59 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene A2cp1_2821 on replicon NC_011891
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011891  A2cp1_2821  O-antigen polymerase  100 
 
 
434 aa  827    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2726  O-antigen polymerase  99.08 
 
 
434 aa  819    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.136872  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2640  O-antigen polymerase  97.24 
 
 
434 aa  626  1e-178  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0149794  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2608  O-antigen polymerase  63.06 
 
 
432 aa  513  1e-144  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.212106  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3094  O-antigen polymerase  33.69 
 
 
444 aa  75.5  0.000000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2212  O-antigen polymerase  32.58 
 
 
415 aa  73.2  0.00000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0880149  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0297  hypothetical protein  29.9 
 
 
428 aa  72.4  0.00000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.515931  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2455  O-antigen polymerase  28.92 
 
 
435 aa  68.6  0.0000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0818595  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1955  O-antigen polymerase  27.05 
 
 
468 aa  66.2  0.000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.324728  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003538  putative membrane protein of ExoQ family involved in exopolysaccharide production  25.32 
 
 
454 aa  65.5  0.000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0301  O-antigen polymerase  23.31 
 
 
464 aa  65.5  0.000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2363  hypothetical protein  26.1 
 
 
431 aa  64.7  0.000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5004  O-antigen polymerase family protein  25.27 
 
 
436 aa  62  0.00000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2412  hypothetical protein  26.96 
 
 
444 aa  62  0.00000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0677  O-antigen polymerase  27.03 
 
 
436 aa  61.2  0.00000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.857845  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2694  O-antigen polymerase  31.25 
 
 
535 aa  59.3  0.0000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.247958  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0845  hypothetical protein  27.3 
 
 
537 aa  58.9  0.0000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.149779  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3579  O-antigen polymerase  23.69 
 
 
501 aa  57.8  0.0000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0119  O-antigen polymerase  28.93 
 
 
466 aa  57  0.0000006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02223  hypothetical protein  23.28 
 
 
461 aa  56.6  0.0000008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4116  O-antigen polymerase  30.1 
 
 
540 aa  55.1  0.000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0014553  hitchhiker  0.00000561153 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2018  O-antigen polymerase  28.76 
 
 
456 aa  54.7  0.000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2960  O-antigen polymerase  27.32 
 
 
436 aa  53.5  0.000007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.12688  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2530  wzy family polymerase, exosortase system type 1 associated  27.7 
 
 
463 aa  53.5  0.000008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.42287  normal  0.0601314 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0300  O-antigen polymerase  26.44 
 
 
446 aa  52.4  0.00001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3268  wzy family polymerase, exosortase system type 1 associated  24.72 
 
 
452 aa  52.4  0.00002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.869746  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2459  O-antigen polymerase  26.48 
 
 
437 aa  52  0.00002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0582  O-antigen polymerase  26.7 
 
 
454 aa  51.2  0.00004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.814347  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0069  O-antigen polymerase  29.27 
 
 
443 aa  50.4  0.00007  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0083  membrane protein  29.27 
 
 
443 aa  50.4  0.00007  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.735968  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02624  membrane protein  33.75 
 
 
431 aa  49.3  0.0001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0227  hypothetical protein  26.53 
 
 
460 aa  49.3  0.0001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.604472  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3103  O-antigen polymerase  31.76 
 
 
498 aa  49.7  0.0001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.313581  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3401  polysaccharide deacetylase  29.61 
 
 
464 aa  48.9  0.0002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.264275  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0152  hypothetical protein  24.74 
 
 
389 aa  48.9  0.0002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2523  O-antigen polymerase  26.83 
 
 
738 aa  47  0.0006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0830151  hitchhiker  0.00448531 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1940  O-antigen polymerase  33 
 
 
453 aa  47  0.0006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1682  hypothetical protein  22.84 
 
 
404 aa  47  0.0007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3061  O-antigen polymerase  28.08 
 
 
465 aa  46.6  0.0008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.433121  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1694  O-antigen polymerase  25 
 
 
446 aa  46.6  0.0008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.000414796  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0063  O-antigen polymerase  28.47 
 
 
531 aa  46.6  0.0008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0639643 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4577  O-antigen polymerase  25.65 
 
 
480 aa  46.6  0.0008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1468  secreted polysaccharide polymerase  22.84 
 
 
404 aa  46.2  0.001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00102355  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0765  O-antigen polymerase  31.19 
 
 
442 aa  46.6  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1614  hypothetical protein  22.84 
 
 
404 aa  46.2  0.001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.363158  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1650  hypothetical protein  25.33 
 
 
404 aa  46.2  0.001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.192586  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1496  hypothetical protein  22.84 
 
 
404 aa  46.2  0.001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.285071  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4110  O-antigen polymerase  29.3 
 
 
930 aa  45.8  0.002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3695  hypothetical protein  24.67 
 
 
404 aa  44.7  0.003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2327  O-antigen polymerase  25.26 
 
 
475 aa  44.3  0.004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1558  O-antigen polymerase  52.63 
 
 
472 aa  44.3  0.004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.238347  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3597  O-antigen polymerase  24.73 
 
 
438 aa  44.3  0.005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.312058 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4864  inorganic carbon transporter  28.27 
 
 
467 aa  43.5  0.006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.867776  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1310  hypothetical protein  26.96 
 
 
439 aa  43.9  0.006  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5389  O-antigen polymerase (wzy)  22.63 
 
 
405 aa  43.5  0.007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.933006  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3351  O-antigen polymerase  27.27 
 
 
444 aa  43.5  0.008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6554  O-antigen polymerase  28.78 
 
 
506 aa  43.5  0.008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.408434 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2813  O-antigen polymerase  24.08 
 
 
773 aa  43.5  0.008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.192356  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21831  hypothetical protein  32.61 
 
 
439 aa  43.5  0.008  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.285408 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>