43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC8801_1285 on replicon NC_011726
Organism: Cyanothece sp. PCC 8801



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011726  PCC8801_1285  O-antigen polymerase  100 
 
 
418 aa  829    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1314  O-antigen polymerase  99.28 
 
 
418 aa  822    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.963126 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0765  O-antigen polymerase  48.54 
 
 
442 aa  339  4e-92  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4577  O-antigen polymerase  39.52 
 
 
480 aa  296  6e-79  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3597  O-antigen polymerase  41.73 
 
 
438 aa  295  7e-79  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.312058 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3351  O-antigen polymerase  38.94 
 
 
444 aa  281  2e-74  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0134  hypothetical protein  35.43 
 
 
435 aa  172  1e-41  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.74095  normal  0.279508 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21831  hypothetical protein  28.74 
 
 
439 aa  127  5e-28  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.285408 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1310  hypothetical protein  27.74 
 
 
439 aa  121  3e-26  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_30011  hypothetical protein  31.4 
 
 
437 aa  108  2e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.562127 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_18371  hypothetical protein  28.84 
 
 
443 aa  106  8e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2299  hypothetical protein  28.37 
 
 
424 aa  103  5e-21  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.590409  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4213  O-antigen polymerase  35.16 
 
 
430 aa  93.2  8e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.144935  normal  0.568033 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2670  hypothetical protein  27.25 
 
 
425 aa  92  2e-17  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.131305  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_13891  hypothetical protein  24.23 
 
 
416 aa  64.3  0.000000004  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1297  hypothetical protein  25.33 
 
 
444 aa  53.1  0.000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.289978  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0287  O-antigen polymerase  26.59 
 
 
415 aa  52  0.00002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.509541  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2960  O-antigen polymerase  35.44 
 
 
517 aa  51.2  0.00003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  decreased coverage  0.00194737  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2065  bicarbonate transporter  30.6 
 
 
438 aa  51.2  0.00003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3650  O-antigen polymerase  35.44 
 
 
517 aa  51.2  0.00004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.320613  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1276  O-antigen polymerase  32.95 
 
 
420 aa  49.7  0.00009  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.0000000289141  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3695  hypothetical protein  31.46 
 
 
404 aa  49.3  0.0001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1650  hypothetical protein  31.46 
 
 
404 aa  49.7  0.0001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.192586  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1682  hypothetical protein  31.82 
 
 
404 aa  47.4  0.0005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1468  secreted polysaccharide polymerase  31.82 
 
 
404 aa  47  0.0006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00102355  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1496  hypothetical protein  31.82 
 
 
404 aa  47  0.0006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.285071  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0480  hypothetical protein  29.13 
 
 
452 aa  47  0.0006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1614  hypothetical protein  31.82 
 
 
404 aa  47  0.0006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.363158  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2478  O-antigen polymerase  29.41 
 
 
415 aa  47  0.0006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4434  O-antigen polymerase  32.05 
 
 
474 aa  46.6  0.0008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2194  O-antigen polymerase  32.63 
 
 
582 aa  46.6  0.0009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.782503 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4268  O-antigen polymerase  26.03 
 
 
503 aa  45.8  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.209068 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0142  O-antigen polymerase  29.13 
 
 
496 aa  45.4  0.002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0300218 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0559  O-antigen polymerase  34.21 
 
 
647 aa  45.4  0.002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.024189  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0063  O-antigen polymerase  26.58 
 
 
531 aa  45.1  0.002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0639643 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2811  hypothetical protein  24.67 
 
 
597 aa  43.9  0.005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3951  O-antigen polymerase  32.91 
 
 
402 aa  43.9  0.005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2384  O-antigen polymerase  24.68 
 
 
436 aa  43.9  0.005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.486663  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2530  wzy family polymerase, exosortase system type 1 associated  26.22 
 
 
463 aa  43.9  0.005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.42287  normal  0.0601314 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3103  O-antigen polymerase  27.81 
 
 
498 aa  43.9  0.006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.313581  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2750  O-antigen polymerase  34.57 
 
 
489 aa  43.5  0.007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.205692 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3078  O-antigen polymerase  20.89 
 
 
500 aa  43.5  0.007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2608  O-antigen polymerase  29.85 
 
 
432 aa  43.1  0.008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.212106  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>