More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmar_0681 on replicon NC_010085
Organism: Nitrosopumilus maritimus SCM1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010085  Nmar_0681  TPR repeat-containing protein  100 
 
 		 375 aa  753    Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2604  TPR repeat-containing protein  33.71 
 
 		 927 aa  107  3e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.010408  normal  0.426767 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3643  TPR domain-containing protein  35.82 
 
 		 1979 aa  88.6  2e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2461  hypothetical protein  35.04 
 
 		 398 aa  84.3  0.000000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.125521  normal  0.0258605 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1361  TPR repeat-containing protein  29.19 
 
 		 1276 aa  82.4  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0191  TPR repeat-containing protein  32.26 
 
 		 250 aa  82.4  0.00000000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.641193  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1796  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  32.62 
 
 		 465 aa  80.9  0.00000000000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.769841  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0384  TPR repeat-containing protein  31.85 
 
 		 279 aa  80.5  0.00000000000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.890218  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5004  TPR repeat-containing protein  29.61 
 
 		 699 aa  80.5  0.00000000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0157  TPR repeat-containing protein  31.78 
 
 		 465 aa  80.1  0.00000000000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1019  TPR repeat-containing protein  32.31 
 
 		 273 aa  80.1  0.00000000000006  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2318  tetratricopeptide protein  35.43 
 
 		 573 aa  79.3  0.00000000000009  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0114  TPR repeat-containing protein  33.33 
 
 		 602 aa  79.3  0.0000000000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.606428  normal  0.312557 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1787  TPR repeat-containing protein  32.56 
 
 		 543 aa  79.3  0.0000000000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.662156  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3996  tetratricopeptide TPR_2  35.94 
 
 		 1694 aa  78.2  0.0000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.271204  normal  0.601264 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4626  TPR repeat-containing protein  27.45 
 
 		 452 aa  77.8  0.0000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0908  TPR repeat-containing protein  28.75 
 
 		 388 aa  76.6  0.0000000000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0882  TPR repeat-containing protein  28.75 
 
 		 388 aa  76.6  0.0000000000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0011  hypothetical protein  32.33 
 
 		 1138 aa  75.5  0.000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.41301  normal  0.0644501 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0301  TPR repeat-containing protein  33.59 
 
 		 1827 aa  75.9  0.000000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0698  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  31.11 
 
 		 784 aa  75.5  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1552  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  29.44 
 
 		 707 aa  75.1  0.000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0225548 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2975  TPR repeat-containing protein  28.48 
 
 		 716 aa  74.3  0.000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1793  TPR repeat-containing protein  32.59 
 
 		 213 aa  74.3  0.000000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2807  tetratricopeptide TPR_2  29.71 
 
 		 576 aa  74.3  0.000000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.233123 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0287  TPR repeat-containing protein  30.83 
 
 		 217 aa  74.3  0.000000000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.37702  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0087  TPR repeat-containing protein  27.78 
 
 		 366 aa  74.3  0.000000000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1172  TPR repeat-containing protein  33.59 
 
 		 4079 aa  73.9  0.000000000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3949  TPR repeat-containing protein  29.46 
 
 		 361 aa  73.6  0.000000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0637  TPR repeat-containing protein  34.13 
 
 		 4489 aa  73.6  0.000000000006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3209  tetratricopeptide repeat-containing protein  30.77 
 
 		 743 aa  73.6  0.000000000006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1312  TPR repeat-containing protein  31.34 
 
 		 1069 aa  72.4  0.00000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.530092  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0675  TPR repeat-containing protein  33.33 
 
 		 344 aa  72  0.00000000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0471  TPR repeat-containing protein  30.3 
 
 		 1297 aa  72.4  0.00000000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2893  O-linked N-acetylglucosamine transferase  30.23 
 
 		 397 aa  72  0.00000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.272299 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2403  tetratricopeptide TPR_4  27.27 
 
 		 267 aa  72  0.00000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000143988  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2065  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  31.91 
 
 		 465 aa  71.6  0.00000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.145613  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1773  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  30.71 
 
 		 466 aa  71.2  0.00000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1841  TPR repeat-containing protein  32.54 
 
 		 3035 aa  71.2  0.00000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0060  TPR repeat-containing protein  30.83 
 
 		 562 aa  70.9  0.00000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0955  tetratricopeptide TPR_2  28.08 
 
 		 635 aa  70.1  0.00000000007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.750671 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0709  TPR repeat-containing protein  30.07 
 
 		 465 aa  69.7  0.00000000008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1605  tetratricopeptide TPR_2  26.67 
 
 		 252 aa  68.9  0.0000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.790082 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2005  TPR repeat-containing protein  31.01 
 
 		 512 aa  68.9  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.915591 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4508  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.27 
 
 		 836 aa  68.9  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.885776 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2941  hypothetical protein  30.71 
 
 		 560 aa  68.6  0.0000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000171884  normal  0.0147454 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0454  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  31.86 
 
 		 357 aa  68.2  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1811  TPR repeat-containing protein  26.58 
 
 		 523 aa  68.6  0.0000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0321  TPR repeat-containing protein  29.46 
 
 		 162 aa  68.2  0.0000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4355  TPR repeat-containing protein  29.63 
 
