More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mhun_1606 on replicon NC_007796
Organism: Methanospirillum hungatei JF-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007796  Mhun_1606  tetratricopeptide TPR_2  100 
 
 
240 aa  499  1e-140  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.799027 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2604  TPR repeat-containing protein  37.06 
 
 
927 aa  127  2.0000000000000002e-28  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.010408  normal  0.426767 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0930  TPR repeat-containing protein  32.52 
 
 
329 aa  120  1.9999999999999998e-26  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1361  TPR repeat-containing protein  31.73 
 
 
1276 aa  120  1.9999999999999998e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2941  hypothetical protein  30.74 
 
 
560 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000171884  normal  0.0147454 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2893  O-linked N-acetylglucosamine transferase  33.68 
 
 
397 aa  116  3e-25  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.272299 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1787  TPR repeat-containing protein  27.04 
 
 
543 aa  115  5e-25  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.662156  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3996  tetratricopeptide TPR_2  34.01 
 
 
1694 aa  111  8.000000000000001e-24  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.271204  normal  0.601264 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0087  TPR repeat-containing protein  30.05 
 
 
366 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1451  TPR repeat-containing protein  31.1 
 
 
244 aa  109  4.0000000000000004e-23  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.346129  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0060  TPR repeat-containing protein  26.47 
 
 
562 aa  109  5e-23  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3569  tetratricopeptide TPR_2  32.09 
 
 
314 aa  108  5e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0114  TPR repeat-containing protein  32.49 
 
 
602 aa  108  1e-22  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.606428  normal  0.312557 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4726  serine/threonine protein kinase with TPR repeats  31.68 
 
 
730 aa  107  2e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0675  TPR repeat-containing protein  28.33 
 
 
344 aa  105  6e-22  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4508  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  31.75 
 
 
836 aa  105  7e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.885776 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4626  TPR repeat-containing protein  27.59 
 
 
452 aa  105  7e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3643  TPR domain-containing protein  31.25 
 
 
1979 aa  105  8e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3062  hypothetical protein  30.65 
 
 
391 aa  102  4e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.386129 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2318  tetratricopeptide protein  30.46 
 
 
573 aa  102  7e-21  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1172  TPR repeat-containing protein  29.5 
 
 
4079 aa  100  1e-20  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1605  tetratricopeptide TPR_2  26.81 
 
 
252 aa  99.4  4e-20  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.790082 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2953  TPR repeat-containing protein  33.96 
 
 
711 aa  99.8  4e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0781794 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0157  TPR repeat-containing protein  28.43 
 
 
465 aa  97.1  2e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2807  tetratricopeptide TPR_2  26.39 
 
 
576 aa  96.7  3e-19  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.233123 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2994  TPR repeat-containing protein  29 
 
 
317 aa  96.3  4e-19  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0629  TPR repeat-containing protein  27.27 
 
 
1049 aa  96.3  4e-19  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1552  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  30.96 
 
 
707 aa  95.9  5e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0225548 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5004  TPR repeat-containing protein  29.27 
 
 
699 aa  95.9  5e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2320  TPR repeat-containing protein  33.15 
 
 
617 aa  95.9  5e-19  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2005  TPR repeat-containing protein  28.5 
 
 
512 aa  95.5  6e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.915591 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3507  protein prenyltransferase, alpha subunit  27.5 
 
 
1007 aa  95.1  8e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.223985 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0280  TPR domain-containing protein  30.17 
 
 
1013 aa  95.1  9e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.416311 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2431  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  25.39 
 
 
818 aa  93.6  3e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4355  TPR repeat-containing protein  29.06 
 
 
1192 aa  93.2  3e-18  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.862224  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0698  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  30.89 
 
 
784 aa  92.8  5e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0011  hypothetical protein  30.1 
 
 
1138 aa  92  7e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.41301  normal  0.0644501 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2367  protein kinase  28.39 
 
 
623 aa  92  8e-18  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1362  TPR repeat-containing protein  28.43 
 
 
376 aa  91.7  9e-18  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2461  hypothetical protein  28 
 
 
398 aa  90.5  2e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.125521  normal  0.0258605 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0384  TPR repeat-containing protein  25.54 
 
 
279 aa  90.9  2e-17  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.890218  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2212  TPR repeat-containing protein  28.57 
 
 
1276 aa  90.1  3e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.524691  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2951  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  26 
 
 
784 aa  90.1  3e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3049  TPR repeat-containing protein  30.77 
 
 
591 aa  89.7  3e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000157665  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0955  tetratricopeptide TPR_2  28.99 
 
 
635 aa  89.4  4e-17  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.750671 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1474  TPR repeat-containing protein  30.82 
 
 
162 aa  89.7  4e-17  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0444734  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2680  peptidase S41  26.48 
 
 
745 aa  89  7e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.20871  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0913  TPR repeat-containing protein  25.54 
 
 
280 aa  88.6  8e-17  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.249159  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0564  TPR repeat-containing protein  28.43 
 
 
202 aa  88.6  9e-17  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.151741 
 
