More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mboo_0321 on replicon NC_009712
Organism: Candidatus Methanoregula boonei 6A8



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009712  Mboo_0321  TPR repeat-containing protein  100 
 
 
162 aa  331  2e-90  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2941  hypothetical protein  46.72 
 
 
560 aa  137  6e-32  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000171884  normal  0.0147454 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3996  tetratricopeptide TPR_2  42.11 
 
 
1694 aa  134  4e-31  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.271204  normal  0.601264 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1361  TPR repeat-containing protein  46.21 
 
 
1276 aa  133  9.999999999999999e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4626  TPR repeat-containing protein  41.1 
 
 
452 aa  126  2.0000000000000002e-28  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2975  TPR repeat-containing protein  40.82 
 
 
716 aa  123  8.000000000000001e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5004  TPR repeat-containing protein  42.48 
 
 
699 aa  121  5e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0637  TPR repeat-containing protein  43.36 
 
 
4489 aa  120  9e-27  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1552  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  39.86 
 
 
707 aa  119  1.9999999999999998e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0225548 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2604  TPR repeat-containing protein  39.07 
 
 
927 aa  117  4.9999999999999996e-26  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.010408  normal  0.426767 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0301  TPR repeat-containing protein  39.31 
 
 
1827 aa  116  9.999999999999999e-26  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0641  TPR repeat-containing protein  44.9 
 
 
1094 aa  116  9.999999999999999e-26  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.230386  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4439  Tetratricopeptide TPR_4  45.31 
 
 
715 aa  114  6.9999999999999995e-25  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4355  TPR repeat-containing protein  38.89 
 
 
1192 aa  112  2.0000000000000002e-24  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.862224  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3949  TPR repeat-containing protein  37.68 
 
 
361 aa  111  4.0000000000000004e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1426  TPR repeat-containing protein  44.19 
 
 
574 aa  111  4.0000000000000004e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3209  tetratricopeptide repeat-containing protein  38.3 
 
 
743 aa  111  5e-24  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1793  TPR repeat-containing protein  40.88 
 
 
213 aa  111  5e-24  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2322  TPR repeat-containing protein  41.73 
 
 
352 aa  111  5e-24  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1172  TPR repeat-containing protein  37.58 
 
 
4079 aa  110  8.000000000000001e-24  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1823  TPR repeat-containing protein  39.42 
 
 
213 aa  110  9e-24  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.510449  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1841  TPR repeat-containing protein  39.85 
 
 
3035 aa  109  2.0000000000000002e-23  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2212  TPR repeat-containing protein  40.77 
 
 
1276 aa  108  2.0000000000000002e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.524691  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3507  protein prenyltransferase, alpha subunit  39.46 
 
 
1007 aa  108  2.0000000000000002e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.223985 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7349  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  38.96 
 
 
988 aa  108  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0738846  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2318  tetratricopeptide protein  36.3 
 
 
573 aa  109  2.0000000000000002e-23  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3569  tetratricopeptide TPR_2  42.75 
 
 
314 aa  109  2.0000000000000002e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0060  TPR repeat-containing protein  42.42 
 
 
562 aa  108  3e-23  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0191  TPR repeat-containing protein  41.01 
 
 
250 aa  108  4.0000000000000004e-23  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.641193  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28501  hypothetical protein  41.43 
 
 
706 aa  108  4.0000000000000004e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2320  TPR repeat-containing protein  39.13 
 
 
617 aa  107  5e-23  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1787  TPR repeat-containing protein  35.38 
 
 
543 aa  107  5e-23  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.662156  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0908  TPR repeat-containing protein  36.73 
 
 
388 aa  107  6e-23  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1840  TPR repeat-containing protein  45.74 
 
 
3560 aa  107  6e-23  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2005  TPR repeat-containing protein  36.81 
 
 
512 aa  107  6e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.915591 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0882  TPR repeat-containing protein  36.73 
 
 
388 aa  107  6e-23  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  36.73 
 
 
878 aa  107  8.000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3016  TPR/sulfotransferase domain-containing protein  42.86 
 
 
577 aa  107  8.000000000000001e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4508  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  34.23 
 
 
836 aa  107  9.000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.885776 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  38.1 
 
 
810 aa  106  1e-22  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6182  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  36.67 
 
 
1056 aa  106  1e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0114  TPR repeat-containing protein  36.42 
 
 
602 aa  107  1e-22  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.606428  normal  0.312557 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1568  hypothetical protein  36.17 
 
 
820 aa  106  1e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0564  TPR repeat-containing protein  37.5 
 
 
202 aa  105  2e-22  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.151741 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3801  TPR repeat-containing protein  40.82 
 
 
713 aa  105  2e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.386604  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1451  TPR repeat-containing protein  38.37 
 
 
244 aa  105  3e-22  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.346129  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2349  TPR repeat-containing protein  38.1 
 
 
649 aa  105  3e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0186841  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28721  hypothetical protein  37.29 
 
 
706 aa  105  4e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3643  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  40.44 
 
