More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DvMF_2117 on replicon NC_011769
Organism: Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011769  DvMF_2117  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  100 
 
 		 207 aa  427  1e-119  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0116  TPR repeat-containing protein  82.61 
 
 		 207 aa  358  3e-98  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.266905 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3772  TPR repeat-containing protein  71.01 
 
 		 208 aa  323  2e-87  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0886  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  67.48 
 
 		 207 aa  285  2.9999999999999996e-76  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0278  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  44.44 
 
 		 207 aa  193  2e-48  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00000289042  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0243  TPR repeat-containing protein  42.72 
 
 		 208 aa  185  5e-46  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.127552  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2668  TPR repeat-containing protein  41.21 
 
 		 206 aa  161  7e-39  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000000911518  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2198  TPR repeat-containing protein  37.19 
 
 		 209 aa  149  4e-35  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1598  hypothetical protein  35.29 
 
 		 208 aa  135  6.0000000000000005e-31  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000392317  normal  0.531988 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0082  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  34.67 
 
 		 208 aa  134  9.999999999999999e-31  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.146117  hitchhiker  0.00321946 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2091  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  35.03 
 
 		 212 aa  132  3e-30  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4040  TPR repeat-containing protein  33.68 
 
 		 226 aa  105  5e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  30.29 
 
 		 810 aa  89.7  3e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2383  TPR repeat-containing protein  27.66 
 
 		 1421 aa  89.4  4e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.823331 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  30.29 
 
 		 878 aa  88.6  6e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24101  hypothetical protein  30.9 
 
 		 725 aa  87  2e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0481  TPR repeat-containing protein  24.48 
 
 		 3145 aa  86.7  2e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.948354 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3831  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  32.34 
 
 		 1034 aa  84.7  8e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0133068 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2942  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.57 
 
 		 632 aa  80.9  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24171  hypothetical protein  27.04 
 
 		 733 aa  80.5  0.00000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0911  tetratricopeptide TPR_4  31.03 
 
 		 875 aa  79.3  0.00000000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.379762  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24081  hypothetical protein  27.96 
 
 		 764 aa  79  0.00000000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8213  TPR repeat-containing protein  25.99 
 
 		 392 aa  77  0.0000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0720948  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0540  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  27.22 
 
 		 1056 aa  76.3  0.0000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0423513  normal  0.0609988 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2417  TPR repeat-containing protein  25.96 
 
 		 762 aa  76.3  0.0000000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3747  TPR repeat-containing protein  30.81 
 
 		 1005 aa  75.5  0.0000000000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2480  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  27.08 
 
 		 1022 aa  75.1  0.0000000000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24071  hypothetical protein  28.65 
 
 		 622 aa  74.7  0.0000000000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2993  TPR repeat-containing protein  30.27 
 
 		 789 aa  73.9  0.000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00312978 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4728  TPR repeat-containing protein  26.82 
 
 		 718 aa  73.9  0.000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.346608 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2349  TPR repeat-containing protein  25.4 
 
 		 649 aa  73.9  0.000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0186841  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4803  tetratricopeptide TPR_3  30.72 
 
 		 340 aa  73.2  0.000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_863  predicted protein  29.8 
 
 		 708 aa  72.8  0.000000000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.622244  normal  0.0203568 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2491  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.38 
 
 		 689 aa  72  0.000000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1087  TPR repeat-containing protein  29.34 
 
 		 808 aa  71.2  0.000000000009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11240  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  33.33 
 
 		 247 aa  70.9  0.00000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.617467  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3295  TPR repeat-containing protein  26.86 
 
 		 311 aa  69.3  0.00000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23400  TPR repeat-containing protein  28.57 
 
 		 183 aa  69.7  0.00000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000457247  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28481  hypothetical protein  25.25 
 
 		 462 aa  69.7  0.00000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5131  TPR repeat-containing protein  26.4 
 
 		 361 aa  69.3  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000131061 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1653  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.25 
 
 		 758 aa  68.9  0.00000000005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7349  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  26.67 
 
 		 988 aa  68.9  0.00000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0738846  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1092  TPR repeat-containing protein  25.54 
 
 		 612 aa  68.6  0.00000000006  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6182  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  25.29 
 
 		 1056 aa  68.6  0.00000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1492  glycosyl transferase family protein  26.55 
 
 		 1737 aa  68.2  0.00000000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.315595  normal  0.552274 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1719  TPR repeat-containing protein  27.38 
 
 		 583 aa  68.2  0.00000000009  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2859  sulfotransferase  25.53 
 
 		 832 aa  68.2  0.00000000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.398491 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1094  TPR repeat-containing protein  27.6 
 
 		 685 aa  67.4  0.0000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1187  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24.44 
 
 		 293 aa  67.8  0.0000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0548059  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0122  glycosyl transferase, group 1  27.44 
 
 		 3301 aa  67.8  0.0000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.326818 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2212  TPR repeat-containing protein  25.95 
 
