66 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VSAL_II0301 on replicon NC_011313
Organism: Aliivibrio salmonicida LFI1238



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011313  VSAL_II0301  O-antigen polymerase  100 
 
 		 464 aa  919    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003538  putative membrane protein of ExoQ family involved in exopolysaccharide production  59.33 
 
 		 454 aa  496  1e-139  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02223  hypothetical protein  56.36 
 
 		 461 aa  464  1e-129  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0297  hypothetical protein  27.46 
 
 		 428 aa  100  5e-20  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.515931  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0119  O-antigen polymerase  27.16 
 
 		 466 aa  86.7  8e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2363  hypothetical protein  27.38 
 
 		 431 aa  86.3  0.000000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2530  wzy family polymerase, exosortase system type 1 associated  27.57 
 
 		 463 aa  82  0.00000000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.42287  normal  0.0601314 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3268  wzy family polymerase, exosortase system type 1 associated  24.82 
 
 		 452 aa  80.1  0.00000000000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.869746  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1955  O-antigen polymerase  23.6 
 
 		 468 aa  76.3  0.000000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.324728  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2459  O-antigen polymerase  26.32 
 
 		 437 aa  74.3  0.000000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3061  O-antigen polymerase  28.32 
 
 		 465 aa  71.2  0.00000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.433121  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0152  hypothetical protein  26.22 
 
 		 389 aa  71.2  0.00000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3094  O-antigen polymerase  33.33 
 
 		 444 aa  70.9  0.00000000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3579  O-antigen polymerase  23.86 
 
 		 501 aa  70.5  0.00000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0300  O-antigen polymerase  28.05 
 
 		 446 aa  70.1  0.00000000008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0582  O-antigen polymerase  25 
 
 		 454 aa  69.3  0.0000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.814347  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2338  O-antigen polymerase  25.87 
 
 		 425 aa  68.9  0.0000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1558  O-antigen polymerase  27.13 
 
 		 472 aa  68.2  0.0000000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.238347  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2455  O-antigen polymerase  30.34 
 
 		 435 aa  67.8  0.0000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0818595  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0024  O-antigen polymerase  27 
 
 		 456 aa  67.8  0.0000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0677  O-antigen polymerase  24.76 
 
 		 436 aa  65.9  0.000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.857845  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5004  O-antigen polymerase family protein  25.1 
 
 		 436 aa  60.8  0.00000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1650  hypothetical protein  26.13 
 
 		 404 aa  59.7  0.0000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.192586  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1184  O-antigen polymerase  26.41 
 
 		 412 aa  59.7  0.0000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2412  hypothetical protein  25.36 
 
 		 444 aa  58.5  0.0000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2821  O-antigen polymerase  23.44 
 
 		 434 aa  57.4  0.0000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0142  O-antigen polymerase  26.95 
 
 		 496 aa  56.6  0.0000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0300218 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3695  hypothetical protein  25.63 
 
 		 404 aa  56.2  0.000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1468  secreted polysaccharide polymerase  27.4 
 
 		 404 aa  55.1  0.000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00102355  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1496  hypothetical protein  27.4 
 
 		 404 aa  55.1  0.000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.285071  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4434  O-antigen polymerase  26.09 
 
 		 474 aa  55.1  0.000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1682  hypothetical protein  27.78 
 
 		 404 aa  55.1  0.000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1614  hypothetical protein  27.4 
 
 		 404 aa  55.1  0.000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.363158  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4227  O-antigen polymerase  27.89 
 
 		 457 aa  54.3  0.000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4286  inorganic carbon transporter  27.89 
 
 		 457 aa  54.3  0.000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.816665  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0508  O-antigen polymerase  37.5 
 
 		 440 aa  53.9  0.000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3077  O-antigen polymerase  29.55 
 
 		 504 aa  53.9  0.000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2384  O-antigen polymerase  23.48 
 
 		 436 aa  53.1  0.00001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.486663  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3103  O-antigen polymerase  27.05 
 
 		 498 aa  53.1  0.00001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.313581  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2640  O-antigen polymerase  28.06 
 
 		 434 aa  52.4  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0149794  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2608  O-antigen polymerase  24 
 
 		 432 aa  51.6  0.00003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.212106  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1788  O-antigen polymerase  24.07 
 
 		 446 aa  51.2  0.00004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2375  O-antigen polymerase  26.79 
 
 		 500 aa  51.2  0.00004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01295  secreted polysaccharide polymerase  30.23 
 
 		 385 aa  49.7  0.0001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4957  O-antigen polymerase  24.47 
 
 		 470 aa  49.3  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18850  O-antigen polymerase  30.43 
 
 		 393 aa  49.3  0.0002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0227  hypothetical protein  23.58 
 
 		 460 aa  48.9  0.0002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.604472  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3018  O-antigen polymerase  22.83 
 
 		 446 aa  47.8  0.0004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2960  O-antigen polymerase  30.32 
 
 		 436 aa  47.4  0.0006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.12688  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3078  O-antigen polymerase  27.27 
 
 		 500 aa  47.4  0.0006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1869  O-antigen polymerase  30.28 
 
 		 459 aa  47  0.0007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3113  O-antigen polymerase  31.17 
 
 		 467 aa  47  0.0007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.000000000265772  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1654  O-antigen polymerase  29.27 
 
 		 754 aa  45.8  0.001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1355  O-antigen polymerase  28.04 
 
 		 843 aa  46.2  0.001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0822  inorganic carbon transporter  33.33 
 
 		 471 aa  45.4  0.002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.999427  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4116  O-antigen polymerase  29.66 
 
 		 540 aa  45.8  0.002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0014553  hitchhiker  0.00000561153 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0069  O-antigen polymerase  22.94 
 
 		 443 aa  45.8  0.002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4391  O-antigen polymerase  27.23 
 
 		 494 aa  44.7  0.003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.6355  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4864  inorganic carbon transporter  24 
 
 		 467 aa  45.1  0.003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.867776  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1385  O-antigen polymerase  27.51 
 
 		 843 aa  44.7  0.004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2638  O-antigen polymerase  23.08 
 
 		 428 aa  44.7  0.004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0083  membrane protein  29.41 
 
 		 443 aa  43.9  0.005  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.735968  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1087  O-antigen polymerase  25.1 
 
 		 612 aa  44.3  0.005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3150  O-antigen polymerase  26.51 
 
 		 388 aa  43.9  0.006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.9572 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2726  O-antigen polymerase  28.78 
 
 		 434 aa  43.5  0.007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.136872  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3696  O-antigen polymerase  26 
 
 		 461 aa  43.1  0.009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.312837 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>