32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd1591_3951 on replicon NC_012912
Organism: Dickeya zeae Ech1591



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012912  Dd1591_3951  O-antigen polymerase  100 
 
 		 402 aa  817    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0168  O-antigen polymerase  70.5 
 
 		 400 aa  569  1e-161  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4286  inorganic carbon transporter  26.32 
 
 		 457 aa  52  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.816665  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0083  membrane protein  28.07 
 
 		 443 aa  52  0.00002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.735968  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4227  O-antigen polymerase  25.88 
 
 		 457 aa  50.8  0.00004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0069  O-antigen polymerase  27.22 
 
 		 443 aa  50.8  0.00004  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4957  O-antigen polymerase  28.7 
 
 		 470 aa  50.4  0.00005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2065  bicarbonate transporter  29.63 
 
 		 438 aa  49.7  0.0001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3774  O-antigen polymerase  23.57 
 
 		 439 aa  47.4  0.0004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3696  O-antigen polymerase  25.49 
 
 		 461 aa  46.6  0.0008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.312837 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4116  O-antigen polymerase  27.08 
 
 		 540 aa  46.6  0.0009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0014553  hitchhiker  0.00000561153 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0333  O-antigen polymerase  23.5 
 
 		 416 aa  46.6  0.0009  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0508  O-antigen polymerase  27.68 
 
 		 440 aa  46.2  0.001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2813  O-antigen polymerase  33.73 
 
 		 773 aa  46.2  0.001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.192356  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0117  hypothetical protein  25.1 
 
 		 412 aa  46.2  0.001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.706164  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0122  hypothetical protein  25.1 
 
 		 412 aa  46.2  0.001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2712  O-antigen polymerase  22.51 
 
 		 413 aa  46.2  0.001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0646679  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1374  O-antigen polymerase  27.27 
 
 		 426 aa  45.8  0.001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.247054  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2461  O-antigen polymerase  26.97 
 
 		 580 aa  45.4  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.913597  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02624  membrane protein  30 
 
 		 431 aa  45.1  0.002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1654  O-antigen polymerase  28 
 
 		 754 aa  45.1  0.002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1940  O-antigen polymerase  36.19 
 
 		 453 aa  44.7  0.003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1404  hypothetical protein  31.51 
 
 		 448 aa  45.1  0.003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.709 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0063  O-antigen polymerase  26.63 
 
 		 531 aa  44.3  0.004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0639643 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3597  O-antigen polymerase  27.84 
 
 		 438 aa  43.9  0.005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.312058 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1314  O-antigen polymerase  32.91 
 
 		 418 aa  43.9  0.005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.963126 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3401  polysaccharide deacetylase  29.63 
 
 		 464 aa  43.9  0.005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.264275  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1285  O-antigen polymerase  32.91 
 
 		 418 aa  43.9  0.005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4567  O-antigen polymerase  26.55 
 
 		 717 aa  43.9  0.005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.79744  normal  0.181696 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4808  O-antigen polymerase  23.44 
 
 		 391 aa  43.1  0.008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2638  O-antigen polymerase  28.37 
 
 		 428 aa  43.1  0.009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6500  O-antigen polymerase  28.92 
 
 		 794 aa  42.7  0.01  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>