More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlab_0393 on replicon NC_008942
Organism: Methanocorpusculum labreanum Z



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008942  Mlab_0393  hypothetical protein  100 
 
 
177 aa  365  1e-100  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.000117319  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0930  TPR repeat-containing protein  32.72 
 
 
329 aa  95.9  2e-19  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2604  TPR repeat-containing protein  33.73 
 
 
927 aa  90.5  1e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.010408  normal  0.426767 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3643  TPR domain-containing protein  33.54 
 
 
1979 aa  90.5  1e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0087  TPR repeat-containing protein  31.45 
 
 
366 aa  80.5  0.00000000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1787  TPR repeat-containing protein  30.06 
 
 
543 aa  79.3  0.00000000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.662156  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2431  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  27.44 
 
 
818 aa  79.7  0.00000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1361  TPR repeat-containing protein  33.97 
 
 
1276 aa  80.1  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2807  tetratricopeptide TPR_2  31.82 
 
 
576 aa  79.3  0.00000000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.233123 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0913  TPR repeat-containing protein  30.18 
 
 
280 aa  78.2  0.00000000000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.249159  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0698  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  30.36 
 
 
784 aa  77.8  0.00000000000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2893  O-linked N-acetylglucosamine transferase  27.81 
 
 
397 aa  77  0.0000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.272299 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3996  tetratricopeptide TPR_2  31.48 
 
 
1694 aa  76.3  0.0000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.271204  normal  0.601264 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0060  TPR repeat-containing protein  27.81 
 
 
562 aa  75.9  0.0000000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5110  TPR repeat-containing protein  29.8 
 
 
288 aa  75.9  0.0000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.163263  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1172  TPR repeat-containing protein  30.18 
 
 
4079 aa  75.9  0.0000000000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3209  tetratricopeptide repeat-containing protein  28.38 
 
 
743 aa  74.3  0.0000000000008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2367  protein kinase  33.11 
 
 
623 aa  74.3  0.0000000000009  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1451  TPR repeat-containing protein  32.54 
 
 
244 aa  73.6  0.000000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.346129  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0481  TPR repeat-containing protein  30.06 
 
 
3145 aa  73.6  0.000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.948354 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1518  TPR repeat-containing protein  24.87 
 
 
375 aa  73.2  0.000000000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.946116  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2975  TPR repeat-containing protein  29.53 
 
 
716 aa  72.8  0.000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2942  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.27 
 
 
632 aa  72.8  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2515  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.66 
 
 
265 aa  72.8  0.000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000326196  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2951  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  26.83 
 
 
784 aa  71.6  0.000000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2941  hypothetical protein  28.66 
 
 
560 aa  71.6  0.000000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000171884  normal  0.0147454 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5004  TPR repeat-containing protein  30.06 
 
 
699 aa  71.2  0.000000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1233  TPR repeat-containing protein  30.72 
 
 
909 aa  71.2  0.000000000008  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.161918  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0825  TPR repeat-containing protein  30.72 
 
 
739 aa  70.9  0.000000000009  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.423694  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  26.38 
 
 
810 aa  70.5  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1704  TPR repeat-containing protein  28.97 
 
 
265 aa  70.5  0.00000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.12979e-21 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2349  TPR repeat-containing protein  28.67 
 
 
649 aa  70.5  0.00000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0186841  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3569  tetratricopeptide TPR_2  25.15 
 
 
314 aa  70.5  0.00000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1622  TPR repeat-containing protein  28.48 
 
 
254 aa  70.5  0.00000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  26.38 
 
 
878 aa  70.1  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4239  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.88 
 
 
363 aa  69.3  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4301  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.88 
 
 
363 aa  69.3  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.124533 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2403  tetratricopeptide TPR_4  31.9 
 
 
267 aa  69.3  0.00000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000143988  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0384  TPR repeat-containing protein  30.3 
 
 
279 aa  69.3  0.00000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.890218  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2468  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  29.75 
 
 
629 aa  69.3  0.00000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0996556  normal  0.406351 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2491  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.3 
 
 
689 aa  68.6  0.00000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1536  TPR domain-containing protein  31.08 
 
 
174 aa  68.6  0.00000000005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0901  TPR repeat-containing protein  26.47 
 
 
409 aa  68.2  0.00000000005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2953  TPR repeat-containing protein  24.54 
 
 
711 aa  68.6  0.00000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0781794 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1699  TPR repeat-containing protein  25.74 
 
 
409 aa  68.2  0.00000000006  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.52405  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1816  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.45 
 
 
174 aa  68.2  0.00000000007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.706847  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2895  O-linked N-acetylglucosamine transferase  30 
 
 
292 aa  67.8  0.00000000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0140366 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1755  TPR repeat-containing protein  29.2 
 
 
265 aa  67  0.0000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.0000044478  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1333  TPR repeat-containing protein  26.11 
 
 
288 aa  67  0.0000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.433409  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0157  TPR repeat-containing protein  28.06 
 
 
465 aa  67  0.0000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1606  tetratricopeptide TPR_2  25.15 
 
