More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_0278 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013173  Dbac_0278  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  100 
 
 		 207 aa  424  1e-118  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00000289042  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0243  TPR repeat-containing protein  51.06 
 
 		 208 aa  206  3e-52  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.127552  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3772  TPR repeat-containing protein  47.83 
 
 		 208 aa  204  6e-52  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2117  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  44.44 
 
 		 207 aa  193  2e-48  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0116  TPR repeat-containing protein  43.96 
 
 		 207 aa  187  8e-47  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.266905 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0886  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  44.66 
 
 		 207 aa  178  4.999999999999999e-44  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2668  TPR repeat-containing protein  45.21 
 
 		 206 aa  165  4e-40  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000000911518  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2198  TPR repeat-containing protein  35.42 
 
 		 209 aa  133  1.9999999999999998e-30  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2091  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  35.6 
 
 		 212 aa  122  4e-27  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0082  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  33.99 
 
 		 208 aa  121  8e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.146117  hitchhiker  0.00321946 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1598  hypothetical protein  36.51 
 
 		 208 aa  110  1.0000000000000001e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000392317  normal  0.531988 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  35.36 
 
 		 878 aa  108  4.0000000000000004e-23  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  34.81 
 
 		 810 aa  106  3e-22  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4040  TPR repeat-containing protein  32.42 
 
 		 226 aa  105  4e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2417  TPR repeat-containing protein  31.13 
 
 		 762 aa  100  1e-20  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3295  TPR repeat-containing protein  31.67 
 
 		 311 aa  98.6  5e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0481  TPR repeat-containing protein  27.43 
 
 		 3145 aa  97.1  2e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.948354 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24171  hypothetical protein  32.76 
 
 		 733 aa  95.5  5e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2942  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  30.39 
 
 		 632 aa  95.5  5e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24101  hypothetical protein  30.77 
 
 		 725 aa  91.3  8e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1719  TPR repeat-containing protein  30.9 
 
 		 583 aa  91.3  1e-17  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0911  tetratricopeptide TPR_4  32.09 
 
 		 875 aa  90.9  1e-17  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.379762  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2480  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  30.41 
 
 		 1022 aa  89.7  2e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4728  TPR repeat-containing protein  27.01 
 
 		 718 aa  89.7  2e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.346608 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2491  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.25 
 
 		 689 aa  88.2  7e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1094  TPR repeat-containing protein  30.51 
 
 		 685 aa  86.7  2e-16  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0955  TPR repeat-containing protein  31.07 
 
 		 637 aa  85.5  5e-16  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2604  TPR repeat-containing protein  30.39 
 
 		 927 aa  85.5  5e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.010408  normal  0.426767 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24071  hypothetical protein  30.49 
 
 		 622 aa  85.5  6e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0540  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  28.82 
 
 		 1056 aa  85.1  7e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0423513  normal  0.0609988 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24081  hypothetical protein  25.54 
 
 		 764 aa  84.7  8e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1166  TPR domain-containing protein  29.94 
 
 		 266 aa  84  0.000000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.194624  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1257  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  30.38 
 
 		 237 aa  83.6  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0122  glycosyl transferase, group 1  29.14 
 
 		 3301 aa  83.6  0.000000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.326818 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8213  TPR repeat-containing protein  28.19 
 
 		 392 aa  82.8  0.000000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0720948  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1232  TPR repeat-containing protein  29.67 
 
 		 750 aa  82.4  0.000000000000004  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.967237  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2383  TPR repeat-containing protein  26.32 
 
 		 1421 aa  82  0.000000000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.823331 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3569  tetratricopeptide TPR_2  27.78 
 
 		 314 aa  82  0.000000000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1618  TPR repeat-containing protein  30.77 
 
 		 217 aa  81.6  0.000000000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00366972 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7349  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  29.24 
 
 		 988 aa  81.6  0.000000000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0738846  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0157  TPR repeat-containing protein  33.15 
 
 		 465 aa  81.6  0.000000000000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28501  hypothetical protein  30 
 
 		 706 aa  81.6  0.000000000000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3831  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.9 
 
 		 1034 aa  81.3  0.000000000000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0133068 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1092  TPR repeat-containing protein  29.38 
 
 		 612 aa  81.3  0.00000000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1233  TPR repeat-containing protein  29.89 
 
 		 909 aa  80.9  0.00000000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.161918  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28481  hypothetical protein  27.08 
 
 		 462 aa  81.3  0.00000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2419  TPR repeat-containing protein  27.72 
 
 		 792 aa  81.3  0.00000000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0484292  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0453  TPR domain-containing protein  32.37 
 
 		 626 aa  80.1  0.00000000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.311085  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3015  TPR domain-containing protein  32.37 
 
 		 626 aa  80.1  0.00000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2431  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  26.9 
 
 		 818 aa  80.5  0.00000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2369  TPR repeat-containing protein  32.37 
 
 		 639 aa  80.5  0.00000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.319986  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0384  TPR repeat-containing protein  26.83 
 
 		 279 aa  79.3  0.00000000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.890218  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0177  TPR repeat-containing protein  32.37 
 
 		 614 aa  79.3  0.00000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2599  TPR domain-containing protein  32.37 
 
