More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_0594 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010571  Oter_0594  tetratricopeptide TPR_4  100 
 
 		 601 aa  1191    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3236  tetratricopeptide TPR_4  48.15 
 
 		 514 aa  427  1e-118  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.789976  normal  0.265917 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0492  TPR repeat-containing protein  30.69 
 
 		 586 aa  203  8e-51  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.154426 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0488  TPR repeat-containing protein  30.39 
 
 		 485 aa  162  2e-38  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.160649 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2321  TPR repeat-containing protein  30.52 
 
 		 475 aa  158  3e-37  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.084712  decreased coverage  0.00212856 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0519  TPR repeat-containing protein  30.86 
 
 		 478 aa  137  5e-31  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0200  TPR repeat-containing protein  23.83 
 
 		 505 aa  98.2  3e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24101  hypothetical protein  24.53 
 
 		 725 aa  96.7  1e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2369  TPR repeat-containing protein  34.67 
 
 		 639 aa  93.6  9e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.319986  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0987  TPR repeat-containing protein  33.48 
 
 		 611 aa  93.2  1e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.384547  normal  0.0740288 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0892  TPR repeat-containing protein  29.49 
 
 		 636 aa  92.4  2e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.647896  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02941  hypothetical protein  23.26 
 
 		 1676 aa  92  2e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.673691 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  25.05 
 
 		 878 aa  92.8  2e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1028  TPR repeat-containing protein  33.03 
 
 		 635 aa  91.3  4e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.608823  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0549  TPR repeat-containing protein  33.03 
 
 		 635 aa  91.3  4e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  24.85 
 
 		 810 aa  91.3  4e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0904  TPR repeat-containing protein  28.97 
 
 		 612 aa  90.5  7e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.587904  normal  0.769196 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4141  TPR repeat-containing protein  32.58 
 
 		 637 aa  89.4  2e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.780051  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3028  TPR repeat-containing protein  29.17 
 
 		 620 aa  86.7  0.000000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.985806  normal  0.0142271 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3996  tetratricopeptide TPR_2  25.98 
 
 		 1694 aa  85.9  0.000000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.271204  normal  0.601264 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1619  TPR domain-containing protein  29.36 
 
 		 626 aa  85.1  0.000000000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0978258  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0959  hypothetical protein  29.91 
 
 		 620 aa  85.1  0.000000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.868556 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4628  TPR repeat-containing protein  30.07 
 
 		 714 aa  84.3  0.000000000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.342126 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1499  TPR repeat-containing protein  23.62 
 
 		 486 aa  83.2  0.00000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.329638 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1172  TPR repeat-containing protein  27.9 
 
 		 4079 aa  81.6  0.00000000000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1683  TPR repeat-containing protein  26.92 
 
 		 362 aa  82  0.00000000000003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4282  TPR repeat-containing protein  30.8 
 
 		 715 aa  81.6  0.00000000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2906  TPR repeat-containing protein  33.33 
 
 		 614 aa  80.5  0.00000000000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0475913  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0453  TPR domain-containing protein  33.33 
 
 		 626 aa  80.5  0.00000000000008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.311085  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3015  TPR domain-containing protein  33.33 
 
 		 626 aa  80.5  0.00000000000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2599  TPR domain-containing protein  33.33 
 
 		 614 aa  80.5  0.00000000000008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0734298  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0177  TPR repeat-containing protein  33.33 
 
 		 614 aa  80.5  0.00000000000008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0970  TPR domain-containing protein  33.33 
 
 		 614 aa  80.5  0.00000000000008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2707  glycosyl transferase family protein  21.85 
 
 		 1486 aa  79.3  0.0000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.228337 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2853  TPR repeat-containing protein  20.82 
 
 		 3172 aa  78.2  0.0000000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1094  TPR repeat-containing protein  29.47 
 
 		 685 aa  77.8  0.0000000000005  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3220  TPR repeat-containing protein  30.73 
 
 		 1178 aa  77.8  0.0000000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.166794 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2417  TPR repeat-containing protein  28.93 
 
 		 762 aa  77.4  0.0000000000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1233  TPR repeat-containing protein  24.58 
 
 		 909 aa  77.4  0.0000000000008  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.161918  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1166  TPR domain-containing protein  28.03 
 
 		 266 aa  75.5  0.000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.194624  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0722  TPR repeat-containing protein  27.1 
 
 		 615 aa  75.1  0.000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.434562 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0702  TPR repeat-containing protein  33.63 
 
 		 667 aa  75.5  0.000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.274193  normal  0.091435 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00731  hypothetical protein  24.61 
 
 		 816 aa  74.7  0.000000000005  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.456129 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2403  tetratricopeptide TPR_4  28.77 
 
 		 267 aa  74.3  0.000000000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000143988  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4728  TPR repeat-containing protein  30.69 
 
 		 718 aa  74.3  0.000000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.346608 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1787  TPR repeat-containing protein  25.71 
 
 		 543 aa  73.9  0.000000000007  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.662156  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1492  glycosyl transferase family protein  22.41 
 
 		 1737 aa  73.6  0.000000000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.315595  normal  0.552274 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2418  TPR repeat-containing protein  26.39 
 
 		 827 aa  73.6  0.00000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3643  TPR domain-containing protein  20.86 
 
 		 1979 aa  72.8  0.00000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2904  TPR repeat-containing protein  28.12 
 
