More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TDE1536 on replicon NC_002967
Organism: Treponema denticola ATCC 35405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002967  TDE1536  TPR domain-containing protein  100 
 
 
174 aa  360  5.0000000000000005e-99  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  32.87 
 
 
810 aa  89.4  2e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3643  TPR domain-containing protein  31.85 
 
 
1979 aa  88.6  4e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  31.37 
 
 
878 aa  84.7  6e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1823  TPR repeat-containing protein  30.37 
 
 
213 aa  79.7  0.00000000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.510449  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2904  TPR repeat-containing protein  31.79 
 
 
265 aa  80.1  0.00000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000121078  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2417  TPR repeat-containing protein  30.22 
 
 
762 aa  79.3  0.00000000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2604  TPR repeat-containing protein  27.7 
 
 
927 aa  78.6  0.00000000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.010408  normal  0.426767 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1699  TPR repeat-containing protein  31.01 
 
 
409 aa  77  0.0000000000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.52405  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3996  tetratricopeptide TPR_2  30.43 
 
 
1694 aa  77.4  0.0000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.271204  normal  0.601264 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2807  tetratricopeptide TPR_2  30.92 
 
 
576 aa  75.9  0.0000000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.233123 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0200  TPR repeat-containing protein  32.14 
 
 
505 aa  75.1  0.0000000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2942  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.17 
 
 
632 aa  74.7  0.0000000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2367  protein kinase  28.48 
 
 
623 aa  74.3  0.0000000000007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0913  TPR repeat-containing protein  33.59 
 
 
280 aa  74.3  0.0000000000008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.249159  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5110  TPR repeat-containing protein  31.3 
 
 
288 aa  74.3  0.0000000000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.163263  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1361  TPR repeat-containing protein  28.87 
 
 
1276 aa  73.9  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1787  TPR repeat-containing protein  29.41 
 
 
543 aa  73.6  0.000000000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.662156  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0453  TPR domain-containing protein  32.62 
 
 
626 aa  73.2  0.000000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.311085  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0970  TPR domain-containing protein  32.19 
 
 
614 aa  72.8  0.000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0911  tetratricopeptide TPR_4  30.26 
 
 
875 aa  72.8  0.000000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.379762  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0177  TPR repeat-containing protein  32.19 
 
 
614 aa  72.8  0.000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2599  TPR domain-containing protein  32.19 
 
 
614 aa  72.8  0.000000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0734298  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1755  TPR repeat-containing protein  30.86 
 
 
265 aa  72.4  0.000000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.0000044478  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2967  TPR repeat-containing protein  32.62 
 
 
614 aa  72  0.000000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3015  TPR domain-containing protein  32.62 
 
 
626 aa  72.4  0.000000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2349  TPR repeat-containing protein  31.68 
 
 
649 aa  72.4  0.000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0186841  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2906  TPR repeat-containing protein  32.19 
 
 
614 aa  72  0.000000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0475913  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3209  tetratricopeptide repeat-containing protein  30 
 
 
743 aa  72  0.000000000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4508  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.58 
 
 
836 aa  72  0.000000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.885776 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2941  hypothetical protein  27.94 
 
 
560 aa  71.6  0.000000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000171884  normal  0.0147454 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0060  TPR repeat-containing protein  28.14 
 
 
562 aa  71.6  0.000000000006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1449  tetratricopeptide TPR_2  30.43 
 
 
1067 aa  71.2  0.000000000007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0481  TPR repeat-containing protein  29.45 
 
 
3145 aa  70.9  0.000000000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.948354 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0825  TPR repeat-containing protein  27.03 
 
 
739 aa  70.5  0.00000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.423694  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1233  TPR repeat-containing protein  27.03 
 
 
909 aa  70.1  0.00000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.161918  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1087  TPR repeat-containing protein  28.4 
 
 
808 aa  70.1  0.00000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0949  TPR repeat-containing protein  28.87 
 
 
1121 aa  70.5  0.00000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0849269  normal  0.0980091 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_13011  hypothetical protein  30.61 
 
 
737 aa  70.5  0.00000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.113459 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1568  hypothetical protein  28.75 
 
 
820 aa  70.5  0.00000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0639  TPR repeat-containing protein  26.53 
 
 
542 aa  70.1  0.00000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0087  TPR repeat-containing protein  27.56 
 
 
366 aa  69.3  0.00000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1704  TPR repeat-containing protein  29.94 
 
 
265 aa  69.7  0.00000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.12979e-21 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2515  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.38 
 
 
265 aa  69.7  0.00000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000326196  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0930  TPR repeat-containing protein  26.51 
 
 
329 aa  69.3  0.00000000003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1825  TPR repeat-containing protein  32.48 
 
 
523 aa  68.9  0.00000000003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.578572  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0471  TPR repeat-containing protein  26.25 
 
 
1297 aa  68.9  0.00000000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24101  hypothetical protein  28.4 
 
 
725 aa  68.6  0.00000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6182  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  31.68 
 
