30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_3597 on replicon NC_007413
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007413  Ava_3597  O-antigen polymerase  100 
 
 		 438 aa  876    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.312058 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3351  O-antigen polymerase  60.46 
 
 		 444 aa  535  1e-151  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4577  O-antigen polymerase  43.87 
 
 		 480 aa  362  5.0000000000000005e-99  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0765  O-antigen polymerase  44.88 
 
 		 442 aa  338  9.999999999999999e-92  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1285  O-antigen polymerase  41.73 
 
 		 418 aa  298  1e-79  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1314  O-antigen polymerase  41.25 
 
 		 418 aa  293  4e-78  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.963126 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0134  hypothetical protein  35.68 
 
 		 435 aa  205  1e-51  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.74095  normal  0.279508 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21831  hypothetical protein  31.4 
 
 		 439 aa  192  7e-48  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.285408 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1310  hypothetical protein  31.64 
 
 		 439 aa  184  2.0000000000000003e-45  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_30011  hypothetical protein  30.89 
 
 		 437 aa  152  1e-35  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.562127 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_18371  hypothetical protein  30.16 
 
 		 443 aa  152  1e-35  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2299  hypothetical protein  31.48 
 
 		 424 aa  143  7e-33  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.590409  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2670  hypothetical protein  28.95 
 
 		 425 aa  123  7e-27  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.131305  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_13891  hypothetical protein  23.7 
 
 		 416 aa  98.2  3e-19  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4213  O-antigen polymerase  37.68 
 
 		 430 aa  97.4  4e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.144935  normal  0.568033 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_13971  hypothetical protein  20.47 
 
 		 422 aa  79.3  0.0000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1297  hypothetical protein  21.97 
 
 		 444 aa  53.5  0.000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.289978  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0142  O-antigen polymerase  26.36 
 
 		 496 aa  51.6  0.00003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0300218 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1691  O-antigen polymerase  24.11 
 
 		 512 aa  48.9  0.0002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.121195  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1388  O-antigen polymerase  23.68 
 
 		 452 aa  48.5  0.0003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3018  O-antigen polymerase  32.95 
 
 		 446 aa  48.1  0.0003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2896  O-antigen polymerase family protein  25.19 
 
 		 686 aa  46.2  0.001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2516  O-antigen polymerase  25.19 
 
 		 686 aa  46.2  0.001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.549504  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0456  hypothetical protein  22.54 
 
 		 438 aa  46.2  0.001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3375  O-antigen polymerase  22.57 
 
 		 432 aa  45.8  0.002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.221665  normal  0.11504 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3077  O-antigen polymerase  24.06 
 
 		 504 aa  44.7  0.003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0063  O-antigen polymerase  30.58 
 
 		 531 aa  45.1  0.003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0639643 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1474  O-antigen polymerase  25.22 
 
 		 408 aa  43.9  0.005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3951  O-antigen polymerase  27.84 
 
 		 402 aa  43.9  0.006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5389  O-antigen polymerase (wzy)  32.47 
 
 		 405 aa  43.9  0.006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.933006  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>