More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_0419 on replicon NC_007413
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007413  Ava_0419  TPR repeat-containing protein  100 
 
 
224 aa  456  1e-127  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.338331  normal  0.0276215 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3213  TPR repeat-containing protein  67.11 
 
 
227 aa  323  1e-87  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4239  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  39.3 
 
 
363 aa  150  1e-35  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4301  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  39.3 
 
 
363 aa  149  4e-35  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.124533 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2562  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  39.78 
 
 
364 aa  142  3e-33  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1633  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  42.94 
 
 
358 aa  139  3.9999999999999997e-32  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  decreased coverage  0.000383939  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3796  tetratricopeptide TPR_2  37.39 
 
 
385 aa  137  2e-31  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.367432  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1006  TPR repeat-containing protein  32.35 
 
 
359 aa  92  6e-18  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.476893  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2942  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  34.36 
 
 
632 aa  89  5e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  35.29 
 
 
878 aa  87.8  1e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  36.55 
 
 
810 aa  87  2e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0825  TPR repeat-containing protein  29.56 
 
 
739 aa  86.7  3e-16  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.423694  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24101  hypothetical protein  27.67 
 
 
725 aa  86.3  3e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2403  tetratricopeptide TPR_4  30.72 
 
 
267 aa  85.5  5e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000143988  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2203  TPR repeat-containing protein  34.59 
 
 
331 aa  83.2  0.000000000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0481  TPR repeat-containing protein  27.04 
 
 
3145 aa  81.6  0.000000000000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.948354 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3746  TPR repeat-containing protein  28.49 
 
 
602 aa  79.7  0.00000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.824926  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28641  hypothetical protein  35.71 
 
 
581 aa  78.6  0.00000000000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28721  hypothetical protein  35.2 
 
 
706 aa  77.8  0.0000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1232  TPR repeat-containing protein  28.85 
 
 
750 aa  77  0.0000000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.967237  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2491  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.92 
 
 
689 aa  77.4  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3295  TPR repeat-containing protein  28.19 
 
 
311 aa  77.4  0.0000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1233  TPR repeat-containing protein  32.33 
 
 
909 aa  76.3  0.0000000000003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.161918  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4803  tetratricopeptide TPR_3  27.37 
 
 
340 aa  76.6  0.0000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3865  TPR repeat protein  29.07 
 
 
503 aa  76.3  0.0000000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_20371  hypothetical protein  33.33 
 
 
233 aa  76.3  0.0000000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0775177 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2947  tetratricopeptide TPR_2  29.93 
 
 
321 aa  76.3  0.0000000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.708581 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1094  TPR repeat-containing protein  29.49 
 
 
685 aa  75.5  0.0000000000005  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28681  hypothetical protein  33.6 
 
 
539 aa  75.5  0.0000000000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.71597 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1518  TPR repeat-containing protein  24.24 
 
 
375 aa  75.5  0.0000000000007  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.946116  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28711  hypothetical protein  30.32 
 
 
334 aa  75.1  0.0000000000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0369  TPR repeat-containing protein  28.19 
 
 
446 aa  74.7  0.000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4437  glycosyl transferase family protein  28.32 
 
 
1061 aa  73.6  0.000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0955  TPR repeat-containing protein  30.83 
 
 
637 aa  73.6  0.000000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4728  TPR repeat-containing protein  33.55 
 
 
718 aa  74.3  0.000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.346608 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28501  hypothetical protein  33.6 
 
 
706 aa  73.9  0.000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28701  hypothetical protein  34.13 
 
 
582 aa  73.6  0.000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1000  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  31.48 
 
 
219 aa  73.2  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.810235  normal  0.0608831 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2604  TPR repeat-containing protein  29.32 
 
 
927 aa  72.8  0.000000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.010408  normal  0.426767 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00731  hypothetical protein  29.61 
 
 
816 aa  72.8  0.000000000004  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.456129 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3793  TPR repeat-containing protein  29.84 
 
 
428 aa  72.8  0.000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.085128 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28481  hypothetical protein  29.75 
 
 
462 aa  72.4  0.000000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2893  O-linked N-acetylglucosamine transferase  26.38 
 
 
397 aa  72.8  0.000000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.272299 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1678  TPR repeat-containing protein  35.07 
 
 
240 aa  72.4  0.000000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2383  TPR repeat-containing protein  32.37 
 
 
1421 aa  72.4  0.000000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.823331 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0215  TPR repeat-containing protein  28.48 
 
 
2262 aa  72  0.000000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0297822 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1492  glycosyl transferase family protein  27.6 
 
 
1737 aa  72.4  0.000000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.315595  normal  0.552274 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2471  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  36.44 
 
 
406 aa  72  0.000000000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0400427  normal  0.45906 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24081  hypothetical protein  32.8 
 
 
764 aa  72  0.000000000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3643  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  36.44 
 
 
406 aa  72  0.000000000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1178  TPR repeat-containing protein  29.12 
 
 
280 aa  71.6  0.000000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_17941  TPR repeat-containing protein  27.94 
 
