35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VC0395_A2811 on replicon NC_009457
Organism: Vibrio cholerae O395



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013456  VEA_002359  lipid A core-O-antigen ligase  65.78 
 
 		 561 aa  793    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2811  hypothetical protein  100 
 
 		 597 aa  1221    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03709  hypothetical protein  65.66 
 
 		 594 aa  806    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0446  O-antigen polymerase  51.97 
 
 		 585 aa  628  1e-179  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0368  O-antigen polymerase  36.61 
 
 		 579 aa  317  4e-85  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0423  O-antigen polymerase  30.48 
 
 		 557 aa  233  1e-59  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.955955  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4678  O-antigen polymerase  34.05 
 
 		 544 aa  194  3e-48  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4715  O-antigen polymerase  30.7 
 
 		 545 aa  180  7e-44  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.408363  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0410  O-antigen polymerase  26.97 
 
 		 552 aa  135  3e-30  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4780  O-antigen polymerase  28.17 
 
 		 594 aa  70.9  0.00000000006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.793749  normal  0.179192 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4673  O-antigen polymerase  28.08 
 
 		 560 aa  63.9  0.000000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3942  O-antigen polymerase  26.3 
 
 		 506 aa  58.2  0.0000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00471657 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2461  O-antigen polymerase  24.05 
 
 		 580 aa  57.4  0.0000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.913597  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5178  O-antigen polymerase  25.99 
 
 		 565 aa  55.1  0.000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0063  O-antigen polymerase  27.27 
 
 		 531 aa  55.1  0.000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0639643 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0456  hypothetical protein  23.66 
 
 		 438 aa  50.4  0.00009  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1264  O-antigen polymerase  26.22 
 
 		 555 aa  49.7  0.0001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.339425  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2194  O-antigen polymerase  25.4 
 
 		 582 aa  48.1  0.0004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.782503 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0817  O-antigen polymerase family protein  24.3 
 
 		 595 aa  47.8  0.0005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0821  O-antigen polymerase family protein  24.3 
 
 		 595 aa  48.1  0.0005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3650  O-antigen polymerase  22.54 
 
 		 517 aa  47.8  0.0005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.320613  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0010  O-antigen polymerase family protein  24.3 
 
 		 595 aa  47.8  0.0007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0279  O-antigen polymerase family protein  24.3 
 
 		 595 aa  47.8  0.0007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.297863  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2397  O-antigen polymerase family protein  24.3 
 
 		 595 aa  47.8  0.0007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.233574  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2679  O-antigen polymerase family protein  24.3 
 
 		 595 aa  47.8  0.0007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0980  O-antigen polymerase family protein  24.49 
 
 		 661 aa  47.4  0.0008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1388  O-antigen polymerase  23.1 
 
 		 452 aa  46.6  0.001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0844  O-antigen polymerase  23.08 
 
 		 556 aa  45.8  0.002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.153781 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0650  O-antigen polymerase family protein  24.37 
 
 		 595 aa  45.4  0.003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0287  O-antigen polymerase  26.15 
 
 		 415 aa  45.1  0.004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.509541  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1285  O-antigen polymerase  24.67 
 
 		 418 aa  44.3  0.006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1584  O-antigen polymerase  27.17 
 
 		 463 aa  44.3  0.006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.791545  normal  0.565949 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2960  O-antigen polymerase  21.9 
 
 		 517 aa  44.3  0.007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  decreased coverage  0.00194737  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1314  O-antigen polymerase  24.67 
 
 		 418 aa  44.3  0.007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.963126 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4213  O-antigen polymerase  30.07 
 
 		 430 aa  43.9  0.009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.144935  normal  0.568033 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>