44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lferr_2516 on replicon NC_011206
Organism: Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011206  Lferr_2516  O-antigen polymerase  100 
 
 		 686 aa  1354    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.549504  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2896  O-antigen polymerase family protein  100 
 
 		 686 aa  1354    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1691  O-antigen polymerase  32.16 
 
 		 512 aa  70.1  0.0000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.121195  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1654  O-antigen polymerase  25.87 
 
 		 754 aa  67.8  0.0000000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2638  O-antigen polymerase  27.3 
 
 		 428 aa  66.2  0.000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3526  O-antigen polymerase  30.32 
 
 		 668 aa  60.5  0.0000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000131402  normal  0.176407 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1838  O-antigen polymerase  23.75 
 
 		 785 aa  58.9  0.0000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4567  O-antigen polymerase  28.43 
 
 		 717 aa  57.4  0.0000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.79744  normal  0.181696 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3326  O-antigen polymerase  23.32 
 
 		 502 aa  56.2  0.000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.32495 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0466  O-antigen polymerase  35.29 
 
 		 589 aa  55.8  0.000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.285163  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0690  hypothetical protein  28.87 
 
 		 458 aa  55.5  0.000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.128685  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2436  O-antigen polymerase  37.78 
 
 		 894 aa  54.3  0.000008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0534  O-antigen polymerase  25.5 
 
 		 607 aa  53.9  0.000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.462274  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3695  hypothetical protein  31.46 
 
 		 404 aa  52.4  0.00003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1650  hypothetical protein  31.78 
 
 		 404 aa  52  0.00003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.192586  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2459  O-antigen polymerase  28.87 
 
 		 437 aa  50.8  0.00009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003538  putative membrane protein of ExoQ family involved in exopolysaccharide production  28.77 
 
 		 454 aa  50.8  0.00009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1682  hypothetical protein  30.52 
 
 		 404 aa  49.7  0.0002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4268  O-antigen polymerase  30.2 
 
 		 503 aa  49.3  0.0002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.209068 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0234  O-antigen polymerase  33.86 
 
 		 402 aa  49.7  0.0002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0682574 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4110  O-antigen polymerase  23.21 
 
 		 930 aa  48.9  0.0003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1496  hypothetical protein  30.52 
 
 		 404 aa  48.5  0.0004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.285071  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1468  secreted polysaccharide polymerase  30.52 
 
 		 404 aa  48.5  0.0004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00102355  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1614  hypothetical protein  30.52 
 
 		 404 aa  48.5  0.0004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.363158  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1788  O-antigen polymerase  23.88 
 
 		 446 aa  48.5  0.0005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0464  O-antigen polymerase  29.57 
 
 		 590 aa  47.8  0.0008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.325512  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2813  O-antigen polymerase  30.71 
 
 		 773 aa  47.4  0.0009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.192356  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4434  O-antigen polymerase  35.16 
 
 		 474 aa  47  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3726  O-antigen polymerase  26.11 
 
 		 438 aa  47  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.114038 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1908  O-antigen polymerase  41.77 
 
 		 472 aa  46.6  0.001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3597  O-antigen polymerase  25.19 
 
 		 438 aa  46.6  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.312058 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3580  O-antigen polymerase  33.11 
 
 		 504 aa  47  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2750  O-antigen polymerase  31.11 
 
 		 489 aa  46.2  0.002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.205692 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0479  O-antigen polymerase  43.55 
 
 		 578 aa  46.6  0.002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.575245  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2523  O-antigen polymerase  40.58 
 
 		 738 aa  46.2  0.002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0830151  hitchhiker  0.00448531 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0474  O-antigen polymerase  34.57 
 
 		 595 aa  45.4  0.004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1077  O-antigen polymerase  34.85 
 
 		 433 aa  45.1  0.005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.9264  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1952  O-antigen polymerase  39.73 
 
 		 653 aa  44.7  0.005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.953343  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18850  O-antigen polymerase  28.77 
 
 		 393 aa  44.7  0.005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0515  O-antigen polymerase  25.32 
 
 		 1090 aa  45.1  0.005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0340666  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2009  O-antigen polymerase  24.28 
 
 		 459 aa  44.3  0.008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02223  hypothetical protein  28.43 
 
 		 461 aa  44.3  0.009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0559  hypothetical protein  41.94 
 
 		 569 aa  43.9  0.009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.261302  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3579  O-antigen polymerase  24.56 
 
 		 501 aa  43.9  0.01  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>