36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_7045 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009485  BBta_7045  putative O-antigen polymerase  100 
 
 
448 aa  884    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2801  O-antigen polymerase  52.63 
 
 
434 aa  402  1e-111  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5667  putative O-antigen ligase  45.65 
 
 
427 aa  359  5e-98  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.304337  normal  0.482234 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2410  O-antigen polymerase  44.42 
 
 
426 aa  316  7e-85  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.231968 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1698  O-antigen polymerase  27.25 
 
 
426 aa  105  2e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2310  O-antigen polymerase  27.25 
 
 
426 aa  105  2e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2333  O-antigen polymerase  26.52 
 
 
426 aa  105  2e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0425881 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5652  O-antigen polymerase  27.01 
 
 
426 aa  98.2  3e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2229  O-antigen polymerase  26.28 
 
 
426 aa  82.4  0.00000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.541391  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2349  O-antigen polymerase  26.79 
 
 
426 aa  81.6  0.00000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2075  O-antigen polymerase  26.29 
 
 
432 aa  77  0.0000000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.123759  normal  0.0828112 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0338  O-antigen ligase  24.27 
 
 
436 aa  73.2  0.000000000009  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1851  hypothetical protein  24.27 
 
 
429 aa  72.4  0.00000000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0851  O-antigen polymerase domain-containing protein  24.26 
 
 
410 aa  63.5  0.000000006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.852584 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3646  O-antigen polymerase  24.26 
 
 
410 aa  63.5  0.000000006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3515  O-antigen polymerase domain-containing protein  24.26 
 
 
410 aa  63.5  0.000000006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0392  O-antigen polymerase  23.91 
 
 
398 aa  62.8  0.00000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.000178586  normal  0.74185 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1804  hypothetical protein  26.44 
 
 
410 aa  61.6  0.00000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.0307014 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2053  O-antigen polymerase  24.57 
 
 
405 aa  61.2  0.00000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1980  O-antigen polymerase  24.06 
 
 
396 aa  60.1  0.00000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.638067 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1774  O-antigen polymerase  24.22 
 
 
418 aa  58.9  0.0000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00226394  normal  0.0339661 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4092  O-antigen polymerase  29.05 
 
 
415 aa  55.1  0.000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0319  O-antigen polymerase  28.48 
 
 
422 aa  52.8  0.00001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0853  hypothetical protein  19.9 
 
 
416 aa  51.6  0.00003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2478  O-antigen polymerase  30 
 
 
415 aa  51.2  0.00004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0418  O-antigen polymerase  24.71 
 
 
431 aa  46.6  0.0008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1811  O-antigen polymerase  25 
 
 
417 aa  46.2  0.001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0069  O-antigen polymerase  28.89 
 
 
443 aa  45.4  0.002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1429  O-antigen polymerase  24.32 
 
 
405 aa  45.1  0.002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0884  hypothetical protein  18.13 
 
 
416 aa  45.8  0.002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0160  O-antigen ligase WaaL  28.24 
 
 
408 aa  45.1  0.003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0263  O-antigen ligase WaaL  28.24 
 
 
408 aa  45.1  0.003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4678  O-antigen polymerase  29.52 
 
 
544 aa  44.3  0.004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2006  O-antigen polymerase  29.21 
 
 
426 aa  44.3  0.004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.188841  normal  0.439827 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0083  membrane protein  28.89 
 
 
443 aa  43.9  0.006  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.735968  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0333  O-antigen polymerase  23.11 
 
 
416 aa  43.9  0.006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>