More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mhun_1793 on replicon NC_007796
Organism: Methanospirillum hungatei JF-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007796  Mhun_1793  TPR repeat-containing protein  100 
 
 
213 aa  429  1e-119  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1361  TPR repeat-containing protein  42.35 
 
 
1276 aa  146  3e-34  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2941  hypothetical protein  38.54 
 
 
560 aa  145  4.0000000000000006e-34  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000171884  normal  0.0147454 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3996  tetratricopeptide TPR_2  41.92 
 
 
1694 aa  145  4.0000000000000006e-34  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.271204  normal  0.601264 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0641  TPR repeat-containing protein  42.7 
 
 
1094 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.230386  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1840  TPR repeat-containing protein  38.79 
 
 
3560 aa  136  2e-31  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1841  TPR repeat-containing protein  41.28 
 
 
3035 aa  136  2e-31  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2604  TPR repeat-containing protein  38.76 
 
 
927 aa  135  5e-31  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.010408  normal  0.426767 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1787  TPR repeat-containing protein  37.3 
 
 
543 aa  132  5e-30  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.662156  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0637  TPR repeat-containing protein  40 
 
 
4489 aa  130  1.0000000000000001e-29  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7349  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  38.89 
 
 
988 aa  130  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0738846  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0114  TPR repeat-containing protein  42.07 
 
 
602 aa  129  4.0000000000000003e-29  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.606428  normal  0.312557 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2318  tetratricopeptide protein  38.32 
 
 
573 aa  128  5.0000000000000004e-29  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4626  TPR repeat-containing protein  34.1 
 
 
452 aa  125  3e-28  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2480  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  34.27 
 
 
1022 aa  122  4e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6182  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  39.51 
 
 
1056 aa  120  9.999999999999999e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2951  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  36.16 
 
 
784 aa  120  9.999999999999999e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0564  TPR repeat-containing protein  40.79 
 
 
202 aa  119  3.9999999999999996e-26  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.151741 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2893  O-linked N-acetylglucosamine transferase  39.51 
 
 
397 aa  119  3.9999999999999996e-26  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.272299 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2942  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  35.06 
 
 
632 aa  119  3.9999999999999996e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  40.12 
 
 
878 aa  117  9e-26  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  38.04 
 
 
810 aa  116  1.9999999999999998e-25  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2431  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  35.03 
 
 
818 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2349  TPR repeat-containing protein  33.9 
 
 
649 aa  116  3e-25  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0186841  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1552  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  36.47 
 
 
707 aa  115  5e-25  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0225548 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2680  peptidase S41  34.93 
 
 
745 aa  115  6e-25  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.20871  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2322  TPR repeat-containing protein  40.79 
 
 
352 aa  114  6.9999999999999995e-25  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0540  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  35.8 
 
 
1056 aa  115  6.9999999999999995e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0423513  normal  0.0609988 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3507  protein prenyltransferase, alpha subunit  42.24 
 
 
1007 aa  114  1.0000000000000001e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.223985 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3569  tetratricopeptide TPR_2  33.73 
 
 
314 aa  114  1.0000000000000001e-24  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1172  TPR repeat-containing protein  38.89 
 
 
4079 aa  113  2.0000000000000002e-24  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1065  TPR repeat-containing protein  37.75 
 
 
740 aa  113  2.0000000000000002e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.761998  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0301  TPR repeat-containing protein  35.33 
 
 
1827 aa  113  2.0000000000000002e-24  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1568  hypothetical protein  32.14 
 
 
820 aa  112  3e-24  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2367  protein kinase  34.16 
 
 
623 aa  112  4.0000000000000004e-24  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0060  TPR repeat-containing protein  36.67 
 
 
562 aa  112  5e-24  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1451  TPR repeat-containing protein  37.58 
 
 
244 aa  112  5e-24  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.346129  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3209  tetratricopeptide repeat-containing protein  32.97 
 
 
743 aa  111  9e-24  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4508  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  38.04 
 
 
836 aa  110  1.0000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.885776 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0321  TPR repeat-containing protein  40.88 
 
 
162 aa  111  1.0000000000000001e-23  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2994  hypothetical protein  36.53 
 
 
417 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.542641  normal  0.0105744 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0191  TPR repeat-containing protein  37.41 
 
 
250 aa  110  2.0000000000000002e-23  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.641193  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0087  TPR repeat-containing protein  35.98 
 
 
366 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1474  TPR repeat-containing protein  42.64 
 
 
162 aa  109  3e-23  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0444734  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2005  TPR repeat-containing protein  36.05 
 
 
512 aa  109  3e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.915591 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2975  TPR repeat-containing protein  35.93 
 
 
716 aa  108  4.0000000000000004e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1811  TPR repeat-containing protein  36.93 
 
 
523 aa  108  6e-23  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1825  TPR repeat-containing protein  37.25 
 
 
523 aa  108  8.000000000000001e-23  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.578572  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0011  hypothetical protein  38.46 
 
 
1138 aa  107  1e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.41301  normal  0.0644501 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3643  TPR domain-containing protein  34.34 
 
