45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_4673 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007948  Bpro_4673  O-antigen polymerase  100 
 
 		 560 aa  1125    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4780  O-antigen polymerase  58.16 
 
 		 594 aa  616  1e-175  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.793749  normal  0.179192 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1264  O-antigen polymerase  34.82 
 
 		 555 aa  241  2e-62  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.339425  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4678  O-antigen polymerase  31.06 
 
 		 556 aa  212  1e-53  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0464  O-antigen polymerase  28.21 
 
 		 590 aa  97.4  6e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.325512  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3942  O-antigen polymerase  32.4 
 
 		 506 aa  97.1  8e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00471657 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0063  O-antigen polymerase  29.9 
 
 		 531 aa  96.3  1e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0639643 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4672  O-antigen polymerase  29.51 
 
 		 503 aa  96.7  1e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0534  O-antigen polymerase  26.64 
 
 		 607 aa  95.5  2e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.462274  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5178  O-antigen polymerase  28.43 
 
 		 565 aa  89.7  1e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2034  O-antigen polymerase  25.49 
 
 		 592 aa  88.6  3e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2645  O-antigen polymerase  25.49 
 
 		 592 aa  88.6  3e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2674  O-antigen polymerase  24.8 
 
 		 592 aa  88.6  3e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0657  O-antigen polymerase  25.37 
 
 		 593 aa  87.4  7e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0821  O-antigen polymerase family protein  26.73 
 
 		 595 aa  85.5  0.000000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0980  O-antigen polymerase family protein  26.29 
 
 		 661 aa  84.3  0.000000000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0817  O-antigen polymerase family protein  26.49 
 
 		 595 aa  83.6  0.000000000000009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2679  O-antigen polymerase family protein  26.49 
 
 		 595 aa  83.6  0.00000000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0010  O-antigen polymerase family protein  26.49 
 
 		 595 aa  83.6  0.00000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2397  O-antigen polymerase family protein  26.49 
 
 		 595 aa  83.6  0.00000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.233574  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5972  O-antigen polymerase  25.67 
 
 		 592 aa  83.2  0.00000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0743128 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0279  O-antigen polymerase family protein  26.49 
 
 		 595 aa  83.6  0.00000000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.297863  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0650  O-antigen polymerase family protein  26.57 
 
 		 595 aa  82.4  0.00000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3288  O-antigen polymerase  26.37 
 
 		 594 aa  80.1  0.0000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.709506  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2692  O-antigen polymerase  26.32 
 
 		 592 aa  78.2  0.0000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.341855  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0678  hypothetical protein  24.82 
 
 		 594 aa  78.2  0.0000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.206131 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0448  O-antigen polymerase  23.8 
 
 		 596 aa  74.7  0.000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.134695  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2566  O-antigen polymerase  25.9 
 
 		 592 aa  73.6  0.000000000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.968292  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0559  hypothetical protein  30.03 
 
 		 569 aa  73.6  0.00000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.261302  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0474  O-antigen polymerase  25.57 
 
 		 595 aa  70.9  0.00000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0466  O-antigen polymerase  31.32 
 
 		 589 aa  70.5  0.00000000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.285163  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03709  hypothetical protein  24.24 
 
 		 594 aa  69.3  0.0000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0489  O-antigen polymerase  27.24 
 
 		 605 aa  69.3  0.0000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.091013 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2194  O-antigen polymerase  30.03 
 
 		 582 aa  67  0.0000000008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.782503 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002359  lipid A core-O-antigen ligase  25.52 
 
 		 561 aa  65.5  0.000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2811  hypothetical protein  28.08 
 
 		 597 aa  64.3  0.000000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0479  O-antigen polymerase  26.59 
 
 		 578 aa  61.6  0.00000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.575245  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0844  O-antigen polymerase  26.93 
 
 		 556 aa  61.2  0.00000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.153781 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3650  O-antigen polymerase  28 
 
 		 517 aa  58.2  0.0000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.320613  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0242  hypothetical protein  23.74 
 
 		 586 aa  55.1  0.000003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0427625  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2960  O-antigen polymerase  27.64 
 
 		 517 aa  52.4  0.00002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  decreased coverage  0.00194737  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4036  O-antigen polymerase  27.86 
 
 		 516 aa  52.4  0.00002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0446  O-antigen polymerase  23.47 
 
 		 585 aa  50.1  0.0001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0368  O-antigen polymerase  23.24 
 
 		 579 aa  49.3  0.0002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2212  O-antigen polymerase  27.4 
 
 		 415 aa  44.3  0.006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0880149  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>