 
406 aa  105  4e-22  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1811  TPR repeat-containing protein  39.19 
 
 
523 aa  104  4e-22  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2471  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  40.44 
 
 
406 aa  105  4e-22  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0400427  normal  0.45906 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2480  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  36 
 
 
1022 aa  104  5e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2953  TPR repeat-containing protein  37.5 
 
 
711 aa  103  7e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0781794 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3643  TPR domain-containing protein  34.72 
 
 
1979 aa  103  1e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28481  hypothetical protein  40 
 
 
462 aa  103  1e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2742  tetratricopeptide TPR_2  36.54 
 
 
390 aa  102  2e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.890739  normal  0.21285 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28681  hypothetical protein  39.33 
 
 
539 aa  101  3e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.71597 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2431  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  36.36 
 
 
818 aa  101  3e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0755  TPR repeat-containing protein  38.81 
 
 
662 aa  101  4e-21  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.466717  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0540  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  36.36 
 
 
1056 aa  100  6e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0423513  normal  0.0609988 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2370  TPR repeat-containing protein  39.55 
 
 
425 aa  100  1e-20  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00134041  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_13031  TPR repeat-containing protein  40.56 
 
 
306 aa  99  2e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0823406 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2951  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  36.36 
 
 
784 aa  99.4  2e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2367  protein kinase  35.66 
 
 
623 aa  99.4  2e-20  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1065  TPR repeat-containing protein  40.6 
 
 
740 aa  99  2e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.761998  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2893  O-linked N-acetylglucosamine transferase  33.09 
 
 
397 aa  98.6  3e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.272299 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0698  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  39.71 
 
 
784 aa  98.2  4e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013163  Cyan8802_4605  TPR repeat-containing protein  35.17 
 
 
279 aa  98.2  4e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1825  TPR repeat-containing protein  35 
 
 
523 aa  97.8  5e-20  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.578572  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2680  peptidase S41  36.11 
 
 
745 aa  97.8  5e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.20871  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2994  hypothetical protein  31.97 
 
 
417 aa  97.4  6e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.542641  normal  0.0105744 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28711  hypothetical protein  39.86 
 
 
334 aa  97.8  6e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3808  TPR repeat-containing protein  42.06 
 
 
578 aa  96.3  1e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.556982 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1178  TPR repeat-containing protein  37.5 
 
 
280 aa  97.1  1e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0308  TPR repeat-containing protein  40.74 
 
 
636 aa  96.7  1e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00465819 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1622  TPR repeat-containing protein  36.3 
 
 
254 aa  95.5  2e-19  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3201  TPR repeat-containing protein  34.93 
 
 
955 aa  95.5  3e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.0757905 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0087  TPR repeat-containing protein  34.07 
 
 
366 aa  95.1  3e-19  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0121  TPR repeat-containing protein  37.61 
 
 
732 aa  95.1  3e-19  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.261868  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4726  serine/threonine protein kinase with TPR repeats  33.82 
 
 
730 aa  95.1  3e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2942  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  35.04 
 
 
632 aa  94.7  4e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1312  TPR repeat-containing protein  40.71 
 
 
1069 aa  95.1  4e-19  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.530092  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1947  tetratricopeptide TPR_2  36.69 
 
 
564 aa  94.7  4e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0106408 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1474  TPR repeat-containing protein  38.52 
 
 
162 aa  94.4  6e-19  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0444734  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3314  tetratricopeptide TPR_2  30.2 
 
 
1240 aa  93.6  1e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.689174  normal  0.286856 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1233  TPR repeat-containing protein  39.31 
 
 
909 aa  92.8  2e-18  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.161918  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0384  TPR repeat-containing protein  33.33 
 
 
279 aa  92.4  2e-18  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.890218  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0157  TPR repeat-containing protein  35.61 
 
 
465 aa  92.8  2e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28701  hypothetical protein  39.1 
 
 
582 aa  91.7  3e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28691  hypothetical protein  38 
 
 
306 aa  92  3e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0675  TPR repeat-containing protein  36.5 
 
 
344 aa  91.7  4e-18  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2461  hypothetical protein  33.56 
 
 
398 aa  91.7  4e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.125521  normal  0.0258605 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4728  TPR repeat-containing protein  38.85 
 
 
718 aa  91.3  5e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.346608 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1827  TPR repeat-containing protein  34.03 
 
 
761 aa  90.9  6e-18  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0460239  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1619  TPR domain-containing protein  33.33 
 
 
626 aa  90.5  8e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0978258  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1362  TPR repeat-containing protein  33.33 
 
 
376 aa  90.5  9e-18  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0783  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  40 
 
 
542 aa  90.5  9e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1605  tetratricopeptide TPR_2  35.86 
 
 
252 aa  90.5  9e-18  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.790082 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18211  hypothetical protein  41.01 
 
 
603 aa  90.5  9e-18  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.905605 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1683  TPR repeat-containing protein  38.36 
 
 
362 aa  90.5  1e-17  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>