 		 265 aa  72.8  0.00000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000121078  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1093  TPR repeat-containing protein  24.63 
 
 		 681 aa  72.4  0.00000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.353622  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2523  hypothetical protein  22.65 
 
 		 795 aa  72.4  0.00000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.184422  normal  0.460331 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2499  PEP-CTERM system TPR-repeat lipoprotein  25.28 
 
 		 935 aa  72  0.00000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  decreased coverage  0.00842249  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1518  TPR repeat-containing protein  22.93 
 
 		 597 aa  72  0.00000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00971618 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28481  hypothetical protein  21.45 
 
 		 462 aa  72  0.00000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0060  TPR repeat-containing protein  22.56 
 
 		 562 aa  71.6  0.00000000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2967  TPR repeat-containing protein  33.33 
 
 		 614 aa  71.2  0.00000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0214  tetratricopeptide repeat domain protein  22.35 
 
 		 1004 aa  70.9  0.00000000007  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.467703  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1087  TPR repeat-containing protein  25.53 
 
 		 808 aa  70.9  0.00000000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24171  hypothetical protein  27.56 
 
 		 733 aa  70.5  0.00000000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0495  TPR repeat-containing protein  26.67 
 
 		 592 aa  69.7  0.0000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.31548  hitchhiker  0.000811281 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3925  TPR repeat-containing protein  26.86 
 
 		 1180 aa  70.1  0.0000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0215  TPR repeat-containing protein  27.74 
 
 		 2262 aa  69.3  0.0000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0297822 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0911  TPR domain-containing protein  28.52 
 
 		 714 aa  68.9  0.0000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.55611 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0122  glycosyl transferase, group 1  21.53 
 
 		 3301 aa  68.6  0.0000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.326818 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0481  TPR repeat-containing protein  24.63 
 
 		 3145 aa  68.6  0.0000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.948354 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1840  TPR repeat-containing protein  24.35 
 
 		 3560 aa  68.2  0.0000000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1449  tetratricopeptide TPR_2  23.01 
 
 		 1067 aa  68.6  0.0000000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3199  TPR repeat-containing protein  21.75 
 
 		 565 aa  68.2  0.0000000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.714786  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1841  TPR repeat-containing protein  27.24 
 
 		 3035 aa  67.8  0.0000000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2439  TPR repeat-containing protein  26.46 
 
 		 448 aa  67.8  0.0000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0207467  normal  0.980065 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3120  TPR repeat-containing protein  24.84 
 
 		 767 aa  67.8  0.0000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19711  hypothetical protein  27.24 
 
 		 865 aa  67  0.0000000009  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.372007  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6918  TPR repeat-containing protein  27.54 
 
 		 847 aa  66.6  0.000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.378966  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4342  TPR repeat-containing protein  26.38 
 
 		 1406 aa  66.2  0.000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.603254  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24071  hypothetical protein  23.82 
 
 		 622 aa  67  0.000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2997  TPR repeat-containing protein  30.16 
 
 		 708 aa  66.6  0.000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0127987 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2266  tetratricopeptide TPR_2  25.98 
 
 		 1213 aa  66.6  0.000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0083  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  22.16 
 
 		 2240 aa  65.9  0.000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0436  tetratricopeptide TPR_2  20.14 
 
 		 1056 aa  65.9  0.000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1096  sulfotransferase  26.13 
 
 		 1764 aa  66.2  0.000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2942  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  22.87 
 
 		 632 aa  66.2  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02961  hypothetical protein  30.14 
 
 		 594 aa  65.9  0.000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0087  TPR repeat-containing protein  23.14 
 
 		 366 aa  65.1  0.000000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1232  TPR repeat-containing protein  23.92 
 
 		 750 aa  65.5  0.000000003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.967237  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1384  TPR repeat-containing protein  24.91 
 
 		 870 aa  65.5  0.000000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.00000149301  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0637  TPR repeat-containing protein  26.27 
 
 		 4489 aa  65.1  0.000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0516  TPR repeat-containing protein  23.71 
 
 		 673 aa  65.1  0.000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.000000776603  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0687  TPR repeat-containing protein  24.65 
 
 		 2262 aa  64.7  0.000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00419541 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3727  TPR repeat-containing protein  23.67 
 
 		 572 aa  64.7  0.000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.239991 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0639  TPR repeat-containing protein  31.43 
 
 		 542 aa  64.7  0.000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2491  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.75 
 
 		 689 aa  64.7  0.000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2322  TPR repeat-containing protein  27.46 
 
 		 935 aa  63.9  0.000000007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0205826 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1516  tetratricopeptide repeat family protein  20.99 
 
 		 561 aa  63.9  0.000000008  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7855  TPR domain-containing protein  26.28 
 
 		 648 aa  63.9  0.000000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.126864 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1855  sulfotransferase  31.82 
 
 		 725 aa  63.9  0.000000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2992  TPR repeat-containing protein  25.09 
 
 		 824 aa  63.9  0.000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000746825 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0661  TPR repeat-containing methyltransferase  20.7 
 
 		 561 aa  63.5  0.00000001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.25847  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0911  tetratricopeptide TPR_4  25.39 
 
 		 875 aa  63.2  0.00000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.379762  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0641  TPR repeat-containing protein  27.04 
 
 		 1094 aa  63.2  0.00000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.230386  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>