More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PMN2A_1333 on replicon NC_007335
Organism: Prochlorococcus marinus str. NATL2A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007335  PMN2A_1333  TPR repeat-containing protein  100 
 
 		 288 aa  573  1.0000000000000001e-162  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.433409  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00051  TPR-repeat pilus assembly protein TadD  90.91 
 
 		 276 aa  502  1e-141  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0006  TPR repeat-containing protein  40.78 
 
 		 287 aa  193  2e-48  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00051  Flp pilus assembly protein TadD  39.86 
 
 		 297 aa  191  8e-48  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000470033 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0006  TPR repeat-containing protein  38.71 
 
 		 293 aa  189  4e-47  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.437171  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0006  hypothetical protein  35.29 
 
 		 293 aa  179  5.999999999999999e-44  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00051  TPR-repeat pilus assembly protein TadD  41.31 
 
 		 284 aa  176  3e-43  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.668643  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00051  TPR-repeat pilus assembly protein TadD  35.93 
 
 		 297 aa  173  1.9999999999999998e-42  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00051  TPR-repeat pilus assembly protein TadD  36.17 
 
 		 287 aa  169  7e-41  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.589169  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00051  TPR-repeat pilus assembly protein TadD  38.06 
 
 		 287 aa  165  8e-40  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0531  TPR repeat-containing protein  30.91 
 
 		 287 aa  145  7.0000000000000006e-34  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.259397  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2856  TPR repeat-containing protein  33.98 
 
 		 297 aa  143  3e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0927  TPR repeat-containing protein  28.47 
 
 		 291 aa  142  9e-33  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4071  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  32.01 
 
 		 291 aa  141  9.999999999999999e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_5036  tetratricopeptide TPR_2  29.07 
 
 		 288 aa  133  3e-30  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0840723  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3161  TPR repeat-containing protein  29.62 
 
 		 297 aa  132  6.999999999999999e-30  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2957  TPR repeat-containing protein  29.62 
 
 		 297 aa  132  6.999999999999999e-30  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.338311  normal  0.060469 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2822  tetratricopeptide repeat-containing protein  29.92 
 
 		 290 aa  120  1.9999999999999998e-26  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0986349  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1787  TPR repeat-containing protein  30 
 
 		 543 aa  96.7  4e-19  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.662156  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28481  hypothetical protein  28.28 
 
 		 462 aa  87  3e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3996  tetratricopeptide TPR_2  26.41 
 
 		 1694 aa  87.4  3e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.271204  normal  0.601264 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4726  serine/threonine protein kinase with TPR repeats  28.06 
 
 		 730 aa  86.7  5e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28721  hypothetical protein  29.44 
 
 		 706 aa  82.8  0.000000000000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2951  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  25.5 
 
 		 784 aa  82.4  0.000000000000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2431  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  25.97 
 
 		 818 aa  82  0.00000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6182  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  28.21 
 
 		 1056 aa  80.9  0.00000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2604  TPR repeat-containing protein  26.54 
 
 		 927 aa  79.3  0.00000000000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.010408  normal  0.426767 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0930  TPR repeat-containing protein  29.68 
 
 		 329 aa  79  0.00000000000008  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2321  TPR repeat-containing protein  28.33 
 
 		 750 aa  78.2  0.0000000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1840  TPR repeat-containing protein  27.81 
 
 		 3560 aa  78.2  0.0000000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2135  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  31.37 
 
 		 373 aa  78.6  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.204203  normal  0.945333 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0637  TPR repeat-containing protein  28.95 
 
 		 4489 aa  77.8  0.0000000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0384  TPR repeat-containing protein  21.88 
 
 		 279 aa  77.4  0.0000000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.890218  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0060  TPR repeat-containing protein  24.88 
 
 		 562 aa  76.6  0.0000000000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1841  TPR repeat-containing protein  28.05 
 
 		 3035 aa  76.6  0.0000000000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28691  hypothetical protein  26.92 
 
 		 306 aa  76.6  0.0000000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0783  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24.6 
 
 		 542 aa  76.3  0.0000000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28641  hypothetical protein  25 
 
 		 581 aa  75.9  0.0000000000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1361  TPR repeat-containing protein  29.94 
 
 		 1276 aa  75.9  0.0000000000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1172  TPR repeat-containing protein  29.7 
 
 		 4079 aa  75.9  0.0000000000008  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2023  TPR domain-containing protein  24.73 
 
 		 369 aa  75.5  0.000000000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000313787  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7349  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  26.34 
 
 		 988 aa  74.7  0.000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0738846  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1811  TPR repeat-containing protein  27.17 
 
 		 523 aa  74.3  0.000000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0698  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  23.22 
 
 		 784 aa  73.9  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2439  TPR repeat-containing protein  28.48 
 
 		 448 aa  73.2  0.000000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0207467  normal  0.980065 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0641  TPR repeat-containing protein  27.7 
 
 		 1094 aa  73.2  0.000000000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.230386  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0114  TPR repeat-containing protein  28.72 
 
 		 602 aa  73.2  0.000000000005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.606428  normal  0.312557 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28501  hypothetical protein  26.32 
 
 		 706 aa  72.4  0.000000000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0955  tetratricopeptide TPR_2  27.04 
 
