47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aave_0844 on replicon NC_008752
Organism: Acidovorax citrulli AAC00-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008752  Aave_0844  O-antigen polymerase  100 
 
 		 556 aa  1081    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.153781 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3650  O-antigen polymerase  53.85 
 
 		 517 aa  433  1e-120  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.320613  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2960  O-antigen polymerase  53.83 
 
 		 517 aa  431  1e-119  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  decreased coverage  0.00194737  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2194  O-antigen polymerase  47.12 
 
 		 582 aa  412  1e-114  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.782503 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3942  O-antigen polymerase  42.45 
 
 		 506 aa  343  4e-93  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00471657 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4672  O-antigen polymerase  45.47 
 
 		 503 aa  323  4e-87  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5178  O-antigen polymerase  41.56 
 
 		 565 aa  292  1e-77  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4036  O-antigen polymerase  45.94 
 
 		 516 aa  286  5.999999999999999e-76  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0063  O-antigen polymerase  31.59 
 
 		 531 aa  134  5e-30  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0639643 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0489  O-antigen polymerase  35.81 
 
 		 605 aa  84  0.000000000000007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.091013 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0464  O-antigen polymerase  27.49 
 
 		 590 aa  81.6  0.00000000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.325512  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0479  O-antigen polymerase  26.14 
 
 		 578 aa  70.5  0.00000000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.575245  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4673  O-antigen polymerase  28.48 
 
 		 560 aa  68.6  0.0000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0657  O-antigen polymerase  28.72 
 
 		 593 aa  67.8  0.0000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0466  O-antigen polymerase  26.86 
 
 		 589 aa  67.8  0.0000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.285163  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2674  O-antigen polymerase  26.42 
 
 		 592 aa  67.4  0.0000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0534  O-antigen polymerase  28.02 
 
 		 607 aa  67.4  0.0000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.462274  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2034  O-antigen polymerase  26.42 
 
 		 592 aa  67.4  0.0000000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2645  O-antigen polymerase  26.42 
 
 		 592 aa  67.4  0.0000000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0559  hypothetical protein  25.37 
 
 		 569 aa  65.9  0.000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.261302  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4780  O-antigen polymerase  28.9 
 
 		 594 aa  61.6  0.00000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.793749  normal  0.179192 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2692  O-antigen polymerase  27.08 
 
 		 592 aa  61.2  0.00000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.341855  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5972  O-antigen polymerase  27.01 
 
 		 592 aa  60.1  0.00000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0743128 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0821  O-antigen polymerase family protein  25.77 
 
 		 595 aa  58.9  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0650  O-antigen polymerase family protein  25.68 
 
 		 595 aa  59.3  0.0000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2566  O-antigen polymerase  27.27 
 
 		 592 aa  58.9  0.0000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.968292  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0010  O-antigen polymerase family protein  25.77 
 
 		 595 aa  58.2  0.0000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0279  O-antigen polymerase family protein  25.77 
 
 		 595 aa  58.2  0.0000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.297863  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2397  O-antigen polymerase family protein  25.77 
 
 		 595 aa  58.2  0.0000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.233574  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2679  O-antigen polymerase family protein  25.77 
 
 		 595 aa  58.2  0.0000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0980  O-antigen polymerase family protein  26.11 
 
 		 661 aa  57.8  0.0000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4110  O-antigen polymerase  24.01 
 
 		 930 aa  57.4  0.0000007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0817  O-antigen polymerase family protein  25.52 
 
 		 595 aa  57  0.000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3288  O-antigen polymerase  26.41 
 
 		 594 aa  54.3  0.000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.709506  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0474  O-antigen polymerase  28.29 
 
 		 595 aa  53.9  0.000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0678  hypothetical protein  29.82 
 
 		 594 aa  53.5  0.00001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.206131 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2811  hypothetical protein  24.04 
 
 		 597 aa  53.1  0.00001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4678  O-antigen polymerase  26.47 
 
 		 556 aa  48.5  0.0004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_30011  hypothetical protein  35.58 
 
 		 437 aa  47  0.0008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.562127 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03709  hypothetical protein  24.83 
 
 		 594 aa  47  0.0009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1077  O-antigen polymerase  22.95 
 
 		 433 aa  46.6  0.001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.9264  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1691  O-antigen polymerase  32.37 
 
 		 512 aa  46.6  0.001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.121195  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1264  O-antigen polymerase  33 
 
 		 555 aa  45.4  0.003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.339425  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1654  O-antigen polymerase  27.27 
 
 		 754 aa  45.1  0.004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0242  hypothetical protein  22.68 
 
 		 586 aa  44.7  0.004  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0427625  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4678  O-antigen polymerase  26.36 
 
 		 544 aa  44.3  0.006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0274  O-antigen polymerase  24.54 
 
 		 444 aa  43.5  0.009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>