39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_4498 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011830  Dhaf_4498  O-antigen polymerase  100 
 
 		 447 aa  882    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2459  O-antigen polymerase  28.86 
 
 		 437 aa  70.5  0.00000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2455  O-antigen polymerase  28.07 
 
 		 435 aa  66.6  0.0000000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0818595  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1788  O-antigen polymerase  26.94 
 
 		 446 aa  58.9  0.0000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1087  O-antigen polymerase  29.29 
 
 		 612 aa  57.8  0.0000004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0979  O-antigen polymerase  31.32 
 
 		 523 aa  56.2  0.000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2212  O-antigen polymerase  28.04 
 
 		 415 aa  56.2  0.000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0880149  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1954  hypothetical protein  24.85 
 
 		 443 aa  55.1  0.000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5249  O-antigen polymerase  26.54 
 
 		 671 aa  55.5  0.000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.566036  normal  0.80633 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0301  O-antigen polymerase  27.75 
 
 		 464 aa  55.1  0.000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2712  O-antigen polymerase  24.85 
 
 		 413 aa  52  0.00002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0646679  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3113  O-antigen polymerase  25.21 
 
 		 467 aa  52.4  0.00002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.000000000265772  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4864  inorganic carbon transporter  27.4 
 
 		 467 aa  50.8  0.00005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.867776  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3078  O-antigen polymerase  27.23 
 
 		 500 aa  50.1  0.00008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3401  polysaccharide deacetylase  22.67 
 
 		 464 aa  49.3  0.0001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.264275  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0714  O-antigen polymerase  23.12 
 
 		 781 aa  49.3  0.0001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0480  O-antigen polymerase  24.72 
 
 		 620 aa  48.5  0.0003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.450132  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5004  O-antigen polymerase family protein  27.27 
 
 		 436 aa  47.8  0.0004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2638  O-antigen polymerase  24.86 
 
 		 428 aa  47.8  0.0004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3077  O-antigen polymerase  29.78 
 
 		 504 aa  47.8  0.0005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2436  O-antigen polymerase  29.67 
 
 		 894 aa  47  0.0007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5667  putative O-antigen ligase  27.97 
 
 		 427 aa  47  0.0007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.304337  normal  0.482234 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3375  O-antigen polymerase  27.27 
 
 		 432 aa  47  0.0008  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.221665  normal  0.11504 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1691  O-antigen polymerase  27.72 
 
 		 512 aa  45.8  0.001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.121195  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18850  O-antigen polymerase  30.77 
 
 		 393 aa  46.6  0.001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2333  O-antigen polymerase  28.26 
 
 		 426 aa  45.1  0.003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0425881 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2694  O-antigen polymerase  23.78 
 
 		 532 aa  45.1  0.003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00327343  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2310  O-antigen polymerase  28.26 
 
 		 426 aa  45.1  0.003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1698  O-antigen polymerase  28.26 
 
 		 426 aa  45.1  0.003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5250  O-antigen polymerase  23.53 
 
 		 336 aa  44.3  0.004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7045  putative O-antigen polymerase  26.82 
 
 		 448 aa  43.9  0.005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1511  O-antigen polymerase  27.27 
 
 		 436 aa  43.9  0.006  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.995807  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0069  O-antigen polymerase  28.32 
 
 		 443 aa  43.9  0.006  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4567  O-antigen polymerase  30.13 
 
 		 717 aa  43.5  0.007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.79744  normal  0.181696 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4829  O-antigen polymerase  24.62 
 
 		 389 aa  43.5  0.007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.126045  hitchhiker  0.0000506097 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0083  membrane protein  28.57 
 
 		 443 aa  43.5  0.007  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.735968  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1497  O-antigen polymerase  25.94 
 
 		 672 aa  43.1  0.009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2412  hypothetical protein  24.39 
 
 		 444 aa  43.1  0.009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2801  O-antigen polymerase  25.53 
 
 		 434 aa  43.1  0.01  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>