55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mesil_0234 on replicon NC_014212
Organism: Meiothermus silvanus DSM 9946



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014212  Mesil_0234  O-antigen polymerase  100 
 
 
402 aa  763    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0682574 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2975  O-antigen polymerase  31.58 
 
 
549 aa  69.3  0.0000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.024758  decreased coverage  0.00000748304 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1388  O-antigen polymerase  25.75 
 
 
452 aa  69.3  0.0000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1654  O-antigen polymerase  25.43 
 
 
754 aa  67.4  0.0000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2403  O-antigen polymerase  28.71 
 
 
509 aa  64.3  0.000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.166063  normal  0.151725 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3152  O-antigen polymerase  29.34 
 
 
546 aa  60.8  0.00000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1940  O-antigen polymerase  35 
 
 
453 aa  56.6  0.0000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1077  O-antigen polymerase  26.79 
 
 
433 aa  56.6  0.0000008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.9264  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0822  inorganic carbon transporter  26.3 
 
 
471 aa  55.8  0.000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.999427  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2694  O-antigen polymerase  26.47 
 
 
535 aa  54.7  0.000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.247958  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1838  O-antigen polymerase  26.37 
 
 
785 aa  53.5  0.000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1774  O-antigen polymerase  32.83 
 
 
418 aa  53.5  0.000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00226394  normal  0.0339661 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2813  O-antigen polymerase  25 
 
 
773 aa  53.5  0.000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.192356  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0845  hypothetical protein  25.55 
 
 
537 aa  52.8  0.00001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.149779  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24401  bicarbonate transporter, ICT family protein  27.92 
 
 
436 aa  52  0.00002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1173  hypothetical protein  26.69 
 
 
457 aa  52  0.00002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  hitchhiker  0.00922176  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3440  O-antigen polymerase  31.5 
 
 
508 aa  51.2  0.00003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3113  O-antigen polymerase  31.33 
 
 
467 aa  51.2  0.00003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.000000000265772  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4227  O-antigen polymerase  27.12 
 
 
457 aa  50.4  0.00005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4286  inorganic carbon transporter  27.12 
 
 
457 aa  50.4  0.00005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.816665  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0456  hypothetical protein  30.66 
 
 
438 aa  50.4  0.00006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3180  O-antigen polymerase  29.72 
 
 
498 aa  50.1  0.00007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2516  O-antigen polymerase  33.33 
 
 
686 aa  49.7  0.00009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.549504  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3039  putative binding-protein-dependent transport system protein  27.81 
 
 
341 aa  49.7  0.00009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.148382  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0142  O-antigen polymerase  25.15 
 
 
496 aa  49.7  0.00009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0300218 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2896  O-antigen polymerase family protein  33.33 
 
 
686 aa  49.7  0.00009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4110  O-antigen polymerase  25.68 
 
 
930 aa  49.3  0.0001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0156  O-antigen polymerase  36.14 
 
 
390 aa  49.3  0.0001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1804  hypothetical protein  28.51 
 
 
410 aa  49.7  0.0001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.0307014 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02473  O-antigen polymerase  25.42 
 
 
470 aa  49.3  0.0001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4567  O-antigen polymerase  29.41 
 
 
717 aa  49.3  0.0001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.79744  normal  0.181696 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2638  O-antigen polymerase  28.85 
 
 
428 aa  48.5  0.0002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0083  membrane protein  30.92 
 
 
443 aa  48.5  0.0002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.735968  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1088  O-antigen polymerase  31.58 
 
 
737 aa  48.1  0.0003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4864  inorganic carbon transporter  29.58 
 
 
467 aa  47.8  0.0004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.867776  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0069  O-antigen polymerase  30.43 
 
 
443 aa  47  0.0007  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3951  O-antigen polymerase  24.48 
 
 
402 aa  46.6  0.0008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18850  O-antigen polymerase  27.31 
 
 
393 aa  45.8  0.001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2327  O-antigen polymerase  26.28 
 
 
475 aa  45.8  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3103  O-antigen polymerase  29.23 
 
 
498 aa  45.8  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.313581  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1908  O-antigen polymerase  27.89 
 
 
472 aa  46.2  0.001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3401  polysaccharide deacetylase  30 
 
 
464 aa  45.8  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.264275  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02624  membrane protein  31.76 
 
 
431 aa  45.1  0.002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2065  bicarbonate transporter  28.3 
 
 
438 aa  44.7  0.003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0338  O-antigen ligase  22.62 
 
 
436 aa  44.7  0.003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0508  O-antigen polymerase  31.82 
 
 
440 aa  44.3  0.004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3580  O-antigen polymerase  29.36 
 
 
504 aa  44.3  0.004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1851  hypothetical protein  22.95 
 
 
429 aa  43.9  0.005  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2459  O-antigen polymerase  26.03 
 
 
437 aa  43.9  0.005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4268  O-antigen polymerase  30.77 
 
 
503 aa  43.9  0.006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.209068 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4478  O-antigen polymerase  30.83 
 
 
608 aa  43.5  0.007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3696  O-antigen polymerase  25.32 
 
 
461 aa  43.5  0.007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.312837 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0168  O-antigen polymerase  22.88 
 
 
400 aa  43.5  0.007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3326  O-antigen polymerase  26.64 
 
 
502 aa  43.1  0.009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.32495 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4116  O-antigen polymerase  27.88 
 
 
540 aa  42.7  0.01  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0014553  hitchhiker  0.00000561153 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>