 		 1192 aa  68.6  0.0000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.862224  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3569  tetratricopeptide TPR_2  27.27 
 
 		 314 aa  68.6  0.0000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1823  TPR repeat-containing protein  25 
 
 		 213 aa  67.4  0.0000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.510449  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0369  TPR repeat-containing protein  26.12 
 
 		 446 aa  67.4  0.0000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0484  TPR repeat-containing protein  30.82 
 
 		 435 aa  67.4  0.0000000004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0487  TPR repeat-containing protein  29.77 
 
 		 566 aa  67  0.0000000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.679539 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0195  TPR repeat-containing protein  30.51 
 
 		 247 aa  67  0.0000000005  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0471215  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0901  TPR repeat-containing protein  33.04 
 
 		 409 aa  66.6  0.0000000006  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3793  TPR repeat-containing protein  26.87 
 
 		 428 aa  66.6  0.0000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.085128 
 
 
-
 
NC_006680  CNK02410  general transcriptional repressor, putative  26.87 
 
 		 1101 aa  66.2  0.0000000008  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1000  TPR repeat-containing protein  27.27 
 
 		 486 aa  66.2  0.0000000008  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.326539  normal  0.768066 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2942  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.8 
 
 		 632 aa  66.2  0.0000000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1474  TPR repeat-containing protein  28 
 
 		 162 aa  66.2  0.0000000009  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0444734  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2212  TPR repeat-containing protein  28.15 
 
 		 1276 aa  65.5  0.000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.524691  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3507  protein prenyltransferase, alpha subunit  27.16 
 
 		 1007 aa  65.9  0.000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.223985 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1840  TPR repeat-containing protein  26.67 
 
 		 3560 aa  65.9  0.000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0564  TPR repeat-containing protein  27.78 
 
 		 202 aa  65.1  0.000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.151741 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  22.16 
 
 		 878 aa  65.1  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  27.13 
 
 		 810 aa  65.1  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2321  TPR repeat-containing protein  27.73 
 
 		 750 aa  64.7  0.000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1827  TPR repeat-containing protein  29.01 
 
 		 761 aa  65.5  0.000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0460239  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2318  TPR repeat-containing protein  28.24 
 
 		 245 aa  64.7  0.000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_863  predicted protein  26.12 
 
 		 708 aa  64.7  0.000000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.622244  normal  0.0203568 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2953  TPR repeat-containing protein  31.2 
 
 		 711 aa  64.3  0.000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0781794 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1451  TPR repeat-containing protein  31.43 
 
 		 244 aa  64.3  0.000000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.346129  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2895  O-linked N-acetylglucosamine transferase  28.15 
 
 		 292 aa  64.3  0.000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0140366 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0913  TPR repeat-containing protein  27.74 
 
 		 280 aa  63.9  0.000000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.249159  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0949  TPR repeat-containing protein  29.41 
 
 		 1121 aa  63.9  0.000000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0849269  normal  0.0980091 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1947  tetratricopeptide TPR_2  30.23 
 
 		 564 aa  63.9  0.000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0106408 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3201  TPR repeat-containing protein  30.23 
 
 		 955 aa  63.9  0.000000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0757905 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1622  TPR repeat-containing protein  33.64 
 
 		 254 aa  63.9  0.000000004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0641  TPR repeat-containing protein  30.49 
 
 		 1094 aa  63.9  0.000000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.230386  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1518  TPR repeat-containing protein  23.62 
 
 		 375 aa  63.9  0.000000005  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.946116  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2480  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  24.43 
 
 		 1022 aa  63.5  0.000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4726  serine/threonine protein kinase with TPR repeats  28.32 
 
 		 730 aa  63.2  0.000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1065  TPR repeat-containing protein  25.27 
 
 		 740 aa  63.5  0.000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.761998  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1653  TPR repeat-containing protein  27.86 
 
 		 466 aa  63.5  0.000000006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1344  TPR repeat-containing protein  26.57 
 
 		 471 aa  63.2  0.000000007  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.641665  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28701  hypothetical protein  28.33 
 
 		 582 aa  63.2  0.000000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0930  TPR repeat-containing protein  25.55 
 
 		 329 aa  63.2  0.000000007  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0540  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  24.24 
 
 		 1056 aa  63.2  0.000000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0423513  normal  0.0609988 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0481  TPR repeat-containing protein  28.24 
 
 		 3145 aa  63.2  0.000000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.948354 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0216  TPR repeat-containing protein  28 
 
 		 296 aa  62.8  0.00000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2468  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  25.81 
 
 		 629 aa  62.4  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0996556  normal  0.406351 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2742  tetratricopeptide TPR_2  30.97 
 
 		 390 aa  62.8  0.00000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.890739  normal  0.21285 
 
 
-
 
NC_013163  Cyan8802_4605  TPR repeat-containing protein  26.85 
 
 		 279 aa  61.6  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1876  TPR repeat-containing protein  31.48 
 
 		 123 aa  62  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1850  TPR repeat-containing protein  31.48 
 
 		 123 aa  62  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28721  hypothetical protein  27.83 
 
 		 706 aa  61.6  0.00000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0858  TPR repeat-containing protein  31.31 
 
 		 589 aa  62  0.00000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0278  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  32.32 
 
 		 207 aa  61.6  0.00000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00000289042  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>