31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9303_30011 on replicon NC_008820
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9303



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008820  P9303_30011  hypothetical protein  100 
 
 
437 aa  845    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.562127 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21831  hypothetical protein  52.09 
 
 
439 aa  475  1e-133  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.285408 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_18371  hypothetical protein  57.88 
 
 
443 aa  469  1.0000000000000001e-131  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1310  hypothetical protein  51.77 
 
 
439 aa  465  9.999999999999999e-131  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2299  hypothetical protein  54.39 
 
 
424 aa  406  1.0000000000000001e-112  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.590409  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2670  hypothetical protein  55.53 
 
 
425 aa  392  1e-108  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.131305  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_13891  hypothetical protein  32.13 
 
 
416 aa  221  3e-56  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_13971  hypothetical protein  27.91 
 
 
422 aa  179  1e-43  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1297  hypothetical protein  28.28 
 
 
444 aa  170  4e-41  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.289978  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3597  O-antigen polymerase  31.33 
 
 
438 aa  154  4e-36  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.312058 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3351  O-antigen polymerase  28.76 
 
 
444 aa  153  5e-36  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4577  O-antigen polymerase  28.39 
 
 
480 aa  141  1.9999999999999998e-32  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1314  O-antigen polymerase  31.47 
 
 
418 aa  129  1.0000000000000001e-28  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.963126 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1285  O-antigen polymerase  31.24 
 
 
418 aa  125  2e-27  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0134  hypothetical protein  30.21 
 
 
435 aa  121  3e-26  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.74095  normal  0.279508 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0765  O-antigen polymerase  29.01 
 
 
442 aa  107  3e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24401  bicarbonate transporter, ICT family protein  29.01 
 
 
436 aa  59.7  0.00000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4672  O-antigen polymerase  42.05 
 
 
503 aa  56.2  0.000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0279  bicarbonate transporter  32.68 
 
 
438 aa  54.3  0.000004  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4036  O-antigen polymerase  41.98 
 
 
516 aa  50.8  0.00004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3942  O-antigen polymerase  36.72 
 
 
506 aa  50.4  0.00006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00471657 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4213  O-antigen polymerase  28.57 
 
 
430 aa  49.3  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.144935  normal  0.568033 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2194  O-antigen polymerase  38.3 
 
 
582 aa  48.5  0.0002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.782503 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0063  O-antigen polymerase  37.66 
 
 
531 aa  48.9  0.0002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0639643 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1029  putative O-antigen polymerase, putative membrane protein  27.61 
 
 
455 aa  47.8  0.0004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.384191  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2065  bicarbonate transporter  28.1 
 
 
438 aa  47.4  0.0005  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0844  O-antigen polymerase  33.33 
 
 
556 aa  47.4  0.0006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.153781 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5178  O-antigen polymerase  36.89 
 
 
565 aa  47  0.0007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3650  O-antigen polymerase  35.37 
 
 
517 aa  45.4  0.002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.320613  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2960  O-antigen polymerase  35.37 
 
 
517 aa  45.4  0.002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  decreased coverage  0.00194737  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1388  O-antigen polymerase  24.58 
 
 
452 aa  43.9  0.005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>