 
1056 aa  68.9  0.00000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1947  tetratricopeptide TPR_2  27.4 
 
 
564 aa  68.9  0.00000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0106408 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2893  O-linked N-acetylglucosamine transferase  30.34 
 
 
397 aa  68.6  0.00000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.272299 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2328  TPR repeat-containing protein  27.41 
 
 
363 aa  68.2  0.00000000005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.759887 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0393  hypothetical protein  31.08 
 
 
177 aa  68.6  0.00000000005  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.000117319  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4626  TPR repeat-containing protein  26.92 
 
 
452 aa  68.2  0.00000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1619  TPR domain-containing protein  30.82 
 
 
626 aa  67.8  0.00000000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0978258  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1094  TPR repeat-containing protein  26.28 
 
 
685 aa  67.4  0.00000000009  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0783  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.59 
 
 
542 aa  67.4  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8213  TPR repeat-containing protein  28.3 
 
 
392 aa  67  0.0000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0720948  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2659  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.97 
 
 
565 aa  67.4  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.144865 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24161  hypothetical protein  27.33 
 
 
661 aa  67  0.0000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2491  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.94 
 
 
689 aa  66.2  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0319  TPR repeat-containing protein  29.29 
 
 
301 aa  66.6  0.0000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0540059  normal  0.098872 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0384  TPR repeat-containing protein  28.17 
 
 
279 aa  66.6  0.0000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.890218  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0017  tetratricopeptide TPR_3  27.68 
 
 
407 aa  66.2  0.0000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0955  tetratricopeptide TPR_2  26.58 
 
 
635 aa  66.2  0.0000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.750671 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5617  SPINDLY family O-linked N-acetylglucosamine transferase  33.64 
 
 
739 aa  66.6  0.0000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.277247 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3120  TPR repeat-containing protein  32 
 
 
767 aa  66.6  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1841  TPR repeat-containing protein  27.21 
 
 
3035 aa  66.2  0.0000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4628  TPR repeat-containing protein  28.78 
 
 
714 aa  65.9  0.0000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.342126 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2951  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  28.03 
 
 
784 aa  65.9  0.0000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2439  TPR repeat-containing protein  30.2 
 
 
448 aa  65.9  0.0000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0207467  normal  0.980065 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0904  TPR repeat-containing protein  30.87 
 
 
612 aa  65.9  0.0000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.587904  normal  0.769196 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2480  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  30.08 
 
 
1022 aa  65.1  0.0000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0213  TPR repeat-containing protein  27.64 
 
 
409 aa  65.5  0.0000000004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0901  TPR repeat-containing protein  27.69 
 
 
409 aa  65.1  0.0000000004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0157  TPR repeat-containing protein  24.68 
 
 
465 aa  65.1  0.0000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4728  TPR repeat-containing protein  31.41 
 
 
718 aa  65.1  0.0000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.346608 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0083  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.68 
 
 
2240 aa  65.1  0.0000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2419  TPR repeat-containing protein  30.6 
 
 
792 aa  64.7  0.0000000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0484292  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0166  TPR repeat-containing protein  29.2 
 
 
754 aa  64.7  0.0000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.268335  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1172  TPR repeat-containing protein  26.85 
 
 
4079 aa  64.7  0.0000000007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2403  tetratricopeptide TPR_4  28.48 
 
 
267 aa  64.7  0.0000000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000143988  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1811  TPR repeat-containing protein  25.19 
 
 
523 aa  64.7  0.0000000007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1863  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.4 
 
 
344 aa  64.3  0.0000000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1837  TPR repeat-containing protein  28.4 
 
 
344 aa  64.3  0.0000000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1827  TPR repeat-containing protein  28.89 
 
 
761 aa  64.3  0.0000000008  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0460239  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3466  TPR repeat-containing protein  26.21 
 
 
374 aa  63.9  0.0000000009  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1184  TPR domain-containing protein  30.85 
 
 
222 aa  63.9  0.000000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.441654  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1232  TPR repeat-containing protein  23.33 
 
 
750 aa  63.9  0.000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.967237  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4803  tetratricopeptide TPR_3  26.11 
 
 
340 aa  63.9  0.000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3338  TPR repeat-containing protein  31.78 
 
 
595 aa  63.5  0.000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.257374 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0484  TPR repeat-containing protein  25.85 
 
 
435 aa  63.5  0.000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5004  TPR repeat-containing protein  28.74 
 
 
699 aa  63.9  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2626  TPR repeat-containing protein  30.15 
 
 
587 aa  63.5  0.000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2431  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  27.39 
 
 
818 aa  63.5  0.000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0698  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.56 
 
 
784 aa  63.5  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19711  hypothetical protein  27.01 
 
 
865 aa  63.5  0.000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.372007  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0153  TPR repeat-containing protein  29.2 
 
 
754 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.372833  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7855  TPR domain-containing protein  28.26 
 
 
648 aa  62.8  0.000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.126864 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0278  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.33 
 
 
207 aa  63.2  0.000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00000289042  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>