12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Csal_1694 on replicon NC_007963
Organism: Chromohalobacter salexigens DSM 3043



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007963  Csal_1694  O-antigen polymerase  100 
 
 
446 aa  876    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.000414796  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0843  O-antigen polymerase  32.54 
 
 
440 aa  264  3e-69  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.475178  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3774  O-antigen polymerase  24.5 
 
 
439 aa  55.8  0.000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0319  O-antigen polymerase  27.06 
 
 
422 aa  53.5  0.000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1374  O-antigen polymerase  30 
 
 
426 aa  52.4  0.00002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.247054  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6494  O-antigen polymerase  26.49 
 
 
424 aa  49.3  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2712  O-antigen polymerase  25.26 
 
 
413 aa  47.4  0.0006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0646679  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0206  O-antigen polymerase  35.21 
 
 
444 aa  45.8  0.001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6004  O-antigen polymerase  27.33 
 
 
424 aa  45.8  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.881514  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1297  hypothetical protein  31.08 
 
 
444 aa  45.1  0.003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.289978  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2401  O-antigen polymerase  26.78 
 
 
426 aa  45.1  0.003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0523174  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0765  O-antigen polymerase  31.46 
 
 
442 aa  43.9  0.006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>