034  O-antigen polymerase  27.92 
 
 
592 aa  100  8e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2397  O-antigen polymerase family protein  28.54 
 
 
595 aa  99.4  1e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.233574  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0279  O-antigen polymerase family protein  28.54 
 
 
595 aa  99.4  1e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.297863  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0010  O-antigen polymerase family protein  28.54 
 
 
595 aa  99.4  1e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2679  O-antigen polymerase family protein  28.54 
 
 
595 aa  99.4  1e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0821  O-antigen polymerase family protein  28.54 
 
 
595 aa  98.6  3e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0657  O-antigen polymerase  29.81 
 
 
593 aa  96.7  9e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4673  O-antigen polymerase  29.9 
 
 
560 aa  96.7  1e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0466  O-antigen polymerase  35.14 
 
 
589 aa  96.7  1e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.285163  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3288  O-antigen polymerase  28.32 
 
 
594 aa  94.7  3e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.709506  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4036  O-antigen polymerase  32.56 
 
 
516 aa  94.4  5e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0678  hypothetical protein  30.59 
 
 
594 aa  92.4  2e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.206131 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4780  O-antigen polymerase  29.75 
 
 
594 aa  90.1  8e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.793749  normal  0.179192 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5972  O-antigen polymerase  26.46 
 
 
592 aa  89.4  2e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0743128 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2692  O-antigen polymerase  28.88 
 
 
592 aa  86.7  9e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.341855  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2566  O-antigen polymerase  28.23 
 
 
592 aa  81.3  0.00000000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.968292  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0464  O-antigen polymerase  27.25 
 
 
590 aa  80.5  0.00000000000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.325512  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0474  O-antigen polymerase  31.35 
 
 
595 aa  79  0.0000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0559  hypothetical protein  32.52 
 
 
569 aa  75.5  0.000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.261302  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0448  O-antigen polymerase  26.46 
 
 
596 aa  73.2  0.00000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.134695  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1264  O-antigen polymerase  30.18 
 
 
555 aa  68.2  0.0000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.339425  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4678  O-antigen polymerase  25.68 
 
 
556 aa  64.7  0.000000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0479  O-antigen polymerase  28.21 
 
 
578 aa  63.9  0.000000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.575245  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2813  O-antigen polymerase  20.83 
 
 
773 aa  58.5  0.0000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.192356  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6500  O-antigen polymerase  31.68 
 
 
794 aa  57.8  0.0000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1077  O-antigen polymerase  27.63 
 
 
433 aa  57  0.0000008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.9264  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0456  hypothetical protein  29.45 
 
 
438 aa  55.8  0.000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2811  hypothetical protein  27.27 
 
 
597 aa  55.1  0.000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03709  hypothetical protein  24.93 
 
 
594 aa  55.1  0.000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1654  O-antigen polymerase  27.68 
 
 
754 aa  55.1  0.000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4213  O-antigen polymerase  35.56 
 
 
430 aa  55.1  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.144935  normal  0.568033 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0242  hypothetical protein  24.19 
 
 
586 aa  54.3  0.000005  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0427625  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2212  O-antigen polymerase  25.36 
 
 
415 aa  53.9  0.000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0880149  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1764  O-antigen polymerase  29.76 
 
 
560 aa  50.1  0.00009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002359  lipid A core-O-antigen ligase  26.25 
 
 
561 aa  50.1  0.0001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1388  O-antigen polymerase  26.87 
 
 
452 aa  49.3  0.0002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0134  hypothetical protein  28.82 
 
 
435 aa  49.3  0.0002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.74095  normal  0.279508 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_30011  hypothetical protein  37.66 
 
 
437 aa  48.5  0.0003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.562127 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0765  O-antigen polymerase  36.26 
 
 
442 aa  48.1  0.0004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4678  O-antigen polymerase  30.23 
 
 
544 aa  47  0.0009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_18371  hypothetical protein  35.21 
 
 
443 aa  46.2  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1297  hypothetical protein  27.84 
 
 
444 aa  47  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.289978  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3781  O-antigen polymerase  26.24 
 
 
477 aa  47  0.001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1314  O-antigen polymerase  26.13 
 
 
418 aa  45.4  0.002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.963126 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1285  O-antigen polymerase  26.58 
 
 
418 aa  45.8  0.002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3597  O-antigen polymerase  30.58 
 
 
438 aa  45.1  0.003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.312058 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2712  O-antigen polymerase  30.59 
 
 
413 aa  45.1  0.003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0646679  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1940  O-antigen polymerase  33.7 
 
 
453 aa  45.4  0.003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1908  O-antigen polymerase  30.43 
 
 
472 aa  45.1  0.003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1691  O-antigen polymerase  34.48 
 
 
512 aa  44.7  0.004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.121195  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3951  O-antigen polymerase  27.14 
 
 
402 aa  44.3  0.005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2299  hypothetical protein  32.93 
 
 
424 aa  44.7  0.005  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.590409  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4985  O-antigen polymerase  39.39 
 
 
391 aa  44.7  0.005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2638  O-antigen polymerase  21.47 
 
 
428 aa  43.9  0.007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0559  O-antigen polymerase  30.49 
 
 
647 aa  43.5  0.009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.024189  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>