56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_A0678 on replicon NC_007951
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_006348  BMA0279  O-antigen polymerase family protein  63.82 
 
 		 595 aa  754    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.297863  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3288  O-antigen polymerase  92.42 
 
 		 594 aa  1075    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.709506  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0448  O-antigen polymerase  80.27 
 
 		 596 aa  921    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.134695  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2566  O-antigen polymerase  64.6 
 
 		 592 aa  672    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.968292  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2674  O-antigen polymerase  64.38 
 
 		 592 aa  733    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0657  O-antigen polymerase  63.92 
 
 		 593 aa  691    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0010  O-antigen polymerase family protein  63.82 
 
 		 595 aa  754    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0821  O-antigen polymerase family protein  63.82 
 
 		 595 aa  755    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0817  O-antigen polymerase family protein  63.82 
 
 		 595 aa  754    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2397  O-antigen polymerase family protein  63.82 
 
 		 595 aa  754    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.233574  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2679  O-antigen polymerase family protein  63.82 
 
 		 595 aa  754    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2645  O-antigen polymerase  64.21 
 
 		 592 aa  734    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2692  O-antigen polymerase  64.6 
 
 		 592 aa  679    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.341855  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2034  O-antigen polymerase  64.21 
 
 		 592 aa  734    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0678  hypothetical protein  100 
 
 		 594 aa  1192    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.206131 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0980  O-antigen polymerase family protein  63.65 
 
 		 661 aa  746    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5972  O-antigen polymerase  64.6 
 
 		 592 aa  709    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0743128 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0650  O-antigen polymerase family protein  64.33 
 
 		 595 aa  751    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0466  O-antigen polymerase  32.67 
 
 		 589 aa  261  3e-68  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.285163  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0464  O-antigen polymerase  32.18 
 
 		 590 aa  226  7e-58  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.325512  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0559  hypothetical protein  32.08 
 
 		 569 aa  220  5e-56  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.261302  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0534  O-antigen polymerase  29.74 
 
 		 607 aa  216  8e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.462274  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0479  O-antigen polymerase  31.69 
 
 		 578 aa  196  8.000000000000001e-49  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.575245  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0474  O-antigen polymerase  30.81 
 
 		 595 aa  191  2e-47  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0063  O-antigen polymerase  30.59 
 
 		 531 aa  92.8  2e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0639643 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4780  O-antigen polymerase  25.12 
 
 		 594 aa  78.6  0.0000000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.793749  normal  0.179192 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4673  O-antigen polymerase  24.82 
 
 		 560 aa  77.4  0.0000000000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4678  O-antigen polymerase  24.49 
 
 		 556 aa  75.1  0.000000000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5178  O-antigen polymerase  24.71 
 
 		 565 aa  72.8  0.00000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1264  O-antigen polymerase  25.19 
 
 		 555 aa  65.1  0.000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.339425  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0242  hypothetical protein  20.61 
 
 		 586 aa  60.5  0.00000008  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0427625  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4672  O-antigen polymerase  22.8 
 
 		 503 aa  58.9  0.0000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3942  O-antigen polymerase  25.97 
 
 		 506 aa  57.4  0.0000008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00471657 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0844  O-antigen polymerase  29.82 
 
 		 556 aa  53.5  0.00001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.153781 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1497  O-antigen polymerase  27.05 
 
 		 672 aa  52.4  0.00002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2338  O-antigen polymerase  25.53 
 
 		 425 aa  50.1  0.0001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4567  O-antigen polymerase  26.38 
 
 		 717 aa  50.1  0.0001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.79744  normal  0.181696 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0489  O-antigen polymerase  25.82 
 
 		 605 aa  49.3  0.0002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.091013 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3113  O-antigen polymerase  20.6 
 
 		 467 aa  48.1  0.0004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.000000000265772  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0083  membrane protein  27.88 
 
 		 443 aa  48.1  0.0005  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.735968  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0508  O-antigen polymerase  32.1 
 
 		 440 aa  48.1  0.0005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5249  O-antigen polymerase  25 
 
 		 671 aa  47.8  0.0006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.566036  normal  0.80633 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0152  hypothetical protein  25.34 
 
 		 389 aa  46.6  0.001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1691  O-antigen polymerase  26.25 
 
 		 512 aa  46.6  0.001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.121195  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0069  O-antigen polymerase  27.4 
 
 		 443 aa  46.2  0.002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3018  O-antigen polymerase  32.98 
 
 		 446 aa  46.2  0.002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2813  O-antigen polymerase  22.29 
 
 		 773 aa  46.2  0.002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.192356  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4036  O-antigen polymerase  27.31 
 
 		 516 aa  45.8  0.002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4268  O-antigen polymerase  29.73 
 
 		 503 aa  45.4  0.003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.209068 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1511  O-antigen polymerase  28.57 
 
 		 436 aa  45.1  0.004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.995807  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1087  O-antigen polymerase  26.9 
 
 		 612 aa  44.7  0.005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0142  O-antigen polymerase  26.42 
 
 		 496 aa  44.7  0.005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0300218 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2960  O-antigen polymerase  24.5 
 
 		 517 aa  44.7  0.005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  decreased coverage  0.00194737  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0822  inorganic carbon transporter  29.44 
 
 		 471 aa  44.3  0.006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.999427  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0657  O-antigen polymerase  23.67 
 
 		 588 aa  43.9  0.008  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0056678  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0586  O-antigen polymerase  35.11 
 
 		 459 aa  43.5  0.01  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.00000335873  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>