More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbur_0216 on replicon NC_007955
Organism: Methanococcoides burtonii DSM 6242



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007955  Mbur_0216  TPR repeat-containing protein  100 
 
 
296 aa  604  9.999999999999999e-173  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1787  TPR repeat-containing protein  32.14 
 
 
543 aa  145  1e-33  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.662156  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2379  hypothetical protein  30.29 
 
 
283 aa  138  1e-31  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.14303 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3996  tetratricopeptide TPR_2  34.84 
 
 
1694 aa  138  1e-31  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.271204  normal  0.601264 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2604  TPR repeat-containing protein  34.52 
 
 
927 aa  128  1.0000000000000001e-28  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.010408  normal  0.426767 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2941  hypothetical protein  35.78 
 
 
560 aa  124  2e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000171884  normal  0.0147454 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4726  serine/threonine protein kinase with TPR repeats  28.29 
 
 
730 aa  124  2e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1361  TPR repeat-containing protein  28.94 
 
 
1276 aa  118  9.999999999999999e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0087  TPR repeat-containing protein  28.28 
 
 
366 aa  117  3e-25  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1172  TPR repeat-containing protein  29.45 
 
 
4079 aa  116  3.9999999999999997e-25  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2367  protein kinase  30.19 
 
 
623 aa  114  2.0000000000000002e-24  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2318  tetratricopeptide protein  31.52 
 
 
573 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1552  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  29 
 
 
707 aa  113  3e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0225548 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3201  TPR repeat-containing protein  30.14 
 
 
955 aa  113  5e-24  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.0757905 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0675  TPR repeat-containing protein  30.95 
 
 
344 aa  112  7.000000000000001e-24  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0114  TPR repeat-containing protein  30.07 
 
 
602 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.606428  normal  0.312557 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3507  protein prenyltransferase, alpha subunit  31.3 
 
 
1007 aa  108  8.000000000000001e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.223985 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2994  hypothetical protein  32.38 
 
 
417 aa  108  1e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.542641  normal  0.0105744 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4355  TPR repeat-containing protein  30.94 
 
 
1192 aa  108  1e-22  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.862224  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2461  hypothetical protein  30.37 
 
 
398 aa  105  1e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.125521  normal  0.0258605 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1841  TPR repeat-containing protein  29.2 
 
 
3035 aa  105  1e-21  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3643  TPR domain-containing protein  29.07 
 
 
1979 aa  104  2e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2005  TPR repeat-containing protein  27.21 
 
 
512 aa  104  2e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.915591 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0060  TPR repeat-containing protein  27.03 
 
 
562 aa  104  2e-21  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0011  hypothetical protein  27.3 
 
 
1138 aa  103  4e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.41301  normal  0.0644501 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0637  TPR repeat-containing protein  29.22 
 
 
4489 aa  100  3e-20  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  27.3 
 
 
810 aa  99.8  5e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7855  TPR domain-containing protein  24.56 
 
 
648 aa  98.2  1e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.126864 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2953  TPR repeat-containing protein  27.99 
 
 
711 aa  98.6  1e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0781794 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1811  TPR repeat-containing protein  32.02 
 
 
523 aa  97.4  2e-19  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2895  O-linked N-acetylglucosamine transferase  32.77 
 
 
292 aa  97.4  2e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0140366 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1312  TPR repeat-containing protein  27.24 
 
 
1069 aa  97.4  3e-19  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.530092  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2893  O-linked N-acetylglucosamine transferase  29.09 
 
 
397 aa  97.1  3e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.272299 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0629  TPR repeat-containing protein  26.77 
 
 
1049 aa  97.4  3e-19  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2212  TPR repeat-containing protein  30.33 
 
 
1276 aa  96.7  4e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.524691  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0301  TPR repeat-containing protein  26.96 
 
 
1827 aa  95.5  9e-19  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0641  TPR repeat-containing protein  26.78 
 
 
1094 aa  95.1  1e-18  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.230386  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0436  tetratricopeptide TPR_2  29.64 
 
 
1056 aa  95.1  1e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1840  TPR repeat-containing protein  30.62 
 
 
3560 aa  94.7  1e-18  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2322  TPR repeat-containing protein  24.2 
 
 
935 aa  94.7  1e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0205826 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0225  TPR repeat-containing protein  30.35 
 
 
414 aa  95.1  1e-18  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2680  peptidase S41  28.23 
 
 
745 aa  95.1  1e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.20871  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  28.21 
 
 
878 aa  94.4  2e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2406  tetratricopeptide TPR_2  28.36 
 
 
436 aa  94.4  2e-18  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0157  TPR repeat-containing protein  27.6 
 
 
465 aa  94  2e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3569  tetratricopeptide TPR_2  28.04 
 
 
314 aa  93.6  3e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2942  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.91 
 
 
632 aa  92  1e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2807  tetratricopeptide TPR_2  25.57 
 
 
576 aa  90.9  2e-17  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.233123 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1451  TPR repeat-containing protein  28.37 
 
 
244 aa  90.5  3e-17  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.346129  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0698  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.91 
 
 
784 aa  90.5  3e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1827  TPR repeat-containing protein  26.89 
 
