70 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_0152 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007912  Sde_0152  hypothetical protein  100 
 
 		 389 aa  785    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2338  O-antigen polymerase  32.28 
 
 		 425 aa  126  8.000000000000001e-28  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0297  hypothetical protein  25.38 
 
 		 428 aa  78.6  0.0000000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.515931  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1955  O-antigen polymerase  26.8 
 
 		 468 aa  76.6  0.0000000000007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.324728  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2960  O-antigen polymerase  25.44 
 
 		 436 aa  75.5  0.000000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.12688  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003538  putative membrane protein of ExoQ family involved in exopolysaccharide production  28.35 
 
 		 454 aa  72.8  0.000000000009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2530  wzy family polymerase, exosortase system type 1 associated  25.86 
 
 		 463 aa  71.6  0.00000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.42287  normal  0.0601314 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2363  hypothetical protein  25.13 
 
 		 431 aa  72  0.00000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0119  O-antigen polymerase  24.34 
 
 		 466 aa  72  0.00000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0677  O-antigen polymerase  25.2 
 
 		 436 aa  71.6  0.00000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.857845  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0301  O-antigen polymerase  26.22 
 
 		 464 aa  71.2  0.00000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02223  hypothetical protein  28.79 
 
 		 461 aa  70.5  0.00000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2412  hypothetical protein  26.44 
 
 		 444 aa  70.5  0.00000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1788  O-antigen polymerase  26.99 
 
 		 446 aa  68.6  0.0000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5004  O-antigen polymerase family protein  26.69 
 
 		 436 aa  67.8  0.0000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0300  O-antigen polymerase  23.64 
 
 		 446 aa  67.8  0.0000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2459  O-antigen polymerase  26.89 
 
 		 437 aa  67.4  0.0000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3094  O-antigen polymerase  23.58 
 
 		 444 aa  59.3  0.0000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18850  O-antigen polymerase  25.77 
 
 		 393 aa  58.5  0.0000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4116  O-antigen polymerase  27.27 
 
 		 540 aa  57  0.0000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0014553  hitchhiker  0.00000561153 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0582  O-antigen polymerase  25.4 
 
 		 454 aa  57  0.0000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.814347  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2375  O-antigen polymerase  30.57 
 
 		 500 aa  56.2  0.0000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1639  hypothetical protein  26.37 
 
 		 447 aa  55.8  0.000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2212  O-antigen polymerase  23.47 
 
 		 415 aa  55.5  0.000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0880149  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1558  O-antigen polymerase  23.28 
 
 		 472 aa  54.7  0.000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.238347  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3401  polysaccharide deacetylase  23.63 
 
 		 464 aa  54.3  0.000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.264275  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0227  hypothetical protein  23.08 
 
 		 460 aa  53.9  0.000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.604472  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3695  hypothetical protein  28.32 
 
 		 404 aa  53.5  0.000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1650  hypothetical protein  27.75 
 
 		 404 aa  52.4  0.00001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.192586  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01295  secreted polysaccharide polymerase  21.81 
 
 		 385 aa  52.8  0.00001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1691  O-antigen polymerase  27.95 
 
 		 512 aa  52.8  0.00001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.121195  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2384  O-antigen polymerase  23.29 
 
 		 436 aa  52  0.00002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.486663  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3103  O-antigen polymerase  26.88 
 
 		 498 aa  51.2  0.00003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.313581  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3268  wzy family polymerase, exosortase system type 1 associated  20.93 
 
 		 452 aa  50.8  0.00004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.869746  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1954  hypothetical protein  27.35 
 
 		 443 aa  50.4  0.00006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1682  hypothetical protein  27.27 
 
 		 404 aa  50.1  0.00006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1468  secreted polysaccharide polymerase  27.27 
 
 		 404 aa  50.1  0.00006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00102355  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1614  hypothetical protein  27.27 
 
 		 404 aa  50.4  0.00006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.363158  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1496  hypothetical protein  27.27 
 
 		 404 aa  50.4  0.00006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.285071  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1184  O-antigen polymerase  25 
 
 		 412 aa  50.1  0.00007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2018  O-antigen polymerase  22.27 
 
 		 456 aa  49.3  0.0001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1087  O-antigen polymerase  25.71 
 
 		 612 aa  49.3  0.0001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3288  O-antigen polymerase  34.41 
 
 		 594 aa  48.1  0.0003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.709506  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4820  O-antigen polymerase  22.14 
 
 		 487 aa  47.8  0.0004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.53889  normal  0.786094 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3061  O-antigen polymerase  28.97 
 
 		 465 aa  47.4  0.0005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.433121  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0678  hypothetical protein  25.34 
 
 		 594 aa  46.2  0.0009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.206131 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4363  hypothetical protein  27.59 
 
 		 420 aa  46.2  0.0009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2501  O-antigen polymerase  29.47 
 
 		 784 aa  46.2  0.001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3113  O-antigen polymerase  26.5 
 
 		 467 aa  45.8  0.001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.000000000265772  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4864  inorganic carbon transporter  25.44 
 
 		 467 aa  45.8  0.001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.867776  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3885  O-antigen polymerase  25.68 
 
 		 443 aa  45.8  0.001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.722344  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3018  O-antigen polymerase  27.27 
 
 		 446 aa  45.8  0.001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0657  O-antigen polymerase  31 
 
 		 588 aa  45.1  0.002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0056678  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3179  O-antigen polymerase  22.44 
 
 		 453 aa  45.1  0.002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.579286  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2638  O-antigen polymerase  24.67 
 
 		 428 aa  45.1  0.002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1654  O-antigen polymerase  28.57 
 
 		 754 aa  45.4  0.002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2327  O-antigen polymerase  25.79 
 
 		 475 aa  44.7  0.003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4227  O-antigen polymerase  27.51 
 
 		 457 aa  44.3  0.004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2455  O-antigen polymerase  27.7 
 
 		 435 aa  44.3  0.004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0818595  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5249  O-antigen polymerase  28.4 
 
 		 671 aa  44.3  0.004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.566036  normal  0.80633 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4286  inorganic carbon transporter  27.51 
 
 		 457 aa  44.3  0.004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.816665  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1511  O-antigen polymerase  29.55 
 
 		 436 aa  43.5  0.006  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.995807  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0822  inorganic carbon transporter  25.13 
 
 		 471 aa  43.5  0.007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.999427  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0392  O-antigen polymerase  23.78 
 
 		 398 aa  43.5  0.007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.000178586  normal  0.74185 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0242  hypothetical protein  23.2 
 
 		 586 aa  43.5  0.007  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0427625  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3579  O-antigen polymerase  27.22 
 
 		 501 aa  43.1  0.008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2516  O-antigen polymerase  27.67 
 
 		 686 aa  43.1  0.008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.549504  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2896  O-antigen polymerase family protein  27.67 
 
 		 686 aa  43.1  0.008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3726  O-antigen polymerase  25.82 
 
 		 438 aa  42.7  0.01  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.114038 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2177  EXOQ family/lipid A core O-antigen ligase  24.62 
 
 		 495 aa  42.7  0.01  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.42634  normal  0.835874 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>