More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CNK02410 on replicon NC_006680
Organism: Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006680  CNK02410  general transcriptional repressor, putative  100 
 
 
1101 aa  2231    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_66638  glucose repression mediator protein  60.52 
 
 
815 aa  490  1e-137  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0157  TPR repeat-containing protein  26.1 
 
 
465 aa  121  7e-26  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_85888  transcription factor which mediates glucose repression  26.82 
 
 
669 aa  115  4.0000000000000004e-24  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1361  TPR repeat-containing protein  25.97 
 
 
1276 aa  110  1e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  24.64 
 
 
878 aa  106  2e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  23.5 
 
 
810 aa  104  8e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2895  O-linked N-acetylglucosamine transferase  24.92 
 
 
292 aa  102  3e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0140366 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1699  TPR repeat-containing protein  24.49 
 
 
409 aa  100  1e-19  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.52405  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2807  tetratricopeptide TPR_2  25 
 
 
576 aa  100  2e-19  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.233123 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3643  TPR domain-containing protein  24.85 
 
 
1979 aa  98.6  6e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0213  TPR repeat-containing protein  22.38 
 
 
409 aa  97.8  9e-19  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0901  TPR repeat-containing protein  24.93 
 
 
409 aa  96.7  2e-18  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2942  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24.68 
 
 
632 aa  95.1  6e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0060  TPR repeat-containing protein  24.85 
 
 
562 aa  95.1  7e-18  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2491  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.61 
 
 
689 aa  91.7  7e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1356  beta-lactamase domain-containing protein  25.31 
 
 
833 aa  90.5  2e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2321  TPR repeat-containing protein  24.13 
 
 
750 aa  90.1  2e-16  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2893  O-linked N-acetylglucosamine transferase  22.78 
 
 
397 aa  89  5e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.272299 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2604  TPR repeat-containing protein  22.01 
 
 
927 aa  88.6  6e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.010408  normal  0.426767 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5110  TPR repeat-containing protein  30.17 
 
 
288 aa  88.6  7e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.163263  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3996  tetratricopeptide TPR_2  25.14 
 
 
1694 aa  88.2  7e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.271204  normal  0.601264 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0481  TPR repeat-containing protein  25.16 
 
 
3145 aa  87.8  0.000000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.948354 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4770  sulfotransferase  23.88 
 
 
887 aa  85.1  0.000000000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.185793 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0996  TPR repeat-containing protein  25.68 
 
 
634 aa  85.1  0.000000000000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.325764  normal  0.0470836 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0087  TPR repeat-containing protein  25.69 
 
 
366 aa  85.1  0.000000000000008  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0693  TPR repeat-containing protein  24.15 
 
 
395 aa  84.3  0.00000000000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0712051  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0930  TPR repeat-containing protein  20.69 
 
 
329 aa  84.3  0.00000000000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2947  tetratricopeptide TPR_2  21.47 
 
 
321 aa  84.3  0.00000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.708581 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0133  TPR repeat-containing protein  24.52 
 
 
393 aa  83.6  0.00000000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.310931  normal  0.0473724 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0099  TPR repeat-containing protein  25.97 
 
 
243 aa  83.2  0.00000000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7349  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  22.79 
 
 
988 aa  83.2  0.00000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0738846  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0661  TPR repeat-containing methyltransferase  25.56 
 
 
561 aa  82.4  0.00000000000004  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.25847  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1619  TPR domain-containing protein  26.34 
 
 
626 aa  82  0.00000000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0978258  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0629  TPR repeat-containing protein  24.11 
 
 
1049 aa  81.6  0.00000000000008  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3772  serine/threonine protein kinase with TPR repeats  25.95 
 
 
863 aa  81.3  0.00000000000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0011  hypothetical protein  23.34 
 
 
1138 aa  81.3  0.0000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.41301  normal  0.0644501 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2854  glycosyl transferase family 2  25.84 
 
 
1252 aa  80.5  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.956112  normal  0.0955707 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3213  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  23.78 
 
 
639 aa  80.5  0.0000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000022774  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0913  TPR repeat-containing protein  28.42 
 
 
280 aa  80.5  0.0000000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.249159  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0955  tetratricopeptide TPR_2  20.82 
 
 
635 aa  80.1  0.0000000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.750671 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0858  TPR repeat-containing protein  26.67 
 
 
589 aa  80.5  0.0000000000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2708  tetratricopeptide TPR_2  22.46 
 
 
979 aa  80.5  0.0000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.169437 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1172  TPR repeat-containing protein  27.97 
 
 
4079 aa  79.7  0.0000000000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0384  TPR repeat-containing protein  24.07 
 
 
279 aa  79.7  0.0000000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.890218  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1516  tetratricopeptide repeat family protein  25.28 
 
 
561 aa  79.3  0.0000000000003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1552  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  22.89 
 
 
707 aa  79.3  0.0000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0225548 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1312  TPR repeat-containing protein  22.76 
 
 
1069 aa  79  0.0000000000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.530092  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1770  TPR repeat-containing protein  24.11 
 
