10 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_4829 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009832  Spro_4829  O-antigen polymerase  100 
 
 		 389 aa  777    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.126045  hitchhiker  0.0000506097 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3150  O-antigen polymerase  49.86 
 
 		 388 aa  358  9.999999999999999e-98  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.9572 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0480  O-antigen polymerase  24.88 
 
 		 620 aa  68.6  0.0000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.450132  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0314  O-antigen polymerase  30.71 
 
 		 397 aa  63.5  0.000000006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66100  hypothetical protein  27.35 
 
 		 399 aa  60.1  0.00000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5734  hypothetical protein  24.79 
 
 		 397 aa  54.7  0.000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2800  O-antigen polymerase  24.69 
 
 		 422 aa  51.6  0.00002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1418  O-antigen polymerase  27.56 
 
 		 397 aa  45.8  0.001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0959818 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1595  O-antigen polymerase  26.05 
 
 		 467 aa  45.4  0.002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2530  wzy family polymerase, exosortase system type 1 associated  22.93 
 
 		 463 aa  45.4  0.002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.42287  normal  0.0601314 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>