29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cwoe_5512 on replicon NC_013739
Organism: Conexibacter woesei DSM 14684



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013739  Cwoe_5512  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  100 
 
 
722 aa  1377    Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.219126  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2418  TPR repeat-containing protein  36.78 
 
 
827 aa  52  0.00004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1253  O-antigen polymerase  25.18 
 
 
832 aa  51.2  0.00007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0517425 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2694  O-antigen polymerase  26.2 
 
 
535 aa  51.2  0.00007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.247958  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2417  TPR repeat-containing protein  32.63 
 
 
762 aa  50.1  0.0002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5044  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  32.14 
 
 
233 aa  50.1  0.0002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6170  hypothetical protein  37.18 
 
 
612 aa  48.9  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.198655 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4728  TPR repeat-containing protein  36.36 
 
 
718 aa  48.5  0.0004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.346608 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0912  TPR repeat-containing protein  36.11 
 
 
748 aa  48.5  0.0004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.795031  hitchhiker  0.00626987 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  33.64 
 
 
810 aa  48.5  0.0004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  33.64 
 
 
878 aa  48.1  0.0006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1536  TPR domain-containing protein  26.92 
 
 
174 aa  47.8  0.0007  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1719  TPR repeat-containing protein  31.52 
 
 
583 aa  47.4  0.0009  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2414  TPR repeat-containing protein  32.26 
 
 
589 aa  47  0.001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0639  TPR repeat-containing protein  27.13 
 
 
542 aa  47  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0594  tetratricopeptide TPR_4  40.28 
 
 
601 aa  46.2  0.002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0319  TPR repeat-containing protein  32.99 
 
 
301 aa  45.8  0.002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0540059  normal  0.098872 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1106  TPR repeat-containing protein  27.96 
 
 
605 aa  46.2  0.002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.0000356395  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1618  TPR repeat-containing protein  26.87 
 
 
217 aa  46.2  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00366972 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0122  glycosyl transferase, group 1  26.09 
 
 
3301 aa  45.8  0.002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.326818 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0487  TPR repeat-containing protein  29.31 
 
 
566 aa  45.8  0.003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.679539 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2349  TPR repeat-containing protein  31.82 
 
 
649 aa  45.4  0.003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0186841  normal 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_863  predicted protein  34.62 
 
 
708 aa  45.4  0.004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.622244  normal  0.0203568 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1755  TPR repeat-containing protein  31.71 
 
 
265 aa  45.4  0.004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.0000044478  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0481  TPR repeat-containing protein  25.38 
 
 
3145 aa  45.4  0.004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.948354 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0058  TPR repeat-containing protein  31.11 
 
 
145 aa  45.1  0.005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.393003  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1881  rhomboid-like protein  38.46 
 
 
365 aa  44.3  0.008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.210554  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1350  TPR repeat-containing protein  40.85 
 
 
766 aa  44.3  0.009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1598  hypothetical protein  35.94 
 
 
208 aa  43.9  0.009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000392317  normal  0.531988 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>