25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Synpcc7942_0134 on replicon NC_007604
Organism: Synechococcus elongatus PCC 7942



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007604  Synpcc7942_0134  hypothetical protein  100 
 
 		 435 aa  843    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.74095  normal  0.279508 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3351  O-antigen polymerase  36.08 
 
 		 444 aa  221  1.9999999999999999e-56  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3597  O-antigen polymerase  35.98 
 
 		 438 aa  215  1.9999999999999998e-54  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.312058 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4577  O-antigen polymerase  32.39 
 
 		 480 aa  200  5e-50  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1314  O-antigen polymerase  34.88 
 
 		 418 aa  190  4e-47  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.963126 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1285  O-antigen polymerase  34.71 
 
 		 418 aa  187  3e-46  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0765  O-antigen polymerase  34 
 
 		 442 aa  174  1.9999999999999998e-42  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2299  hypothetical protein  32.22 
 
 		 424 aa  126  7e-28  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.590409  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21831  hypothetical protein  28.74 
 
 		 439 aa  125  1e-27  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.285408 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1310  hypothetical protein  27.82 
 
 		 439 aa  123  5e-27  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_30011  hypothetical protein  29.72 
 
 		 437 aa  122  9e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.562127 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_18371  hypothetical protein  27.8 
 
 		 443 aa  117  3e-25  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2670  hypothetical protein  29.98 
 
 		 425 aa  107  4e-22  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.131305  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4213  O-antigen polymerase  28.75 
 
 		 430 aa  89  2e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.144935  normal  0.568033 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_13891  hypothetical protein  23.68 
 
 		 416 aa  71.2  0.00000000003  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0142  O-antigen polymerase  28.4 
 
 		 496 aa  58.5  0.0000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0300218 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1297  hypothetical protein  22.49 
 
 		 444 aa  54.7  0.000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.289978  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0063  O-antigen polymerase  28.82 
 
 		 531 aa  48.9  0.0002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0639643 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_13971  hypothetical protein  22.27 
 
 		 422 aa  47.8  0.0004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0559  hypothetical protein  28.93 
 
 		 569 aa  47.8  0.0004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.261302  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4678  O-antigen polymerase  36.26 
 
 		 544 aa  47.4  0.0005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0464  O-antigen polymerase  28.68 
 
 		 590 aa  46.2  0.001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.325512  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3018  O-antigen polymerase  23.79 
 
 		 446 aa  44.7  0.003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2478  O-antigen polymerase  27.39 
 
 		 415 aa  43.9  0.005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3580  O-antigen polymerase  25.52 
 
 		 504 aa  43.5  0.007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>