24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_0765 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011729  PCC7424_0765  O-antigen polymerase  100 
 
 
442 aa  869    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4577  O-antigen polymerase  43.8 
 
 
480 aa  355  6.999999999999999e-97  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3597  O-antigen polymerase  44.88 
 
 
438 aa  347  2e-94  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.312058 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1314  O-antigen polymerase  48.79 
 
 
418 aa  344  2e-93  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.963126 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1285  O-antigen polymerase  48.54 
 
 
418 aa  341  1e-92  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3351  O-antigen polymerase  42.3 
 
 
444 aa  320  5e-86  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0134  hypothetical protein  34.88 
 
 
435 aa  161  2e-38  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.74095  normal  0.279508 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1310  hypothetical protein  30.57 
 
 
439 aa  150  4e-35  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21831  hypothetical protein  30.04 
 
 
439 aa  149  9e-35  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.285408 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_30011  hypothetical protein  29.43 
 
 
437 aa  134  3e-30  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.562127 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_18371  hypothetical protein  30.13 
 
 
443 aa  129  1.0000000000000001e-28  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2299  hypothetical protein  29.72 
 
 
424 aa  127  3e-28  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.590409  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4213  O-antigen polymerase  30.59 
 
 
430 aa  108  2e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.144935  normal  0.568033 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2670  hypothetical protein  26.73 
 
 
425 aa  102  2e-20  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.131305  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_13891  hypothetical protein  24.86 
 
 
416 aa  68.2  0.0000000003  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0456  hypothetical protein  25 
 
 
438 aa  57  0.0000007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_13971  hypothetical protein  22.72 
 
 
422 aa  55.1  0.000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1297  hypothetical protein  23.9 
 
 
444 aa  48.5  0.0002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.289978  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0063  O-antigen polymerase  36.26 
 
 
531 aa  48.1  0.0003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0639643 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0142  O-antigen polymerase  26.01 
 
 
496 aa  47.8  0.0004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0300218 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2608  O-antigen polymerase  31.73 
 
 
432 aa  47  0.0007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.212106  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2821  O-antigen polymerase  31.13 
 
 
434 aa  46.2  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3018  O-antigen polymerase  35.48 
 
 
446 aa  45.4  0.002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1694  O-antigen polymerase  31.46 
 
 
446 aa  43.9  0.006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.000414796  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>