55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmc1_2403 on replicon NC_008576
Organism: Magnetococcus sp. MC-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008576  Mmc1_2403  O-antigen polymerase  100 
 
 
509 aa  1014    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.166063  normal  0.151725 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1077  O-antigen polymerase  30.81 
 
 
433 aa  177  4e-43  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.9264  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02473  O-antigen polymerase  27.9 
 
 
470 aa  169  1e-40  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1654  O-antigen polymerase  27 
 
 
754 aa  160  6e-38  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1173  hypothetical protein  29.78 
 
 
457 aa  158  3e-37  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  hitchhiker  0.00922176  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1388  O-antigen polymerase  28.73 
 
 
452 aa  157  5.0000000000000005e-37  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0456  hypothetical protein  30.56 
 
 
438 aa  151  2e-35  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1838  O-antigen polymerase  26.04 
 
 
785 aa  143  6e-33  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1691  O-antigen polymerase  28.28 
 
 
512 aa  115  2.0000000000000002e-24  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.121195  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4110  O-antigen polymerase  26.77 
 
 
930 aa  85.9  0.000000000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1908  O-antigen polymerase  21.51 
 
 
472 aa  76.6  0.0000000000009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1503  binding-protein-dependent transport system protein  26.23 
 
 
501 aa  75.5  0.000000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.200132  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0234  O-antigen polymerase  29.04 
 
 
402 aa  69.7  0.0000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0682574 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3326  O-antigen polymerase  23.82 
 
 
502 aa  68.9  0.0000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.32495 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2985  endo-1,4-beta-xylanase protein (exopolysaccharide export)  27.25 
 
 
474 aa  67.4  0.0000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.161318  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0142  O-antigen polymerase  26.22 
 
 
496 aa  67.4  0.0000000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0300218 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3233  endo-1,4-beta-xylanase protein (exopolysaccharide export)  28.44 
 
 
474 aa  65.5  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4567  O-antigen polymerase  26.14 
 
 
717 aa  64.3  0.000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.79744  normal  0.181696 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4864  inorganic carbon transporter  27 
 
 
467 aa  62.4  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.867776  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1029  putative O-antigen polymerase, putative membrane protein  27.43 
 
 
455 aa  61.6  0.00000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.384191  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3039  putative binding-protein-dependent transport system protein  26.35 
 
 
341 aa  58.5  0.0000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.148382  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6500  O-antigen polymerase  25.71 
 
 
794 aa  58.2  0.0000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3781  O-antigen polymerase  24.41 
 
 
477 aa  54.7  0.000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0690  hypothetical protein  28.78 
 
 
458 aa  55.5  0.000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.128685  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1492  hypothetical protein  25.29 
 
 
468 aa  53.9  0.000007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2523  O-antigen polymerase  26.55 
 
 
738 aa  53.1  0.00001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0830151  hitchhiker  0.00448531 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2327  O-antigen polymerase  26.35 
 
 
475 aa  53.1  0.00001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1650  hypothetical protein  25.87 
 
 
404 aa  52  0.00002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.192586  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4116  O-antigen polymerase  24.77 
 
 
540 aa  52.8  0.00002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0014553  hitchhiker  0.00000561153 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3696  O-antigen polymerase  25.09 
 
 
461 aa  51.2  0.00005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.312837 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3695  hypothetical protein  25.87 
 
 
404 aa  50.8  0.00006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4227  O-antigen polymerase  27.22 
 
 
457 aa  50.8  0.00006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4286  inorganic carbon transporter  27.22 
 
 
457 aa  50.4  0.00007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.816665  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2750  O-antigen polymerase  25 
 
 
489 aa  50.4  0.00007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.205692 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1614  hypothetical protein  24.88 
 
 
404 aa  49.7  0.0001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.363158  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1088  O-antigen polymerase  28.28 
 
 
737 aa  49.7  0.0001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1955  O-antigen polymerase  25.95 
 
 
468 aa  49.3  0.0001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.324728  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1468  secreted polysaccharide polymerase  24.88 
 
 
404 aa  49.7  0.0001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00102355  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1496  hypothetical protein  24.88 
 
 
404 aa  49.7  0.0001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.285071  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0822  inorganic carbon transporter  24.53 
 
 
471 aa  49.3  0.0002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.999427  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4268  O-antigen polymerase  24.73 
 
 
503 aa  49.3  0.0002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.209068 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0156  O-antigen polymerase  29.65 
 
 
390 aa  48.5  0.0003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1682  hypothetical protein  24 
 
 
404 aa  46.2  0.001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3440  O-antigen polymerase  23.76 
 
 
508 aa  46.2  0.001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2813  O-antigen polymerase  21.43 
 
 
773 aa  46.6  0.001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.192356  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0083  membrane protein  26.32 
 
 
443 aa  45.8  0.002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.735968  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1664  O-antigen polymerase  25.48 
 
 
806 aa  45.4  0.002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2896  O-antigen polymerase family protein  26.03 
 
 
686 aa  45.4  0.003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2516  O-antigen polymerase  26.03 
 
 
686 aa  45.4  0.003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.549504  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3580  O-antigen polymerase  22.46 
 
 
504 aa  45.1  0.003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0069  O-antigen polymerase  26.32 
 
 
443 aa  44.7  0.004  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1869  O-antigen polymerase  25.68 
 
 
459 aa  44.7  0.004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0127  hypothetical protein  25.85 
 
 
845 aa  44.3  0.005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2638  O-antigen polymerase  23.79 
 
 
428 aa  43.9  0.007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2338  O-antigen polymerase  23.81 
 
 
425 aa  43.5  0.008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>