 		 635 aa  72.4  0.000000000008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.750671 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5131  TPR repeat-containing protein  26.06 
 
 		 361 aa  72  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000131061 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0901  TPR repeat-containing protein  28.06 
 
 		 409 aa  71.6  0.00000000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1657  TPR repeat-containing protein  30.54 
 
 		 594 aa  71.6  0.00000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0658919  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4492  TPR repeat-containing protein  25.69 
 
 		 605 aa  70.9  0.00000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1451  TPR repeat-containing protein  25.15 
 
 		 244 aa  71.2  0.00000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.346129  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3793  TPR repeat-containing protein  26.71 
 
 		 428 aa  71.2  0.00000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.085128 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2899  TPR repeat-containing protein  25.26 
 
 		 269 aa  70.5  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0157  TPR repeat-containing protein  25.61 
 
 		 465 aa  70.5  0.00000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2403  tetratricopeptide TPR_4  27.39 
 
 		 267 aa  70.5  0.00000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000143988  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0913  TPR repeat-containing protein  32.88 
 
 		 280 aa  70.5  0.00000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.249159  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2480  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  27.18 
 
 		 1022 aa  70.5  0.00000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2942  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.78 
 
 		 632 aa  70.9  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0540  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  27.63 
 
 		 1056 aa  70.1  0.00000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0423513  normal  0.0609988 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  28.74 
 
 		 878 aa  70.1  0.00000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2383  TPR repeat-containing protein  26.57 
 
 		 1421 aa  69.7  0.00000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.823331 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_17941  TPR repeat-containing protein  26.07 
 
 		 404 aa  69.3  0.00000000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.398676 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2318  tetratricopeptide protein  26.11 
 
 		 573 aa  69.3  0.00000000007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2349  TPR repeat-containing protein  29.07 
 
 		 649 aa  69.3  0.00000000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0186841  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3796  tetratricopeptide TPR_2  25.73 
 
 		 385 aa  69.3  0.00000000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.367432  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28681  hypothetical protein  26.62 
 
 		 539 aa  68.9  0.00000000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.71597 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0882  TPR repeat-containing protein  27.7 
 
 		 388 aa  68.9  0.00000000009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0911  tetratricopeptide TPR_4  26.84 
 
 		 875 aa  68.6  0.0000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.379762  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0908  TPR repeat-containing protein  27.7 
 
 		 388 aa  68.9  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  29.34 
 
 		 810 aa  68.9  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0087  TPR repeat-containing protein  22.84 
 
 		 366 aa  68.2  0.0000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4355  TPR repeat-containing protein  22.48 
 
 		 1192 aa  68.2  0.0000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.862224  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0430  TPR domain-containing protein  27.33 
 
 		 338 aa  68.2  0.0000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0605051  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4774  TPR repeat-containing protein  28.1 
 
 		 371 aa  67.8  0.0000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.300856  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0213  TPR repeat-containing protein  28.79 
 
 		 409 aa  67.8  0.0000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2941  hypothetical protein  25 
 
 		 560 aa  67.8  0.0000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000171884  normal  0.0147454 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1362  TPR repeat-containing protein  25.62 
 
 		 376 aa  67.8  0.0000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2807  tetratricopeptide TPR_2  25 
 
 		 576 aa  67.8  0.0000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.233123 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2468  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  25 
 
 		 629 aa  68.2  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0996556  normal  0.406351 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0003  TPR repeat-containing protein  28.49 
 
 		 466 aa  67.8  0.0000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1947  tetratricopeptide TPR_2  28.31 
 
 		 564 aa  67.8  0.0000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0106408 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2953  TPR repeat-containing protein  28.21 
 
 		 711 aa  67.8  0.0000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0781794 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1699  TPR repeat-containing protein  30 
 
 		 409 aa  67.4  0.0000000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.52405  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3199  TPR repeat-containing protein  29.84 
 
 		 565 aa  67.4  0.0000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.714786  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28711  hypothetical protein  26.51 
 
 		 334 aa  67  0.0000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1568  hypothetical protein  31.93 
 
 		 820 aa  67.4  0.0000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0393  hypothetical protein  26.11 
 
 		 177 aa  67  0.0000000003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.000117319  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5004  TPR repeat-containing protein  24.75 
 
 		 699 aa  67  0.0000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_863  predicted protein  24.64 
 
 		 708 aa  66.2  0.0000000005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.622244  normal  0.0203568 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28701  hypothetical protein  24.49 
 
 		 582 aa  66.2  0.0000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0083  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.4 
 
 		 2240 aa  66.2  0.0000000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4041  TPR repeat-containing protein  25.66 
 
 		 280 aa  65.9  0.0000000007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.768911  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2606  tetratricopeptide TPR_2  26.62 
 
 		 643 aa  65.9  0.0000000007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2318  TPR repeat-containing protein  30.14 
 
 		 245 aa  65.9  0.0000000009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1653  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.95 
 
 		 758 aa  65.5  0.0000000009  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3028  TPR repeat-containing protein  25.26 
 
 		 620 aa  65.1  0.000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.985806  normal  0.0142271 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_13031  TPR repeat-containing protein  26.32 
 
 		 306 aa  65.5  0.000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0823406 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>