 
761 aa  89.7  5e-17  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0460239  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0191  TPR repeat-containing protein  32.12 
 
 
250 aa  89.4  7e-17  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.641193  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1065  TPR repeat-containing protein  27.11 
 
 
740 aa  87  3e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.761998  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3801  TPR repeat-containing protein  25.26 
 
 
713 aa  87.4  3e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.386604  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1653  TPR repeat-containing protein  31.09 
 
 
466 aa  87  3e-16  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1093  TPR repeat-containing protein  32.65 
 
 
681 aa  86.7  4e-16  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.353622  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1619  TPR domain-containing protein  24.64 
 
 
626 aa  87  4e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0978258  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3049  TPR repeat-containing protein  27.17 
 
 
591 aa  86.7  4e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000157665  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0955  tetratricopeptide TPR_2  25.72 
 
 
635 aa  86.7  5e-16  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.750671 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2471  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.57 
 
 
406 aa  85.9  8e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0400427  normal  0.45906 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3643  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.57 
 
 
406 aa  85.9  8e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24101  hypothetical protein  26.73 
 
 
725 aa  84.7  0.000000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1793  TPR repeat-containing protein  27.41 
 
 
213 aa  85.1  0.000000000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0321  TPR repeat-containing protein  26.67 
 
 
162 aa  85.1  0.000000000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1773  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  30.57 
 
 
466 aa  85.1  0.000000000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1947  tetratricopeptide TPR_2  28.91 
 
 
564 aa  84.3  0.000000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0106408 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0858  TPR repeat-containing protein  28.04 
 
 
589 aa  83.6  0.000000000000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3209  tetratricopeptide repeat-containing protein  27.75 
 
 
743 aa  83.2  0.000000000000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2530  TPR repeat-containing protein  27.41 
 
 
608 aa  83.2  0.000000000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.187337  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1260  TPR repeat-containing protein  25.37 
 
 
573 aa  82.8  0.000000000000006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.439457 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4508  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.17 
 
 
836 aa  82.8  0.000000000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.885776 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1233  TPR repeat-containing protein  25.67 
 
 
909 aa  82  0.000000000000009  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.161918  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1483  TPR repeat-containing protein  33.68 
 
 
221 aa  82  0.00000000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0955  TPR repeat-containing protein  29.93 
 
 
637 aa  81.6  0.00000000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0987  TPR repeat-containing protein  24.05 
 
 
611 aa  80.9  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.384547  normal  0.0740288 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0384  TPR repeat-containing protein  23.32 
 
 
279 aa  81.6  0.00000000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.890218  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0892  TPR repeat-containing protein  24.54 
 
 
636 aa  80.5  0.00000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.647896  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3015  TPR domain-containing protein  22.46 
 
 
626 aa  80.5  0.00000000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1066  TPR repeat-containing protein  23.57 
 
 
747 aa  80.5  0.00000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3028  TPR repeat-containing protein  28.93 
 
 
620 aa  80.5  0.00000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.985806  normal  0.0142271 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2742  tetratricopeptide TPR_2  31.18 
 
 
390 aa  80.5  0.00000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.890739  normal  0.21285 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3047  tetratricopeptide TPR_2  29.44 
 
 
508 aa  80.5  0.00000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0595686  hitchhiker  0.00892549 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3062  hypothetical protein  26.52 
 
 
391 aa  80.1  0.00000000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.386129 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0564  TPR repeat-containing protein  26.99 
 
 
202 aa  80.1  0.00000000000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.151741 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1028  TPR repeat-containing protein  24.05 
 
 
635 aa  80.1  0.00000000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.608823  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0549  TPR repeat-containing protein  24.05 
 
 
635 aa  80.1  0.00000000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2906  TPR repeat-containing protein  23.13 
 
 
614 aa  79.7  0.00000000000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0475913  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0755  TPR repeat-containing protein  25.57 
 
 
662 aa  79.7  0.00000000000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.466717  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3949  TPR repeat-containing protein  31.21 
 
 
361 aa  79.3  0.00000000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0823  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.12 
 
 
296 aa  79.3  0.00000000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0401477 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0280  TPR domain-containing protein  26.52 
 
 
1013 aa  79  0.00000000000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.416311 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4523  TPR repeat-containing protein  26.3 
 
 
1119 aa  79  0.00000000000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2369  TPR repeat-containing protein  23.83 
 
 
639 aa  79  0.00000000000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.319986  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0308  TPR repeat-containing protein  27.75 
 
 
636 aa  79.3  0.00000000000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00465819 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1825  TPR repeat-containing protein  28.33 
 
 
523 aa  79  0.00000000000009  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.578572  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1094  TPR repeat-containing protein  32.85 
 
 
685 aa  78.6  0.0000000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2975  TPR repeat-containing protein  25.57 
 
 
716 aa  78.6  0.0000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2967  TPR repeat-containing protein  26.5 
 
 
614 aa  78.6  0.0000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1605  tetratricopeptide TPR_2  25 
 
 
252 aa  77.8  0.0000000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.790082 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2599  TPR domain-containing protein  23.97 
 
 
614 aa  77.4  0.0000000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0734298  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>