27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ddes_0586 on replicon NC_011883
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011883  Ddes_0586  O-antigen polymerase  100 
 
 		 459 aa  920    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.00000335873  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3018  O-antigen polymerase  41.01 
 
 		 446 aa  283  4.0000000000000003e-75  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0480  hypothetical protein  38.86 
 
 		 452 aa  234  3e-60  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4567  O-antigen polymerase  38.46 
 
 		 717 aa  48.9  0.0002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.79744  normal  0.181696 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3579  O-antigen polymerase  25.3 
 
 		 501 aa  48.9  0.0002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0534  O-antigen polymerase  30 
 
 		 607 aa  48.1  0.0003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.462274  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0559  O-antigen polymerase  32.93 
 
 		 647 aa  47  0.0007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.024189  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0364  O-antigen polymerase  25.49 
 
 		 428 aa  45.8  0.001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0980  O-antigen polymerase family protein  32.33 
 
 		 661 aa  46.2  0.001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1699  O-antigen polymerase  26.23 
 
 		 401 aa  46.2  0.001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1691  O-antigen polymerase  40.32 
 
 		 512 aa  46.6  0.001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.121195  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0010  O-antigen polymerase family protein  32.33 
 
 		 595 aa  45.8  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0464  O-antigen polymerase  36.49 
 
 		 590 aa  45.1  0.002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.325512  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0821  O-antigen polymerase family protein  32.33 
 
 		 595 aa  45.8  0.002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0817  O-antigen polymerase family protein  32.33 
 
 		 595 aa  45.8  0.002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2397  O-antigen polymerase family protein  32.33 
 
 		 595 aa  45.8  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.233574  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2679  O-antigen polymerase family protein  32.33 
 
 		 595 aa  45.8  0.002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0279  O-antigen polymerase family protein  32.33 
 
 		 595 aa  45.8  0.002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.297863  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0466  O-antigen polymerase  39.47 
 
 		 589 aa  45.1  0.003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.285163  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0410  O-antigen polymerase  33.78 
 
 		 552 aa  44.7  0.004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66100  hypothetical protein  30.66 
 
 		 399 aa  44.7  0.004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5004  O-antigen polymerase family protein  24.85 
 
 		 436 aa  43.9  0.006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1869  O-antigen polymerase  30.41 
 
 		 459 aa  43.9  0.006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0678  hypothetical protein  35.11 
 
 		 594 aa  43.5  0.008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.206131 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2516  O-antigen polymerase  37.14 
 
 		 686 aa  43.5  0.009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.549504  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2896  O-antigen polymerase family protein  37.14 
 
 		 686 aa  43.5  0.009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4498  O-antigen polymerase  25.77 
 
 		 447 aa  43.1  0.009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>