 
-
 
NC_002950  PG0982  TPR domain-containing protein  29.35 
 
 
750 aa  87.4  2e-16  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.682285 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2349  TPR repeat-containing protein  25.24 
 
 
649 aa  87.4  2e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0186841  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1476  TPR repeat-containing protein  26.11 
 
 
226 aa  86.7  3e-16  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.818932  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0540  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  24.34 
 
 
1056 aa  86.7  3e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0423513  normal  0.0609988 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1811  TPR repeat-containing protein  31.05 
 
 
523 aa  86.3  4e-16  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1947  tetratricopeptide TPR_2  31.58 
 
 
564 aa  85.9  5e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0106408 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2480  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  24.37 
 
 
1022 aa  84.3  0.000000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2328  TPR repeat-containing protein  30 
 
 
363 aa  85.1  0.000000000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.759887 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1449  tetratricopeptide TPR_2  26.92 
 
 
1067 aa  84.3  0.000000000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5131  TPR repeat-containing protein  26.96 
 
 
361 aa  84.3  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000131061 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1816  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.99 
 
 
174 aa  84.7  0.000000000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.706847  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3209  tetratricopeptide repeat-containing protein  27.17 
 
 
743 aa  84.3  0.000000000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2895  O-linked N-acetylglucosamine transferase  29.44 
 
 
292 aa  84  0.000000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0140366 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1841  TPR repeat-containing protein  29.06 
 
 
3035 aa  84.3  0.000000000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2318  TPR repeat-containing protein  27.18 
 
 
245 aa  84.3  0.000000000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2606  tetratricopeptide TPR_2  26.92 
 
 
643 aa  84  0.000000000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0641  TPR repeat-containing protein  29.28 
 
 
1094 aa  84  0.000000000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.230386  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0225  TPR repeat-containing protein  26.6 
 
 
414 aa  83.2  0.000000000000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1823  TPR repeat-containing protein  27.65 
 
 
213 aa  83.2  0.000000000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.510449  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0823  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.38 
 
 
296 aa  82.8  0.000000000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0401477 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0329  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.9 
 
 
297 aa  82.4  0.000000000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1840  TPR repeat-containing protein  30.77 
 
 
3560 aa  82.4  0.000000000000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6182  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  24.21 
 
 
1056 aa  82.4  0.000000000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7349  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  24.23 
 
 
988 aa  82.4  0.000000000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0738846  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0336  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.9 
 
 
297 aa  82.4  0.000000000000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1312  TPR repeat-containing protein  28.57 
 
 
1069 aa  82.4  0.000000000000006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.530092  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2904  TPR repeat-containing protein  26.98 
 
 
265 aa  82.4  0.000000000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000121078  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1653  TPR repeat-containing protein  29.9 
 
 
466 aa  81.6  0.000000000000009  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2403  tetratricopeptide TPR_4  27.75 
 
 
267 aa  81.6  0.000000000000009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000143988  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0319  TPR repeat-containing protein  25.23 
 
 
301 aa  81.6  0.00000000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0540059  normal  0.098872 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1518  TPR repeat-containing protein  26.15 
 
 
375 aa  81.6  0.00000000000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.946116  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28681  hypothetical protein  27.91 
 
 
539 aa  81.3  0.00000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.71597 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1793  TPR repeat-containing protein  32.65 
 
 
213 aa  80.9  0.00000000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013163  Cyan8802_4605  TPR repeat-containing protein  25.13 
 
 
279 aa  80.9  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0369  TPR repeat-containing protein  26.79 
 
 
446 aa  80.5  0.00000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0783  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.23 
 
 
542 aa  80.9  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3772  O-linked GlcNAc transferase  26.64 
 
 
269 aa  80.5  0.00000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0949  TPR repeat-containing protein  23.85 
 
 
1121 aa  80.1  0.00000000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0849269  normal  0.0980091 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1387  TPR repeat-containing protein  26.83 
 
 
333 aa  79  0.00000000000006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.316988  normal  0.93517 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1782  TPR repeat-containing protein  25.91 
 
 
467 aa  78.6  0.00000000000007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_12541  Tfp pilus assembly protein PilF  29.34 
 
 
442 aa  78.6  0.00000000000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.34619  hitchhiker  0.00140851 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_13031  TPR repeat-containing protein  24.38 
 
 
306 aa  78.6  0.00000000000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0823406 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  26.83 
 
 
810 aa  78.6  0.00000000000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4159  TPR repeat-containing protein  26.4 
 
 
467 aa  78.2  0.00000000000009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00004642 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2975  TPR repeat-containing protein  27.75 
 
 
716 aa  77.8  0.0000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2907  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.5 
 
 
471 aa  78.2  0.0000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0321  TPR repeat-containing protein  31.29 
 
 
162 aa  77.8  0.0000000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3199  TPR repeat-containing protein  26.29 
 
 
565 aa  77.8  0.0000000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.714786  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2942  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.69 
 
 
632 aa  77.8  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1773  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.38 
 
 
466 aa  77.4  0.0000000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1834  TPR repeat-containing protein  26.29 
 
 
593 aa  77  0.0000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>