More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mhun_2318 on replicon NC_007796
Organism: Methanospirillum hungatei JF-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007796  Mhun_2318  TPR repeat-containing protein  100 
 
 
245 aa  505  9.999999999999999e-143  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1361  TPR repeat-containing protein  31.92 
 
 
1276 aa  144  1e-33  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1787  TPR repeat-containing protein  34.48 
 
 
543 aa  142  5e-33  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.662156  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0114  TPR repeat-containing protein  33.62 
 
 
602 aa  140  9.999999999999999e-33  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.606428  normal  0.312557 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0060  TPR repeat-containing protein  28.86 
 
 
562 aa  133  1.9999999999999998e-30  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3996  tetratricopeptide TPR_2  34.08 
 
 
1694 aa  133  1.9999999999999998e-30  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.271204  normal  0.601264 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2604  TPR repeat-containing protein  31.84 
 
 
927 aa  132  6e-30  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.010408  normal  0.426767 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4726  serine/threonine protein kinase with TPR repeats  31.8 
 
 
730 aa  130  2.0000000000000002e-29  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1172  TPR repeat-containing protein  33.93 
 
 
4079 aa  127  2.0000000000000002e-28  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0087  TPR repeat-containing protein  32.2 
 
 
366 aa  126  3e-28  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0157  TPR repeat-containing protein  27.8 
 
 
465 aa  126  4.0000000000000003e-28  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0774  tetratricopeptide TPR_2  31.63 
 
 
519 aa  123  3e-27  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.169881  normal  0.452711 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0930  TPR repeat-containing protein  28.57 
 
 
329 aa  121  9.999999999999999e-27  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0675  TPR repeat-containing protein  32.59 
 
 
344 aa  119  3.9999999999999996e-26  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0637  TPR repeat-containing protein  30.05 
 
 
4489 aa  117  9.999999999999999e-26  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2406  tetratricopeptide TPR_2  27.83 
 
 
436 aa  115  6e-25  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2953  TPR repeat-containing protein  27.06 
 
 
711 aa  115  7.999999999999999e-25  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0781794 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3643  TPR domain-containing protein  31.48 
 
 
1979 aa  113  2.0000000000000002e-24  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2680  peptidase S41  33.18 
 
 
745 aa  113  2.0000000000000002e-24  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.20871  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0225  TPR repeat-containing protein  29.74 
 
 
414 aa  113  2.0000000000000002e-24  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0698  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  30 
 
 
784 aa  113  2.0000000000000002e-24  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0641  TPR repeat-containing protein  28.82 
 
 
1094 aa  113  2.0000000000000002e-24  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.230386  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1451  TPR repeat-containing protein  32.52 
 
 
244 aa  112  5e-24  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.346129  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2807  tetratricopeptide TPR_2  28.44 
 
 
576 aa  112  5e-24  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.233123 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1782  TPR repeat-containing protein  29.15 
 
 
467 aa  112  8.000000000000001e-24  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0011  hypothetical protein  27.52 
 
 
1138 aa  111  1.0000000000000001e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.41301  normal  0.0644501 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2893  O-linked N-acetylglucosamine transferase  30.28 
 
 
397 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.272299 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2318  tetratricopeptide protein  28.91 
 
 
573 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2321  TPR repeat-containing protein  29.56 
 
 
750 aa  109  3e-23  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3507  protein prenyltransferase, alpha subunit  25.43 
 
 
1007 aa  107  2e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.223985 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3049  TPR repeat-containing protein  30.34 
 
 
591 aa  107  2e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000157665  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1947  tetratricopeptide TPR_2  23.63 
 
 
564 aa  105  8e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0106408 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3569  tetratricopeptide TPR_2  25.69 
 
 
314 aa  105  8e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2367  protein kinase  33.14 
 
 
623 aa  104  1e-21  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2005  TPR repeat-containing protein  27.88 
 
 
512 aa  104  1e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.915591 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2895  O-linked N-acetylglucosamine transferase  27.43 
 
 
292 aa  103  2e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0140366 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1841  TPR repeat-containing protein  33.53 
 
 
3035 aa  103  2e-21  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  27.07 
 
 
878 aa  104  2e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  26.79 
 
 
810 aa  103  3e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0564  TPR repeat-containing protein  31.52 
 
 
202 aa  102  4e-21  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.151741 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1065  TPR repeat-containing protein  28.1 
 
 
740 aa  102  6e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.761998  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2491  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.7 
 
 
689 aa  102  8e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1552  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  25.81 
 
 
707 aa  101  1e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0225548 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0955  tetratricopeptide TPR_2  27.6 
 
 
635 aa  101  1e-20  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.750671 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_13031  TPR repeat-containing protein  27.15 
 
 
306 aa  101  1e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0823406 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1238  TPR repeat-containing protein  28.44 
 
 
377 aa  101  1e-20  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0823  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.72 
 
 
296 aa  100  2e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0401477 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2320  TPR repeat-containing protein  26.44 
 
