53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen_1698 on replicon NC_008060
Organism: Burkholderia cenocepacia AU 1054



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007510  Bcep18194_A5652  O-antigen polymerase  91.06 
 
 		 426 aa  737    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2229  O-antigen polymerase  88.24 
 
 		 426 aa  698    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.541391  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2333  O-antigen polymerase  99.3 
 
 		 426 aa  835    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0425881 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2310  O-antigen polymerase  100 
 
 		 426 aa  840    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1698  O-antigen polymerase  100 
 
 		 426 aa  840    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2349  O-antigen polymerase  87.76 
 
 		 426 aa  695    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2075  O-antigen polymerase  43.26 
 
 		 432 aa  295  1e-78  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.123759  normal  0.0828112 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0338  O-antigen ligase  28.74 
 
 		 436 aa  117  3e-25  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1851  hypothetical protein  29.23 
 
 		 429 aa  115  2.0000000000000002e-24  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0853  hypothetical protein  26.67 
 
 		 416 aa  110  4.0000000000000004e-23  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1774  O-antigen polymerase  32.3 
 
 		 418 aa  109  1e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00226394  normal  0.0339661 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4092  O-antigen polymerase  28.43 
 
 		 415 aa  102  2e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0884  hypothetical protein  26.13 
 
 		 416 aa  100  4e-20  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0392  O-antigen polymerase  33.95 
 
 		 398 aa  99  2e-19  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.000178586  normal  0.74185 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2801  O-antigen polymerase  27.57 
 
 		 434 aa  97.8  4e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5667  putative O-antigen ligase  27.73 
 
 		 427 aa  95.1  2e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.304337  normal  0.482234 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7045  putative O-antigen polymerase  26.76 
 
 		 448 aa  94.7  3e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2053  O-antigen polymerase  32.25 
 
 		 405 aa  90.9  4e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1980  O-antigen polymerase  30.28 
 
 		 396 aa  82  0.00000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.638067 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2410  O-antigen polymerase  24.82 
 
 		 426 aa  80.9  0.00000000000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.231968 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0851  O-antigen polymerase domain-containing protein  25.68 
 
 		 410 aa  78.2  0.0000000000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.852584 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3646  O-antigen polymerase  25.68 
 
 		 410 aa  78.2  0.0000000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3515  O-antigen polymerase domain-containing protein  25.68 
 
 		 410 aa  78.2  0.0000000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1804  hypothetical protein  29.6 
 
 		 410 aa  73.6  0.000000000007  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.0307014 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0232  O-antigen polymerase family protein  25.7 
 
 		 417 aa  72  0.00000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0581783  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0408  O-antigen polymerase  25.19 
 
 		 407 aa  72  0.00000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00264178 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1811  O-antigen polymerase  30.41 
 
 		 417 aa  63.9  0.000000005  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2712  O-antigen polymerase  27.62 
 
 		 413 aa  58.9  0.0000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0646679  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0319  O-antigen polymerase  27.92 
 
 		 422 aa  54.3  0.000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2478  O-antigen polymerase  31.76 
 
 		 415 aa  53.9  0.000006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2006  O-antigen polymerase  26.9 
 
 		 426 aa  51.6  0.00002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.188841  normal  0.439827 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2204  hypothetical protein  31.79 
 
 		 435 aa  50.1  0.00007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.556953  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02935  hypothetical protein  26.35 
 
 		 408 aa  48.9  0.0002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0368  O-antigen polymerase  27.59 
 
 		 579 aa  48.9  0.0002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0418  O-antigen polymerase  25 
 
 		 431 aa  48.9  0.0002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2401  O-antigen polymerase  26.21 
 
 		 426 aa  47.4  0.0005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0523174  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04059  O-Antigen Polymerase family  29.01 
 
 		 425 aa  45.8  0.001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0845  hypothetical protein  32.93 
 
 		 537 aa  45.4  0.002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.149779  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0184  O-antigen polymerase  29.56 
 
 		 435 aa  45.4  0.002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.146439  normal  0.684402 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0144  O-antigen polymerase  25.5 
 
 		 388 aa  44.7  0.003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0149  O-antigen polymerase  25.5 
 
 		 388 aa  44.7  0.003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0263  O-antigen ligase WaaL  26.26 
 
 		 408 aa  45.1  0.003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0160  O-antigen ligase WaaL  26.26 
 
 		 408 aa  45.1  0.003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1699  O-antigen polymerase  23.56 
 
 		 401 aa  44.7  0.004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0051  O-antigen polymerase  24.75 
 
 		 735 aa  43.9  0.005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000539528  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0161  O-antigen polymerase  28.18 
 
 		 440 aa  44.3  0.005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.971054  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1253  O-antigen polymerase  28.41 
 
 		 832 aa  43.9  0.005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0517425 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0508  O-antigen polymerase  28.07 
 
 		 440 aa  43.5  0.007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2741  O-antigen polymerase  26.32 
 
 		 333 aa  43.5  0.007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.448774  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03709  hypothetical protein  26.55 
 
 		 594 aa  43.5  0.008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4268  O-antigen polymerase  27.59 
 
 		 503 aa  43.5  0.008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.209068 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5249  O-antigen polymerase  26.91 
 
 		 671 aa  43.5  0.008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.566036  normal  0.80633 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1285  O-antigen polymerase  27.12 
 
 		 418 aa  43.1  0.01  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>