 
1979 aa  107  1e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0698  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  34.88 
 
 
784 aa  107  1e-22  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0157  TPR repeat-containing protein  33.33 
 
 
465 aa  107  2e-22  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4355  TPR repeat-containing protein  31.72 
 
 
1192 aa  106  2e-22  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.862224  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2328  TPR repeat-containing protein  33.82 
 
 
363 aa  107  2e-22  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.759887 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2320  TPR repeat-containing protein  32.98 
 
 
617 aa  105  3e-22  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5004  TPR repeat-containing protein  35.19 
 
 
699 aa  106  3e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2953  TPR repeat-containing protein  36.7 
 
 
711 aa  105  3e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0781794 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0675  TPR repeat-containing protein  32.02 
 
 
344 aa  105  4e-22  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8213  TPR repeat-containing protein  33.53 
 
 
392 aa  105  6e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0720948  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0099  TPR repeat-containing protein  33.51 
 
 
243 aa  105  6e-22  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3016  TPR/sulfotransferase domain-containing protein  38.71 
 
 
577 aa  105  6e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1426  TPR repeat-containing protein  37.97 
 
 
574 aa  105  6e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0121  TPR repeat-containing protein  29.41 
 
 
732 aa  105  7e-22  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.261868  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28501  hypothetical protein  32.76 
 
 
706 aa  104  9e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0755  TPR repeat-containing protein  36.25 
 
 
662 aa  103  2e-21  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.466717  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2212  TPR repeat-containing protein  37.5 
 
 
1276 aa  103  2e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.524691  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0955  tetratricopeptide TPR_2  32.39 
 
 
635 aa  103  2e-21  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.750671 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1622  TPR repeat-containing protein  32.62 
 
 
254 aa  103  2e-21  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28721  hypothetical protein  32.89 
 
 
706 aa  102  3e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2370  TPR repeat-containing protein  38.99 
 
 
425 aa  102  3e-21  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00134041  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3533  SPINDLY family O-linked N-acetylglucosamine transferase  37.29 
 
 
742 aa  103  3e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3201  TPR repeat-containing protein  35.29 
 
 
955 aa  101  8e-21  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.0757905 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0225  TPR repeat-containing protein  36.48 
 
 
414 aa  101  8e-21  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0949  TPR repeat-containing protein  32.47 
 
 
1121 aa  101  9e-21  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0849269  normal  0.0980091 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0629  TPR repeat-containing protein  35.12 
 
 
1049 aa  100  1e-20  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28701  hypothetical protein  34.52 
 
 
582 aa  100  1e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4439  Tetratricopeptide TPR_4  35.15 
 
 
715 aa  100  2e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3801  TPR repeat-containing protein  33.95 
 
 
713 aa  99.8  2e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.386604  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1827  TPR repeat-containing protein  32.74 
 
 
761 aa  100  2e-20  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0460239  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3047  tetratricopeptide TPR_2  33.13 
 
 
508 aa  100  2e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0595686  hitchhiker  0.00892549 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4726  serine/threonine protein kinase with TPR repeats  31.43 
 
 
730 aa  99.8  3e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5618  SPINDLY family O-linked N-acetylglucosamine transferase  37.29 
 
 
739 aa  99.4  3e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.645263 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28681  hypothetical protein  31.07 
 
 
539 aa  99.8  3e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.71597 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0384  TPR repeat-containing protein  36.5 
 
 
279 aa  99  5e-20  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.890218  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3028  TPR repeat-containing protein  34.78 
 
 
620 aa  99  5e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.985806  normal  0.0142271 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7855  TPR domain-containing protein  37.35 
 
 
648 aa  98.6  5e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.126864 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2322  TPR repeat-containing protein  38.89 
 
 
935 aa  99  5e-20  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0205826 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2807  tetratricopeptide TPR_2  32.97 
 
 
576 aa  98.2  7e-20  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.233123 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0287  TPR repeat-containing protein  33.52 
 
 
217 aa  96.7  2e-19  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.37702  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1362  TPR repeat-containing protein  33.53 
 
 
376 aa  96.3  3e-19  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5617  SPINDLY family O-linked N-acetylglucosamine transferase  36.93 
 
 
739 aa  96.3  3e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.277247 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0930  TPR repeat-containing protein  30.59 
 
 
329 aa  96.3  3e-19  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0308  TPR repeat-containing protein  35.62 
 
 
636 aa  96.3  3e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00465819 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28481  hypothetical protein  32.72 
 
 
462 aa  96.3  3e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1619  TPR domain-containing protein  32.93 
 
 
626 aa  95.9  4e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0978258  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4611  TPR domain-containing protein  33.33 
 
 
615 aa  95.9  4e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.100536 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0959  hypothetical protein  33.14 
 
 
620 aa  95.9  4e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.868556 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4282  TPR repeat-containing protein  32.18 
 
 
715 aa  95.5  5e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0955  TPR repeat-containing protein  37.95 
 
 
637 aa  95.5  6e-19  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5131  TPR repeat-containing protein  32.21 
 
 
361 aa  95.1  7e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000131061 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>