47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A3094 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007643  Rru_A3094  O-antigen polymerase  100 
 
 		 444 aa  873    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0297  hypothetical protein  42.05 
 
 		 428 aa  354  2e-96  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.515931  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0300  O-antigen polymerase  42.11 
 
 		 446 aa  334  2e-90  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0677  O-antigen polymerase  43.07 
 
 		 436 aa  320  3e-86  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.857845  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2412  hypothetical protein  39.24 
 
 		 444 aa  289  6e-77  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3268  wzy family polymerase, exosortase system type 1 associated  38.83 
 
 		 452 aa  287  2e-76  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.869746  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1955  O-antigen polymerase  38.17 
 
 		 468 aa  278  2e-73  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.324728  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2960  O-antigen polymerase  41.49 
 
 		 436 aa  276  5e-73  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.12688  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0582  O-antigen polymerase  37.41 
 
 		 454 aa  265  1e-69  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.814347  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2530  wzy family polymerase, exosortase system type 1 associated  32.75 
 
 		 463 aa  231  2e-59  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.42287  normal  0.0601314 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1558  O-antigen polymerase  35.33 
 
 		 472 aa  223  4.9999999999999996e-57  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.238347  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0119  O-antigen polymerase  31.25 
 
 		 466 aa  199  9e-50  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4820  O-antigen polymerase  27.13 
 
 		 487 aa  127  4.0000000000000003e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.53889  normal  0.786094 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0227  hypothetical protein  24.84 
 
 		 460 aa  119  9.999999999999999e-26  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.604472  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3179  O-antigen polymerase  27.32 
 
 		 453 aa  111  3e-23  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.579286  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2363  hypothetical protein  28.72 
 
 		 431 aa  90.9  4e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2455  O-antigen polymerase  24.07 
 
 		 435 aa  87.4  5e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0818595  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003538  putative membrane protein of ExoQ family involved in exopolysaccharide production  30.09 
 
 		 454 aa  83.2  0.000000000000009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02223  hypothetical protein  28.57 
 
 		 461 aa  81.6  0.00000000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0301  O-antigen polymerase  31.98 
 
 		 464 aa  73.2  0.000000000008  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1788  O-antigen polymerase  24.19 
 
 		 446 aa  65.5  0.000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1639  hypothetical protein  27.13 
 
 		 447 aa  64.7  0.000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0152  hypothetical protein  23.12 
 
 		 389 aa  63.2  0.000000009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2608  O-antigen polymerase  29.94 
 
 		 432 aa  62.8  0.00000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.212106  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01295  secreted polysaccharide polymerase  25.31 
 
 		 385 aa  60.5  0.00000006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2459  O-antigen polymerase  24.63 
 
 		 437 aa  59.3  0.0000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2821  O-antigen polymerase  38.18 
 
 		 434 aa  58.9  0.0000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0845  hypothetical protein  23.78 
 
 		 537 aa  58.5  0.0000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.149779  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3401  polysaccharide deacetylase  28.23 
 
 		 464 aa  55.5  0.000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.264275  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3579  O-antigen polymerase  26.28 
 
 		 501 aa  53.9  0.000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3103  O-antigen polymerase  30.81 
 
 		 498 aa  52.8  0.00001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.313581  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2640  O-antigen polymerase  36.67 
 
 		 434 aa  53.1  0.00001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0149794  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2384  O-antigen polymerase  27.04 
 
 		 436 aa  50.8  0.00004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.486663  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2726  O-antigen polymerase  36.14 
 
 		 434 aa  48.1  0.0003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.136872  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1497  O-antigen polymerase  27.18 
 
 		 672 aa  47.8  0.0004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3696  O-antigen polymerase  24.8 
 
 		 461 aa  47.4  0.0006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.312837 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1184  O-antigen polymerase  25.76 
 
 		 412 aa  46.6  0.0008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18850  O-antigen polymerase  27.81 
 
 		 393 aa  45.8  0.001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0850  hypothetical protein  28.33 
 
 		 426 aa  45.8  0.001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0783552 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4116  O-antigen polymerase  26.74 
 
 		 540 aa  46.6  0.001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0014553  hitchhiker  0.00000561153 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5249  O-antigen polymerase  30.64 
 
 		 671 aa  46.2  0.001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.566036  normal  0.80633 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0364  O-antigen polymerase  26.98 
 
 		 428 aa  46.6  0.001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2212  O-antigen polymerase  25.68 
 
 		 415 aa  45.1  0.002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0880149  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2338  O-antigen polymerase  22.79 
 
 		 425 aa  45.1  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3077  O-antigen polymerase  28.76 
 
 		 504 aa  45.1  0.003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4864  inorganic carbon transporter  25.91 
 
 		 467 aa  44.3  0.004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.867776  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0634  O-antigen polymerase  27.45 
 
 		 415 aa  44.3  0.004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.60095 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>