26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_0480 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007492  Pfl01_0480  O-antigen polymerase  100 
 
 
620 aa  1248    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.450132  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5734  hypothetical protein  40.8 
 
 
397 aa  262  1e-68  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66100  hypothetical protein  38.64 
 
 
399 aa  257  5e-67  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1418  O-antigen polymerase  39.43 
 
 
397 aa  246  9e-64  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0959818 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0535  toluene tolerance protein, putative  49.73 
 
 
251 aa  178  2e-43  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.64261 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66090  hypothetical protein  48.94 
 
 
216 aa  175  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4985  toluene tolerance protein, putative  44.93 
 
 
226 aa  172  2e-41  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5733  hypothetical protein  48.4 
 
 
216 aa  172  2e-41  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0762  toluene tolerance protein, putative  42.29 
 
 
229 aa  157  4e-37  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.013011 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4937  toluene tolerance protein  44.39 
 
 
224 aa  143  9e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.95159  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4809  hypothetical protein  44.86 
 
 
224 aa  142  9.999999999999999e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4986  toluene tolerance protein Ttg8  44.81 
 
 
201 aa  143  9.999999999999999e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0530  toluene tolerance protein Ttg8  42.78 
 
 
201 aa  138  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.153387 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44720  hypothetical protein  40.5 
 
 
216 aa  132  1.0000000000000001e-29  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4808  O-antigen polymerase  29.38 
 
 
391 aa  71.6  0.00000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4936  O-antigen polymerase  27.91 
 
 
391 aa  70.9  0.00000000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2800  O-antigen polymerase  34.62 
 
 
422 aa  62.8  0.00000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4985  O-antigen polymerase  25.34 
 
 
391 aa  62.8  0.00000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3150  O-antigen polymerase  28.28 
 
 
388 aa  60.5  0.00000009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.9572 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4829  O-antigen polymerase  24.88 
 
 
389 aa  57.8  0.0000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.126045  hitchhiker  0.0000506097 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1531  O-antigen polymerase  25.54 
 
 
419 aa  51.2  0.00005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.543111  normal  0.517094 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4995  lipid A-core:surface polymer ligase  24.22 
 
 
402 aa  49.3  0.0002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.150422  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44730  O-antigen polymerase protein  25.55 
 
 
419 aa  47.4  0.0009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1764  O-antigen polymerase  24.32 
 
 
560 aa  45.1  0.004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006670  CNA07600  hypothetical protein  32 
 
 
747 aa  44.7  0.005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0657  serine/threonine protein kinase  35.23 
 
 
566 aa  43.9  0.009  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>