 
404 aa  71.6  0.00000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.398676 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2417  TPR repeat-containing protein  27.56 
 
 
762 aa  70.9  0.00000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1093  TPR repeat-containing protein  27.67 
 
 
681 aa  71.6  0.00000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.353622  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3194  O-GlcNAc transferase, p110 subunit  30.88 
 
 
349 aa  71.2  0.00000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.756541  hitchhiker  0.0088423 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5131  TPR repeat-containing protein  27.93 
 
 
361 aa  71.2  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000131061 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_13031  TPR repeat-containing protein  30.67 
 
 
306 aa  71.2  0.00000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0823406 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2048  TPR repeat-containing protein  25.12 
 
 
573 aa  70.1  0.00000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.732994  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2135  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.83 
 
 
373 aa  70.9  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.204203  normal  0.945333 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1719  TPR repeat-containing protein  30.19 
 
 
583 aa  70.9  0.00000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0011  hypothetical protein  28.19 
 
 
1138 aa  70.5  0.00000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.41301  normal  0.0644501 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2948  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.51 
 
 
249 aa  70.5  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3148  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.72 
 
 
249 aa  70.5  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.00000145051  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0122  glycosyl transferase, group 1  26.86 
 
 
3301 aa  70.5  0.00000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.326818 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0163  TPR repeat-containing protein  25.58 
 
 
356 aa  70.9  0.00000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00233758  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1356  beta-lactamase domain-containing protein  26.35 
 
 
833 aa  70.1  0.00000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1755  TPR repeat-containing protein  27.15 
 
 
265 aa  70.1  0.00000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.0000044478  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2853  TPR repeat-containing protein  26.86 
 
 
3172 aa  70.1  0.00000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2515  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24.71 
 
 
265 aa  69.7  0.00000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000326196  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3982  TPR repeat-containing protein  31.25 
 
 
305 aa  68.9  0.00000000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.588459  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2708  tetratricopeptide TPR_2  24.71 
 
 
979 aa  69.3  0.00000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.169437 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2807  tetratricopeptide TPR_2  30.29 
 
 
576 aa  68.9  0.00000000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.233123 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2231  TPR repeat-containing protein  23.46 
 
 
265 aa  68.6  0.00000000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00000000660918  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3161  tetratricopeptide TPR_2  25.54 
 
 
444 aa  68.6  0.00000000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1683  TPR repeat-containing protein  30.08 
 
 
362 aa  67.8  0.0000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1704  TPR repeat-containing protein  25.87 
 
 
265 aa  68.2  0.0000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.12979e-21 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2861  sulfotransferase  26.17 
 
 
681 aa  67.4  0.0000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.392476 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1166  TPR domain-containing protein  28.67 
 
 
266 aa  67.4  0.0000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.194624  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3267  glycosyl transferase family 2  25.37 
 
 
1252 aa  67  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_20571  SAM-binding motif-containing protein  28.29 
 
 
780 aa  67  0.0000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.183834 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2854  glycosyl transferase family 2  25.37 
 
 
1252 aa  67.4  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.956112  normal  0.0955707 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4554  TPR repeat-containing protein  30.91 
 
 
547 aa  67  0.0000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.196541  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24071  hypothetical protein  23.53 
 
 
622 aa  67  0.0000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0191  TPR repeat-containing protein  26.7 
 
 
250 aa  67  0.0000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.641193  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2907  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.41 
 
 
471 aa  67  0.0000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0662  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  30.16 
 
 
330 aa  67.4  0.0000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0114263  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3314  tetratricopeptide TPR_2  33.64 
 
 
1240 aa  67  0.0000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.689174  normal  0.286856 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2862  TPR repeat-containing protein  27.46 
 
 
448 aa  67  0.0000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.375816 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0301  TPR repeat-containing protein  27.27 
 
 
1827 aa  66.2  0.0000000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1516  tetratricopeptide repeat family protein  28.21 
 
 
561 aa  66.6  0.0000000003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0190  TPR repeat-containing protein  26.01 
 
 
601 aa  66.6  0.0000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4355  TPR repeat-containing protein  30.23 
 
 
1192 aa  66.2  0.0000000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.862224  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0099  TPR repeat-containing protein  26.2 
 
 
243 aa  66.2  0.0000000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0661  TPR repeat-containing methyltransferase  28.21 
 
 
561 aa  66.2  0.0000000004  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.25847  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1568  hypothetical protein  28.21 
 
 
820 aa  66.2  0.0000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_863  predicted protein  28.68 
 
 
708 aa  65.9  0.0000000005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.622244  normal  0.0203568 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0911  tetratricopeptide TPR_4  30.89 
 
 
875 aa  65.9  0.0000000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.379762  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0917  TPR repeat-containing protein  26.92 
 
 
566 aa  65.9  0.0000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00563549 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0157  TPR repeat-containing protein  27.41 
 
 
465 aa  65.5  0.0000000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2859  sulfotransferase  26.42 
 
 
832 aa  65.1  0.0000000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.398491 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>