69 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_4567 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010571  Oter_4567  O-antigen polymerase  100 
 
 		 717 aa  1402    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.79744  normal  0.181696 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2384  O-antigen polymerase  29.13 
 
 		 436 aa  64.3  0.000000007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.486663  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2403  O-antigen polymerase  23.04 
 
 		 509 aa  63.5  0.00000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.166063  normal  0.151725 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2896  O-antigen polymerase family protein  29.18 
 
 		 686 aa  62.8  0.00000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2516  O-antigen polymerase  29.18 
 
 		 686 aa  62.8  0.00000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.549504  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1691  O-antigen polymerase  28 
 
 		 512 aa  60.5  0.00000009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.121195  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3526  O-antigen polymerase  32.4 
 
 		 668 aa  58.5  0.0000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000131402  normal  0.176407 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1087  O-antigen polymerase  24.89 
 
 		 612 aa  57  0.000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3288  O-antigen polymerase  30.25 
 
 		 594 aa  56.2  0.000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.709506  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1088  O-antigen polymerase  27.52 
 
 		 737 aa  56.2  0.000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0479  O-antigen polymerase  30.61 
 
 		 578 aa  55.8  0.000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.575245  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2459  O-antigen polymerase  27.9 
 
 		 437 aa  54.7  0.000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1496  hypothetical protein  29.2 
 
 		 404 aa  53.9  0.00001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.285071  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0657  O-antigen polymerase  28.08 
 
 		 588 aa  53.9  0.00001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0056678  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1682  hypothetical protein  29.2 
 
 		 404 aa  53.5  0.00001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1468  secreted polysaccharide polymerase  29.2 
 
 		 404 aa  53.9  0.00001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00102355  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1173  hypothetical protein  27.92 
 
 		 457 aa  53.9  0.00001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  hitchhiker  0.00922176  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1614  hypothetical protein  29.2 
 
 		 404 aa  53.9  0.00001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.363158  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2807  tetratricopeptide TPR_2  29.26 
 
 		 576 aa  52.8  0.00002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.233123 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18850  O-antigen polymerase  23.39 
 
 		 393 aa  52.4  0.00003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0634  O-antigen polymerase  26.98 
 
 		 415 aa  52.8  0.00003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.60095 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0464  O-antigen polymerase  30.73 
 
 		 590 aa  52  0.00004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.325512  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3326  O-antigen polymerase  25 
 
 		 502 aa  52  0.00004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.32495 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1650  hypothetical protein  27.94 
 
 		 404 aa  51.6  0.00005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.192586  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0681  TPR repeat-containing protein  25.37 
 
 		 375 aa  51.6  0.00005  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2338  O-antigen polymerase  30.37 
 
 		 425 aa  51.2  0.00007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2022  O-antigen polymerase  30 
 
 		 340 aa  50.8  0.00008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1361  TPR repeat-containing protein  25.95 
 
 		 1276 aa  50.1  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3695  hypothetical protein  27.54 
 
 		 404 aa  50.4  0.0001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0466  O-antigen polymerase  29.35 
 
 		 589 aa  50.4  0.0001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.285163  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0678  hypothetical protein  26.54 
 
 		 594 aa  50.4  0.0001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.206131 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2741  O-antigen polymerase  32.26 
 
 		 333 aa  50.1  0.0002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.448774  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0650  O-antigen polymerase family protein  28.92 
 
 		 595 aa  49.3  0.0002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0191  TPR repeat-containing protein  32.08 
 
 		 250 aa  49.7  0.0002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.641193  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0279  O-antigen polymerase family protein  29.38 
 
 		 595 aa  48.9  0.0003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.297863  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0586  O-antigen polymerase  38.46 
 
 		 459 aa  48.9  0.0003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.00000335873  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2679  O-antigen polymerase family protein  29.38 
 
 		 595 aa  48.9  0.0003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0234  O-antigen polymerase  35.44 
 
 		 402 aa  49.3  0.0003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0682574 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0010  O-antigen polymerase family protein  29.38 
 
 		 595 aa  48.9  0.0003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0817  O-antigen polymerase family protein  29.38 
 
 		 595 aa  48.9  0.0003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2397  O-antigen polymerase family protein  29.38 
 
 		 595 aa  48.9  0.0003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.233574  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0980  O-antigen polymerase family protein  29.38 
 
 		 661 aa  48.9  0.0004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2813  O-antigen polymerase  20.15 
 
 		 773 aa  47.8  0.0007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.192356  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2604  TPR repeat-containing protein  26.14 
 
 		 927 aa  47.8  0.0007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.010408  normal  0.426767 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0821  O-antigen polymerase family protein  29.38 
 
 		 595 aa  47.8  0.0007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0448  O-antigen polymerase  32.23 
 
 		 596 aa  47.4  0.0008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.134695  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2694  O-antigen polymerase  26.88 
 
 		 535 aa  47  0.001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.247958  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1788  O-antigen polymerase  26.76 
 
 		 446 aa  47.4  0.001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1869  O-antigen polymerase  29.23 
 
 		 459 aa  47.4  0.001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1654  O-antigen polymerase  22.15 
 
 		 754 aa  47.4  0.001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2212  O-antigen polymerase  29.13 
 
 		 415 aa  45.8  0.002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0880149  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1558  O-antigen polymerase  33.07 
 
 		 472 aa  46.6  0.002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.238347  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4995  lipid A-core:surface polymer ligase  29.11 
 
 		 402 aa  46.2  0.002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.150422  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05201  hypothetical protein  25.81 
 
 		 419 aa  46.6  0.002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3077  O-antigen polymerase  27.4 
 
 		 504 aa  46.6  0.002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1822  O-antigen polymerase  20.82 
 
 		 461 aa  45.8  0.003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.831736  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4957  O-antigen polymerase  25.54 
 
 		 470 aa  45.4  0.003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1796  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.24 
 
 		 465 aa  45.8  0.003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.769841  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0157  TPR repeat-containing protein  25.38 
 
 		 465 aa  45.8  0.003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0364  O-antigen polymerase  29.87 
 
 		 428 aa  45.8  0.003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0822  inorganic carbon transporter  26.74 
 
 		 471 aa  45.1  0.004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.999427  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0321  TPR repeat-containing protein  33.33 
 
 		 162 aa  45.1  0.004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0471  TPR repeat-containing protein  26.47 
 
 		 1297 aa  45.1  0.005  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4508  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.92 
 
 		 836 aa  44.7  0.006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.885776 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2401  O-antigen polymerase  25.69 
 
 		 426 aa  44.7  0.006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0523174  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2893  O-linked N-acetylglucosamine transferase  25.81 
 
 		 397 aa  44.7  0.006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.272299 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3579  O-antigen polymerase  22.1 
 
 		 501 aa  44.3  0.008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1388  O-antigen polymerase  27.33 
 
 		 452 aa  44.3  0.008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0060  TPR repeat-containing protein  27.27 
 
 		 562 aa  44.3  0.009  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>