28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VEA_002359 on replicon NC_013456
Organism: Vibrio sp. Ex25



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009783  VIBHAR_03709  hypothetical protein  91.58 
 
 		 594 aa  1060    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002359  lipid A core-O-antigen ligase  100 
 
 		 561 aa  1142    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2811  hypothetical protein  65.78 
 
 		 597 aa  793    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0446  O-antigen polymerase  56.8 
 
 		 585 aa  627  1e-178  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0368  O-antigen polymerase  35.69 
 
 		 579 aa  299  7e-80  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0423  O-antigen polymerase  27.51 
 
 		 557 aa  194  3e-48  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.955955  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4678  O-antigen polymerase  31.93 
 
 		 544 aa  184  5.0000000000000004e-45  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4715  O-antigen polymerase  30.94 
 
 		 545 aa  178  3e-43  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.408363  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0410  O-antigen polymerase  27.04 
 
 		 552 aa  138  2e-31  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4780  O-antigen polymerase  29.86 
 
 		 594 aa  74.7  0.000000000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.793749  normal  0.179192 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4673  O-antigen polymerase  25.52 
 
 		 560 aa  65.9  0.000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3942  O-antigen polymerase  24.43 
 
 		 506 aa  52.8  0.00002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00471657 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2461  O-antigen polymerase  24.92 
 
 		 580 aa  52.8  0.00002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.913597  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0464  O-antigen polymerase  25.26 
 
 		 590 aa  50.4  0.00008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.325512  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0063  O-antigen polymerase  26.25 
 
 		 531 aa  50.1  0.0001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0639643 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0257  O-antigen polymerase  27.18 
 
 		 419 aa  49.7  0.0001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1388  O-antigen polymerase  26.63 
 
 		 452 aa  48.5  0.0003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1088  O-antigen polymerase  25.63 
 
 		 737 aa  47.8  0.0005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0534  O-antigen polymerase  23.84 
 
 		 607 aa  47.4  0.0006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.462274  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2075  O-antigen polymerase  25.94 
 
 		 432 aa  47  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.123759  normal  0.0828112 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0456  hypothetical protein  26.56 
 
 		 438 aa  46.2  0.002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5178  O-antigen polymerase  22.64 
 
 		 565 aa  46.2  0.002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2034  O-antigen polymerase  27.06 
 
 		 592 aa  43.9  0.007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2645  O-antigen polymerase  27.06 
 
 		 592 aa  43.9  0.007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4672  O-antigen polymerase  23.97 
 
 		 503 aa  43.9  0.008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4213  O-antigen polymerase  26.63 
 
 		 430 aa  43.9  0.008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.144935  normal  0.568033 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2674  O-antigen polymerase  27.06 
 
 		 592 aa  43.5  0.009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0466  O-antigen polymerase  25.08 
 
 		 589 aa  43.5  0.01  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.285163  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>