 
240 aa  67  0.0000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.799027 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0471  TPR repeat-containing protein  30.36 
 
 
1297 aa  67  0.0000000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0114  TPR repeat-containing protein  27.95 
 
 
602 aa  67  0.0000000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.606428  normal  0.312557 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0629  TPR repeat-containing protein  29.49 
 
 
1049 aa  67.4  0.0000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28481  hypothetical protein  27.04 
 
 
462 aa  66.2  0.0000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3062  hypothetical protein  25.58 
 
 
391 aa  66.6  0.0000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.386129 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24101  hypothetical protein  26.67 
 
 
725 aa  66.2  0.0000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0812  tetratricopeptide TPR_2  34.65 
 
 
452 aa  66.2  0.0000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.159009  normal  0.340374 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0464  TPR repeat-containing protein  27.48 
 
 
205 aa  66.2  0.0000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0011  hypothetical protein  26.17 
 
 
1138 aa  65.9  0.0000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.41301  normal  0.0644501 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6182  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  27.33 
 
 
1056 aa  65.9  0.0000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0996  TPR repeat-containing protein  31.76 
 
 
634 aa  65.9  0.0000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.325764  normal  0.0470836 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1449  tetratricopeptide TPR_2  27.06 
 
 
1067 aa  65.9  0.0000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0083  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  30.77 
 
 
2240 aa  65.9  0.0000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2862  TPR repeat-containing protein  27.5 
 
 
448 aa  65.5  0.0000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.375816 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1166  TPR domain-containing protein  32.3 
 
 
266 aa  65.5  0.0000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.194624  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00051  TPR-repeat pilus assembly protein TadD  24.2 
 
 
276 aa  65.5  0.0000000004  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4626  TPR repeat-containing protein  26.7 
 
 
452 aa  65.1  0.0000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2904  TPR repeat-containing protein  27.85 
 
 
265 aa  65.1  0.0000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000121078  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4726  serine/threonine protein kinase with TPR repeats  24.53 
 
 
730 aa  64.7  0.0000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4355  TPR repeat-containing protein  26.28 
 
 
1192 aa  64.7  0.0000000006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.862224  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0213  TPR repeat-containing protein  24.26 
 
 
409 aa  64.7  0.0000000007  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7349  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  26.67 
 
 
988 aa  64.7  0.0000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0738846  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24071  hypothetical protein  25.62 
 
 
622 aa  64.7  0.0000000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0287  TPR repeat-containing protein  28.89 
 
 
217 aa  64.7  0.0000000007  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.37702  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4093  TPR repeat-containing protein  28.06 
 
 
246 aa  64.3  0.0000000008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1823  TPR repeat-containing protein  28.47 
 
 
213 aa  64.3  0.0000000009  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.510449  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0949  TPR repeat-containing protein  27.54 
 
 
1121 aa  64.3  0.0000000009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0849269  normal  0.0980091 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0955  tetratricopeptide TPR_2  25.31 
 
 
635 aa  64.3  0.0000000009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.750671 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0336  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.61 
 
 
297 aa  63.9  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0329  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.61 
 
 
297 aa  63.9  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1605  tetratricopeptide TPR_2  25.3 
 
 
252 aa  63.9  0.000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.790082 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28711  hypothetical protein  27.92 
 
 
334 aa  63.9  0.000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1568  hypothetical protein  27.06 
 
 
820 aa  63.9  0.000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2383  TPR repeat-containing protein  28 
 
 
1421 aa  63.5  0.000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.823331 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2379  hypothetical protein  28.89 
 
 
283 aa  62.8  0.000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.14303 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3213  TPR repeat-containing protein  26.75 
 
 
227 aa  63.2  0.000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2480  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  25.33 
 
 
1022 aa  62.8  0.000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2417  TPR repeat-containing protein  33.09 
 
 
762 aa  62.4  0.000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2934  tetratricopeptide TPR_2  27.83 
 
 
135 aa  62.8  0.000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.000000970662  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0369  TPR repeat-containing protein  27.66 
 
 
446 aa  62.4  0.000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2318  TPR repeat-containing protein  25.88 
 
 
245 aa  62.4  0.000000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2318  tetratricopeptide protein  25.9 
 
 
573 aa  62  0.000000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1312  TPR repeat-containing protein  32 
 
 
1069 aa  62  0.000000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.530092  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0280  TPR domain-containing protein  30.71 
 
 
1013 aa  61.6  0.000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.416311 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1811  TPR repeat-containing protein  25.81 
 
 
523 aa  61.6  0.000000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3340  TPR repeat-containing protein  31.13 
 
 
828 aa  61.6  0.000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.710571 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28641  hypothetical protein  27.5 
 
 
581 aa  61.6  0.000000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0419  TPR repeat-containing protein  29.2 
 
 
224 aa  61.2  0.000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.338331  normal  0.0276215 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1947  tetratricopeptide TPR_2  24.31 
 
 
564 aa  61.2  0.000000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0106408 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>