29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene A9601_13891 on replicon NC_008816
Organism: Prochlorococcus marinus str. AS9601



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008816  A9601_13891  hypothetical protein  100 
 
 
416 aa  815    Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_13971  hypothetical protein  38.44 
 
 
422 aa  246  4e-64  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_18371  hypothetical protein  34.22 
 
 
443 aa  221  9.999999999999999e-57  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21831  hypothetical protein  34.14 
 
 
439 aa  207  4e-52  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.285408 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_30011  hypothetical protein  32.13 
 
 
437 aa  201  1.9999999999999998e-50  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.562127 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1310  hypothetical protein  32.07 
 
 
439 aa  193  4e-48  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2299  hypothetical protein  28.26 
 
 
424 aa  184  2.0000000000000003e-45  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.590409  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2670  hypothetical protein  29.31 
 
 
425 aa  178  1e-43  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.131305  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1297  hypothetical protein  33.01 
 
 
444 aa  172  1e-41  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.289978  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3597  O-antigen polymerase  23.57 
 
 
438 aa  96.3  1e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.312058 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3351  O-antigen polymerase  23.57 
 
 
444 aa  84.7  0.000000000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1285  O-antigen polymerase  26.18 
 
 
418 aa  76.3  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1314  O-antigen polymerase  26.18 
 
 
418 aa  74.3  0.000000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.963126 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0765  O-antigen polymerase  24.86 
 
 
442 aa  67.8  0.0000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4577  O-antigen polymerase  27.63 
 
 
480 aa  67.4  0.0000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0134  hypothetical protein  24.93 
 
 
435 aa  65.5  0.000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.74095  normal  0.279508 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2384  O-antigen polymerase  21.81 
 
 
436 aa  52.8  0.00001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.486663  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1077  O-antigen polymerase  27.78 
 
 
433 aa  49.7  0.0001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.9264  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2960  O-antigen polymerase  29.61 
 
 
436 aa  48.5  0.0002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.12688  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1654  O-antigen polymerase  29.17 
 
 
754 aa  47  0.0006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1954  hypothetical protein  25.96 
 
 
443 aa  47  0.0007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4213  O-antigen polymerase  25.37 
 
 
430 aa  45.8  0.001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.144935  normal  0.568033 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02473  O-antigen polymerase  24.28 
 
 
470 aa  45.8  0.002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3781  O-antigen polymerase  29.63 
 
 
477 aa  44.7  0.003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03952  ABC multidrug transporter (Eurofung)  24.06 
 
 
1478 aa  44.7  0.003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.833442 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1691  O-antigen polymerase  30.77 
 
 
512 aa  43.5  0.006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.121195  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1253  O-antigen polymerase  23.11 
 
 
832 aa  43.5  0.008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0517425 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1186  Tetratricopeptide domain protein  24.03 
 
 
829 aa  43.1  0.008  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0301041  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0063  O-antigen polymerase  34.18 
 
 
531 aa  43.1  0.01  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0639643 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>