 
393 aa  79.3  0.0000000000004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.452955  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6182  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  23.1 
 
 
1056 aa  79  0.0000000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3267  glycosyl transferase family 2  25.47 
 
 
1252 aa  79  0.0000000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2403  tetratricopeptide TPR_4  27.69 
 
 
267 aa  78.6  0.0000000000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000143988  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1518  TPR repeat-containing protein  21.99 
 
 
375 aa  77.8  0.000000000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.946116  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24101  hypothetical protein  25 
 
 
725 aa  77.8  0.000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4239  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24.49 
 
 
363 aa  77.4  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02941  hypothetical protein  22.86 
 
 
1676 aa  77.8  0.000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.673691 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2461  hypothetical protein  23.97 
 
 
398 aa  77  0.000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.125521  normal  0.0258605 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1142  TPR repeat-containing protein  24.89 
 
 
331 aa  77.4  0.000000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4301  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24.49 
 
 
363 aa  76.6  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.124533 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1947  tetratricopeptide TPR_2  20.32 
 
 
564 aa  77  0.000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0106408 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0698  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  23.37 
 
 
784 aa  76.3  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1796  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  23.73 
 
 
465 aa  76.6  0.000000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.769841  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1492  glycosyl transferase family protein  20.13 
 
 
1737 aa  76.3  0.000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.315595  normal  0.552274 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0453  TPR domain-containing protein  26.04 
 
 
626 aa  75.9  0.000000000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.311085  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2599  TPR domain-containing protein  26.04 
 
 
614 aa  75.9  0.000000000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0734298  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3015  TPR domain-containing protein  26.04 
 
 
626 aa  75.5  0.000000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0970  TPR domain-containing protein  26.04 
 
 
614 aa  75.9  0.000000000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0177  TPR repeat-containing protein  26.04 
 
 
614 aa  75.9  0.000000000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2906  TPR repeat-containing protein  26.04 
 
 
614 aa  75.5  0.000000000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0475913  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2480  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  21.82 
 
 
1022 aa  75.1  0.000000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2555  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.27 
 
 
804 aa  75.5  0.000000000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.152731  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2967  TPR repeat-containing protein  26.04 
 
 
614 aa  75.1  0.000000000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1704  TPR repeat-containing protein  25.6 
 
 
265 aa  74.7  0.000000000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.12979e-21 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1787  TPR repeat-containing protein  24.78 
 
 
543 aa  74.3  0.00000000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.662156  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0823  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  23.15 
 
 
296 aa  74.7  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0401477 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2953  TPR repeat-containing protein  22.93 
 
 
711 aa  74.3  0.00000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0781794 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0447  TPR domain-containing protein  23.65 
 
 
992 aa  73.9  0.00000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.000620141  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4726  serine/threonine protein kinase with TPR repeats  20.16 
 
 
730 aa  73.9  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2231  TPR repeat-containing protein  29.07 
 
 
265 aa  73.2  0.00000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00000000660918  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2431  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  22.57 
 
 
818 aa  73.2  0.00000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0319  TPR repeat-containing protein  24.55 
 
 
301 aa  72.4  0.00000000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0540059  normal  0.098872 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1589  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.74 
 
 
572 aa  72.4  0.00000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.499739 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4159  TPR repeat-containing protein  21.74 
 
 
467 aa  72  0.00000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00004642 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1065  TPR repeat-containing protein  24.74 
 
 
740 aa  72.4  0.00000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.761998  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0083  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24 
 
 
2240 aa  72  0.00000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0215  TPR repeat-containing protein  26.46 
 
 
2262 aa  72  0.00000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0297822 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0017  tetratricopeptide TPR_3  31.71 
 
 
407 aa  71.6  0.00000000007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2994  TPR repeat-containing protein  33.61 
 
 
317 aa  71.2  0.00000000009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0675  TPR repeat-containing protein  22.89 
 
 
344 aa  71.2  0.0000000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7855  TPR domain-containing protein  24.64 
 
 
648 aa  70.9  0.0000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.126864 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0163  TPR repeat-containing protein  22.22 
 
 
356 aa  70.9  0.0000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00233758  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2515  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24.64 
 
 
265 aa  70.5  0.0000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000326196  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0336  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  22.93 
 
 
557 aa  70.1  0.0000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000572448  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2349  TPR repeat-containing protein  22.09 
 
 
649 aa  70.5  0.0000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0186841  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1720  TPR repeat-containing protein  29.92 
 
 
187 aa  69.3  0.0000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC05740  Cell division control protein 23, putative  21.36 
 
 
626 aa  69.7  0.0000000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.326948  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0892  TPR repeat-containing protein  30.41 
 
 
636 aa  69.7  0.0000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.647896  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10800  TPR repeat-containing protein  24.06 
 
 
245 aa  69.7  0.0000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0540  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  22.06 
 
 
1056 aa  69.7  0.0000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0423513  normal  0.0609988 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3569  tetratricopeptide TPR_2  20.9 
 
 
314 aa  69.7  0.0000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>