 		 1276 aa  67  0.0000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.524691  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2853  TPR repeat-containing protein  27.44 
 
 		 3172 aa  67  0.0000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3115  TPR repeat-containing protein  27.41 
 
 		 284 aa  67  0.0000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000000023055  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4770  sulfotransferase  26.26 
 
 		 887 aa  67.4  0.0000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.185793 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2431  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  25 
 
 		 818 aa  66.6  0.0000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3466  TPR repeat-containing protein  29.41 
 
 		 374 aa  65.5  0.0000000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1568  hypothetical protein  25.15 
 
 		 820 aa  65.5  0.0000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28501  hypothetical protein  25.14 
 
 		 706 aa  65.5  0.0000000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0955  TPR repeat-containing protein  26.19 
 
 		 637 aa  65.5  0.0000000006  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0917  TPR repeat-containing protein  28.1 
 
 		 566 aa  64.7  0.0000000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00563549 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2951  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  25 
 
 		 784 aa  64.7  0.000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0927  TPR repeat-containing protein  28.19 
 
 		 291 aa  64.7  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2067  TPR repeat-containing protein  34.55 
 
 		 586 aa  63.5  0.000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0230242  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0454  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24.71 
 
 		 357 aa  63.9  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1233  TPR repeat-containing protein  27.91 
 
 		 909 aa  63.5  0.000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.161918  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4492  TPR repeat-containing protein  27.47 
 
 		 605 aa  63.5  0.000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013163  Cyan8802_4605  TPR repeat-containing protein  26.63 
 
 		 279 aa  63.5  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0996  TPR repeat-containing protein  26.13 
 
 		 634 aa  63.5  0.000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.325764  normal  0.0470836 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3398  TPR repeat-containing protein  24.85 
 
 		 274 aa  63.9  0.000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0527752  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1260  TPR repeat-containing protein  27.47 
 
 		 573 aa  63.5  0.000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.439457 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_14411  Flp pilus assembly protein TadD  26.21 
 
 		 594 aa  63.2  0.000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00033533 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3102  TPR repeat-containing protein  26.74 
 
 		 313 aa  63.2  0.000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000142669  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1093  TPR repeat-containing protein  27.38 
 
 		 681 aa  62.8  0.000000004  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.353622  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2418  TPR repeat-containing protein  28.31 
 
 		 827 aa  62.8  0.000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1943  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.57 
 
 		 917 aa  62.4  0.000000005  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.0509436 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1232  TPR repeat-containing protein  27.66 
 
 		 750 aa  62  0.000000006  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.967237  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4355  TPR repeat-containing protein  24.14 
 
 		 1192 aa  62  0.000000006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.862224  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0982  TPR domain-containing protein  26.67 
 
 		 750 aa  61.6  0.000000007  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.682285 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0200  TPR repeat-containing protein  23.35 
 
 		 505 aa  61.6  0.000000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2471  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.71 
 
 		 406 aa  61.6  0.000000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0400427  normal  0.45906 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3643  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.71 
 
 		 406 aa  61.6  0.000000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2604  TPR repeat-containing protein  26.04 
 
 		 927 aa  61.6  0.000000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.010408  normal  0.426767 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19711  hypothetical protein  26.6 
 
 		 865 aa  61.2  0.000000009  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.372007  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1991  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.55 
 
 		 367 aa  61.2  0.00000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.310287  normal  0.0147414 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5110  TPR repeat-containing protein  26.42 
 
 		 288 aa  60.8  0.00000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.163263  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28701  hypothetical protein  23.27 
 
 		 582 aa  61.2  0.00000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3161  tetratricopeptide TPR_2  27.56 
 
 		 444 aa  61.2  0.00000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1166  TPR domain-containing protein  27.87 
 
 		 266 aa  60.1  0.00000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.194624  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24161  hypothetical protein  28 
 
 		 661 aa  60.5  0.00000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0165  TPR repeat-containing protein  28.49 
 
 		 828 aa  60.5  0.00000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0585605  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3518  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28 
 
 		 320 aa  60.5  0.00000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00731  hypothetical protein  28.57 
 
 		 816 aa  60.1  0.00000002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.456129 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2243  TPR repeat-containing protein  25.43 
 
 		 311 aa  60.5  0.00000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.6122  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1955  TPR repeat-containing protein  25.43 
 
 		 311 aa  60.5  0.00000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0490064  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0152  TPR repeat-containing protein  28.49 
 
 		 828 aa  60.1  0.00000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2708  tetratricopeptide TPR_2  26.16 
 
 		 979 aa  60.1  0.00000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.169437 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18211  hypothetical protein  27.6 
 
 		 603 aa  60.1  0.00000002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.905605 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4945  TPR repeat-containing protein  24.18 
 
 		 750 aa  60.5  0.00000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1870  TPR repeat-containing protein  27.78 
 
 		 686 aa  59.7  0.00000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1633  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  31.94 
 
 		 358 aa  59.3  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  decreased coverage  0.000383939  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>