 
617 aa  100  2e-20  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2942  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.38 
 
 
632 aa  100  3e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1811  TPR repeat-containing protein  30.65 
 
 
523 aa  100  3e-20  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0959  hypothetical protein  30.56 
 
 
620 aa  100  3e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.868556 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3028  TPR repeat-containing protein  30.56 
 
 
620 aa  99.8  4e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.985806  normal  0.0142271 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1362  TPR repeat-containing protein  24.76 
 
 
376 aa  99.4  4e-20  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1840  TPR repeat-containing protein  25.24 
 
 
3560 aa  99.8  4e-20  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0336  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.48 
 
 
297 aa  99  6e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0329  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.48 
 
 
297 aa  99  7e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1312  TPR repeat-containing protein  27.87 
 
 
1069 aa  98.6  8e-20  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.530092  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3062  hypothetical protein  27.15 
 
 
391 aa  97.8  1e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.386129 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3209  tetratricopeptide repeat-containing protein  30.91 
 
 
743 aa  98.2  1e-19  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0287  TPR repeat-containing protein  28.81 
 
 
217 aa  98.2  1e-19  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.37702  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1019  TPR repeat-containing protein  28.38 
 
 
273 aa  97.8  1e-19  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1342  TPR repeat-containing protein  27.54 
 
 
391 aa  97.1  2e-19  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0722  TPR repeat-containing protein  29.49 
 
 
615 aa  97.1  3e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.434562 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2322  TPR repeat-containing protein  30.54 
 
 
935 aa  96.3  4e-19  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0205826 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0384  TPR repeat-containing protein  24.31 
 
 
279 aa  95.9  5e-19  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.890218  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0629  TPR repeat-containing protein  30.05 
 
 
1049 aa  95.5  6e-19  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1619  TPR domain-containing protein  28.57 
 
 
626 aa  95.5  7e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0978258  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2951  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  24.78 
 
 
784 aa  95.5  7e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0783  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.23 
 
 
542 aa  95.1  8e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1699  TPR repeat-containing protein  26.96 
 
 
409 aa  95.5  8e-19  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.52405  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0709  TPR repeat-containing protein  28.91 
 
 
465 aa  95.1  9e-19  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3201  TPR repeat-containing protein  29.13 
 
 
955 aa  93.6  2e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.0757905 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4355  TPR repeat-containing protein  26.83 
 
 
1192 aa  94  2e-18  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.862224  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2431  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  24.34 
 
 
818 aa  94.4  2e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0035  TPR repeat-containing protein  27.44 
 
 
402 aa  93.6  3e-18  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.446314  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0901  TPR repeat-containing protein  27.45 
 
 
409 aa  93.6  3e-18  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0471  TPR repeat-containing protein  31.79 
 
 
1297 aa  93.2  4e-18  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3793  TPR repeat-containing protein  24.12 
 
 
428 aa  92.8  4e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.085128 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1344  TPR repeat-containing protein  29.05 
 
 
471 aa  92.8  4e-18  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.641665  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1796  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.96 
 
 
465 aa  92.8  4e-18  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.769841  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0453  TPR domain-containing protein  29.29 
 
 
626 aa  92.4  5e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.311085  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0280  TPR domain-containing protein  26.44 
 
 
1013 aa  92.8  5e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.416311 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28481  hypothetical protein  28.02 
 
 
462 aa  92.4  6e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1146  hypothetical protein  26 
 
 
299 aa  92.4  6e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1605  tetratricopeptide TPR_2  25.21 
 
 
252 aa  92.4  6e-18  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.790082 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2383  TPR repeat-containing protein  26.34 
 
 
1421 aa  92.4  6e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.823331 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3015  TPR domain-containing protein  29.29 
 
 
626 aa  92  7e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0177  TPR repeat-containing protein  29.29 
 
 
614 aa  92.4  7e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2906  TPR repeat-containing protein  29.29 
 
 
614 aa  92  7e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0475913  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2599  TPR domain-containing protein  29.29 
 
 
614 aa  92.4  7e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0734298  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0970  TPR domain-containing protein  29.29 
 
 
614 aa  92.4  7e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0163  TPR repeat-containing protein  27.68 
 
 
356 aa  92  8e-18  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00233758  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4492  TPR repeat-containing protein  24.57 
 
 
605 aa  92  8e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2967  TPR repeat-containing protein  28.11 
 
 
614 aa  92  8e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2322  TPR repeat-containing protein  28.05 
 
 
352 aa  91.3  1e-17  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1449  tetratricopeptide TPR_2  28.91 
 
 
1067 aa  91.3  1e-17  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2560  tetratricopeptide TPR_2  28.82 
 
 
309 aa  91.3  1e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1773  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.08 
 
 
466 aa  90.9  2e-17  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2288  TPR repeat-containing protein  28.18 
 
 
740 aa  90.5  2e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4626  TPR repeat-containing protein  25.59 
 
 
452 aa  90.9  2e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>