 		 614 aa  79.3  0.00000000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0734298  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1093  TPR repeat-containing protein  30.51 
 
 		 681 aa  79.3  0.00000000000003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.353622  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2906  TPR repeat-containing protein  32.37 
 
 		 614 aa  79.3  0.00000000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0475913  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0970  TPR domain-containing protein  32.37 
 
 		 614 aa  79.3  0.00000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19711  hypothetical protein  30 
 
 		 865 aa  79  0.00000000000005  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.372007  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3747  TPR repeat-containing protein  31.01 
 
 		 1005 aa  79  0.00000000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0153  TPR repeat-containing protein  29.71 
 
 		 754 aa  79  0.00000000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.372833  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4803  tetratricopeptide TPR_3  28.42 
 
 		 340 aa  78.6  0.00000000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0549  TPR repeat-containing protein  31.79 
 
 		 635 aa  78.6  0.00000000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1028  TPR repeat-containing protein  31.79 
 
 		 635 aa  78.6  0.00000000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.608823  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0163  TPR repeat-containing protein  29.85 
 
 		 356 aa  78.2  0.00000000000008  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00233758  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1619  TPR domain-containing protein  31.79 
 
 		 626 aa  78.2  0.00000000000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0978258  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0166  TPR repeat-containing protein  29.14 
 
 		 754 aa  78.2  0.00000000000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.268335  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2418  TPR repeat-containing protein  30.06 
 
 		 827 aa  77.4  0.0000000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1870  TPR repeat-containing protein  26.26 
 
 		 686 aa  77.8  0.0000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4141  TPR repeat-containing protein  31.79 
 
 		 637 aa  76.6  0.0000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.780051  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2992  TPR repeat-containing protein  27.07 
 
 		 824 aa  77  0.0000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000746825 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2951  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  26.32 
 
 		 784 aa  76.6  0.0000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0738  TPR repeat-containing protein  28.31 
 
 		 323 aa  76.3  0.0000000000003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  hitchhiker  0.00630781  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1653  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24.86 
 
 		 758 aa  76.6  0.0000000000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0987  TPR repeat-containing protein  31.79 
 
 		 611 aa  76.3  0.0000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.384547  normal  0.0740288 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_863  predicted protein  29.52 
 
 		 708 aa  76.6  0.0000000000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.622244  normal  0.0203568 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1492  glycosyl transferase family protein  27.62 
 
 		 1737 aa  76.3  0.0000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.315595  normal  0.552274 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2904  TPR repeat-containing protein  30.64 
 
 		 265 aa  76.3  0.0000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000121078  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6182  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  26.9 
 
 		 1056 aa  76.6  0.0000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5131  TPR repeat-containing protein  27.78 
 
 		 361 aa  75.9  0.0000000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000131061 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2853  TPR repeat-containing protein  25.99 
 
 		 3172 aa  75.9  0.0000000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2403  tetratricopeptide TPR_4  28.74 
 
 		 267 aa  75.5  0.0000000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000143988  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2349  TPR repeat-containing protein  27.17 
 
 		 649 aa  75.9  0.0000000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0186841  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2967  TPR repeat-containing protein  33.1 
 
 		 614 aa  75.1  0.0000000000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0917  TPR repeat-containing protein  27.96 
 
 		 566 aa  75.1  0.0000000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00563549 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2993  TPR repeat-containing protein  29.1 
 
 		 789 aa  75.1  0.0000000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00312978 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00731  hypothetical protein  27.68 
 
 		 816 aa  74.7  0.0000000000008  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.456129 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2321  TPR repeat-containing protein  27 
 
 		 750 aa  74.7  0.0000000000008  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2526  tetratricopeptide TPR_2  26.6 
 
 		 1154 aa  74.7  0.0000000000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.240995 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0996  TPR repeat-containing protein  28.05 
 
 		 634 aa  74.7  0.0000000000009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.325764  normal  0.0470836 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1172  TPR repeat-containing protein  27.59 
 
 		 4079 aa  74.3  0.000000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0454  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.47 
 
 		 357 aa  73.9  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3996  tetratricopeptide TPR_2  31.69 
 
 		 1694 aa  74.3  0.000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.271204  normal  0.601264 
 
 
-
 
NC_013163  Cyan8802_4605  TPR repeat-containing protein  27.54 
 
 		 279 aa  73.9  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0904  TPR repeat-containing protein  31.79 
 
 		 612 aa  73.6  0.000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.587904  normal  0.769196 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24161  hypothetical protein  27.41 
 
 		 661 aa  73.9  0.000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5618  SPINDLY family O-linked N-acetylglucosamine transferase  30.82 
 
 		 739 aa  73.6  0.000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.645263 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1657  TPR repeat-containing protein  32.17 
 
 		 594 aa  73.2  0.000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0658919  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0892  TPR repeat-containing protein  31.79 
 
 		 636 aa  73.9  0.000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.647896  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0959  TPR repeat-containing protein  28.24 
 
 		 199 aa  73.6  0.000000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18211  hypothetical protein  30.06 
 
 		 603 aa  73.2  0.000000000003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.905605 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>