48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcenmc03_2674 on replicon NC_010508
Organism: Burkholderia cenocepacia MC0-3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_006348  BMA0279  O-antigen polymerase family protein  76.67 
 
 		 595 aa  872    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.297863  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3288  O-antigen polymerase  63.36 
 
 		 594 aa  746    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.709506  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0448  O-antigen polymerase  64.73 
 
 		 596 aa  732    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.134695  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2566  O-antigen polymerase  90.5 
 
 		 592 aa  917    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.968292  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2674  O-antigen polymerase  100 
 
 		 592 aa  1167    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0657  O-antigen polymerase  89.12 
 
 		 593 aa  926    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0010  O-antigen polymerase family protein  76.67 
 
 		 595 aa  872    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0821  O-antigen polymerase family protein  76.67 
 
 		 595 aa  874    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0817  O-antigen polymerase family protein  76.5 
 
 		 595 aa  870    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2397  O-antigen polymerase family protein  76.67 
 
 		 595 aa  872    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.233574  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2679  O-antigen polymerase family protein  76.67 
 
 		 595 aa  872    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2645  O-antigen polymerase  99.49 
 
 		 592 aa  1163    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2692  O-antigen polymerase  90.67 
 
 		 592 aa  923    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.341855  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0980  O-antigen polymerase family protein  76.5 
 
 		 661 aa  865    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0678  hypothetical protein  64.31 
 
 		 594 aa  766    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.206131 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5972  O-antigen polymerase  93.44 
 
 		 592 aa  990    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0743128 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2034  O-antigen polymerase  99.49 
 
 		 592 aa  1163    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0650  O-antigen polymerase family protein  77.02 
 
 		 595 aa  865    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0466  O-antigen polymerase  33.67 
 
 		 589 aa  259  1e-67  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.285163  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0559  hypothetical protein  32.81 
 
 		 569 aa  228  2e-58  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.261302  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0464  O-antigen polymerase  31.11 
 
 		 590 aa  214  2.9999999999999995e-54  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.325512  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0534  O-antigen polymerase  29.36 
 
 		 607 aa  188  2e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.462274  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0479  O-antigen polymerase  29.9 
 
 		 578 aa  185  2.0000000000000003e-45  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.575245  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0474  O-antigen polymerase  30.58 
 
 		 595 aa  183  8.000000000000001e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0063  O-antigen polymerase  27.92 
 
 		 531 aa  100  6e-20  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0639643 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5178  O-antigen polymerase  26.87 
 
 		 565 aa  91.3  5e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4673  O-antigen polymerase  24.8 
 
 		 560 aa  88.2  4e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4780  O-antigen polymerase  27.23 
 
 		 594 aa  87.8  6e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.793749  normal  0.179192 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4672  O-antigen polymerase  25.95 
 
 		 503 aa  77  0.0000000000009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4678  O-antigen polymerase  24.16 
 
 		 556 aa  77  0.000000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1264  O-antigen polymerase  25.98 
 
 		 555 aa  65.5  0.000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.339425  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0489  O-antigen polymerase  25.96 
 
 		 605 aa  58.9  0.0000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.091013 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0242  hypothetical protein  21.62 
 
 		 586 aa  59.3  0.0000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0427625  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0657  O-antigen polymerase  28.51 
 
 		 588 aa  52  0.00003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0056678  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3942  O-antigen polymerase  22.01 
 
 		 506 aa  50.8  0.00007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00471657 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0508  O-antigen polymerase  30 
 
 		 440 aa  48.5  0.0003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0368  O-antigen polymerase  27.95 
 
 		 579 aa  48.9  0.0003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0249  O-antigen polymerase  26.54 
 
 		 492 aa  47.4  0.0008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4227  O-antigen polymerase  28.16 
 
 		 457 aa  47.4  0.0008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2194  O-antigen polymerase  25.54 
 
 		 582 aa  46.6  0.001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.782503 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4286  inorganic carbon transporter  28.16 
 
 		 457 aa  47  0.001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.816665  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0314  O-antigen polymerase  31.19 
 
 		 397 aa  45.8  0.002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0271  O-antigen polymerase  26.09 
 
 		 760 aa  45.1  0.004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4465  O-antigen polymerase  29.35 
 
 		 479 aa  44.7  0.005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000989096  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1497  O-antigen polymerase  28.34 
 
 		 672 aa  44.7  0.005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3579  O-antigen polymerase  24.29 
 
 		 501 aa  43.9  0.007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03709  hypothetical protein  26.15 
 
 		 594 aa  44.3  0.007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002359  lipid A core-O-antigen ligase  27.06 
 
 		 561 aa  43.5  0.01  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>