22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_2694 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008148  Rxyl_2694  O-antigen polymerase  100 
 
 		 535 aa  1050    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.247958  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0559  O-antigen polymerase  35.85 
 
 		 647 aa  68.6  0.0000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.024189  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1952  O-antigen polymerase  35.71 
 
 		 653 aa  63.2  0.00000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.953343  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5512  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.42 
 
 		 722 aa  61.2  0.00000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.219126  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0051  O-antigen polymerase  21.38 
 
 		 735 aa  60.5  0.00000009  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000539528  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2821  O-antigen polymerase  30.18 
 
 		 434 aa  58.9  0.0000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2640  O-antigen polymerase  31.94 
 
 		 434 aa  57.4  0.0000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0149794  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2608  O-antigen polymerase  30.46 
 
 		 432 aa  56.2  0.000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.212106  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0234  O-antigen polymerase  26.47 
 
 		 402 aa  55.1  0.000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0682574 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5297  O-antigen polymerase  30.6 
 
 		 670 aa  53.5  0.000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.205567  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4116  O-antigen polymerase  29.79 
 
 		 540 aa  52.8  0.00002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0014553  hitchhiker  0.00000561153 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2726  O-antigen polymerase  31.94 
 
 		 434 aa  48.5  0.0003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.136872  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2501  O-antigen polymerase  20.58 
 
 		 784 aa  47.4  0.0006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0582  O-antigen polymerase  28.7 
 
 		 454 aa  46.6  0.001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.814347  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0122  O-antigen polymerase  26.47 
 
 		 1065 aa  46.6  0.001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0853  hypothetical protein  32.91 
 
 		 416 aa  45.8  0.002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2384  O-antigen polymerase  33.59 
 
 		 436 aa  45.1  0.004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.486663  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0127  hypothetical protein  22.47 
 
 		 845 aa  44.7  0.004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0456  hypothetical protein  30.34 
 
 		 438 aa  44.7  0.005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0559  hypothetical protein  29.41 
 
 		 569 aa  44.3  0.006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.261302  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05350  O-antigen polymerase, Wzy protein  32.33 
 
 		 467 aa  43.9  0.007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00185086  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4567  O-antigen polymerase  35.38 
 
 		 717 aa  43.5  0.01  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.79744  normal  0.181696 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>