52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_3696 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008312  Tery_3696  O-antigen polymerase  100 
 
 
461 aa  908    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.312837 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4957  O-antigen polymerase  60.04 
 
 
470 aa  545  1e-154  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0822  inorganic carbon transporter  57.14 
 
 
471 aa  511  1e-143  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.999427  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4227  O-antigen polymerase  57.02 
 
 
457 aa  504  1e-141  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4286  inorganic carbon transporter  57.02 
 
 
457 aa  504  1e-141  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.816665  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2327  O-antigen polymerase  57.8 
 
 
475 aa  501  1e-140  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4864  inorganic carbon transporter  53.52 
 
 
467 aa  459  9.999999999999999e-129  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.867776  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0357  inorganic carbon transporter  50.33 
 
 
467 aa  422  1e-117  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.152421  normal  0.510876 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24401  bicarbonate transporter, ICT family protein  40.95 
 
 
436 aa  236  9e-61  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0279  bicarbonate transporter  40.31 
 
 
438 aa  235  1.0000000000000001e-60  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2065  bicarbonate transporter  36.14 
 
 
438 aa  208  2e-52  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0714  O-antigen polymerase  31.87 
 
 
781 aa  166  6.9999999999999995e-40  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1088  O-antigen polymerase  25 
 
 
737 aa  93.2  8e-18  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1822  O-antigen polymerase  25.84 
 
 
461 aa  90.9  5e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.831736  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2694  O-antigen polymerase  23.45 
 
 
532 aa  89  2e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00327343  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0142  O-antigen polymerase  24.53 
 
 
496 aa  82.4  0.00000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0300218 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4116  O-antigen polymerase  29.21 
 
 
540 aa  80.9  0.00000000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0014553  hitchhiker  0.00000561153 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2384  O-antigen polymerase  26.44 
 
 
436 aa  81.3  0.00000000000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.486663  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0103  O-antigen polymerase  24.21 
 
 
492 aa  72  0.00000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2933  O-antigen polymerase  31.11 
 
 
458 aa  64.3  0.000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000205816  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4434  O-antigen polymerase  24.84 
 
 
474 aa  64.7  0.000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2722  O-antigen polymerase  26.99 
 
 
497 aa  62.4  0.00000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.616494  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0297  hypothetical protein  25.74 
 
 
428 aa  61.2  0.00000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.515931  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2813  O-antigen polymerase  24.24 
 
 
773 aa  59.7  0.0000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.192356  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4110  O-antigen polymerase  27.95 
 
 
930 aa  59.3  0.0000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1184  O-antigen polymerase  26.74 
 
 
412 aa  58.9  0.0000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18850  O-antigen polymerase  27.03 
 
 
393 aa  54.7  0.000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1955  O-antigen polymerase  23.51 
 
 
468 aa  53.5  0.000007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.324728  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3580  O-antigen polymerase  27.2 
 
 
504 aa  52.8  0.00001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2299  hypothetical protein  24.91 
 
 
424 aa  53.1  0.00001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.590409  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1087  O-antigen polymerase  25 
 
 
612 aa  52  0.00002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3113  O-antigen polymerase  23.77 
 
 
467 aa  51.6  0.00003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.000000000265772  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4268  O-antigen polymerase  28.08 
 
 
503 aa  51.6  0.00003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.209068 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2975  O-antigen polymerase  27.63 
 
 
549 aa  50.8  0.00005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.024758  decreased coverage  0.00000748304 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1869  O-antigen polymerase  23.38 
 
 
459 aa  50.8  0.00005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0119  O-antigen polymerase  24.71 
 
 
466 aa  50.8  0.00006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0508  O-antigen polymerase  31.62 
 
 
440 aa  50.8  0.00006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0083  membrane protein  31.07 
 
 
443 aa  49.7  0.0001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.735968  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0069  O-antigen polymerase  27.56 
 
 
443 aa  48.5  0.0002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0634  O-antigen polymerase  26.89 
 
 
415 aa  48.5  0.0003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.60095 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1362  O-antigen polymerase  20.6 
 
 
425 aa  47.4  0.0006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.185241  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2403  O-antigen polymerase  24.74 
 
 
509 aa  45.4  0.002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.166063  normal  0.151725 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3152  O-antigen polymerase  27.49 
 
 
546 aa  45.8  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02624  membrane protein  31.48 
 
 
431 aa  45.8  0.002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3309  hypothetical protein  29.25 
 
 
471 aa  44.7  0.003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.110006  normal  0.406179 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2177  EXOQ family/lipid A core O-antigen ligase  24.85 
 
 
495 aa  45.1  0.003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.42634  normal  0.835874 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3094  O-antigen polymerase  24.32 
 
 
444 aa  44.7  0.004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003538  putative membrane protein of ExoQ family involved in exopolysaccharide production  26.02 
 
 
454 aa  44.3  0.004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0654  O-antigen polymerase  23.13 
 
 
480 aa  44.7  0.004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00317709 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1384  TPR repeat-containing protein  22.9 
 
 
870 aa  44.3  0.005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.00000149301  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2009  O-antigen polymerase  21.63 
 
 
459 aa  43.9  0.006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1436  O-antigen polymerase  26.5 
 
 
404 aa  43.1  0.01  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>